bioapi-build.patch

   1 http://code.google.com/p/bioapi-linux/issues/detail?id=4
   2
   3 --- a/addins/pwbsp/Makefile.in
   4 +++ b/addins/pwbsp/Makefile.in
   5 @@ -87,7 +87,7 @@ CC = @CC@
   6  CCDEPMODE = @CCDEPMODE@
   7  CFLAGS = @CFLAGS@
   8  CPP = @CPP@
   9 -CPPFLAGS = -I${top_srcdir}/include/ \
  10 +AM_CPPFLAGS = -I${top_srcdir}/include/ \
  11                 -I${top_srcdir}/imports/cdsa/v2_0/inc/
  12
  13  CXX = @CXX@
  14 @@ -111,7 +111,7 @@ INSTALL_DATA = @INSTALL_DATA@
  15  INSTALL_PROGRAM = @INSTALL_PROGRAM@
  16  INSTALL_SCRIPT = @INSTALL_SCRIPT@
  17  INSTALL_STRIP_PROGRAM = @INSTALL_STRIP_PROGRAM@
  18 -LDFLAGS = -Wl,--version-script=${srcdir}/libpwbsp.ver
  19 +AM_LDFLAGS = -Wl,--version-script=${srcdir}/libpwbsp.ver
  20  LEX = @LEX@
  21  LEXLIB = @LEXLIB@
  22  LEX_OUTPUT_ROOT = @LEX_OUTPUT_ROOT@
  23 --- a/addins/qtpwbsp/Makefile.in
  24 +++ b/addins/qtpwbsp/Makefile.in
  25 @@ -96,7 +96,7 @@ CC = @CC@
  26  CCDEPMODE = @CCDEPMODE@
  27  CFLAGS = @CFLAGS@
  28  CPP = @CPP@
  29 -CPPFLAGS = -I${top_srcdir}/include \
  30 +AM_CPPFLAGS = -I${top_srcdir}/include \
  31                 -I${top_srcdir}/imports/cdsa/v2_0/inc \
  32                 ${QT_CXXFLAGS}
  33
  34 @@ -121,7 +121,7 @@ INSTALL_DATA = @INSTALL_DATA@
  35  INSTALL_PROGRAM = @INSTALL_PROGRAM@
  36  INSTALL_SCRIPT = @INSTALL_SCRIPT@
  37  INSTALL_STRIP_PROGRAM = @INSTALL_STRIP_PROGRAM@
  38 -LDFLAGS = -Wl,--version-script=${srcdir}/libqtpwbsp.ver \
  39 +AM_LDFLAGS = -Wl,--version-script=${srcdir}/libqtpwbsp.ver \
  40                 ${QT_LIBS}
  41
  42  LEX = @LEX@