R.spec

   1 #
   2 # Conditional build:
   3 # _without_gnome        - without GNOME support
   4 #
   5 Summary:        A language for data analysis and graphics
   6 Summary(pl):    Jêzyk do analizy danych oraz grafiki
   7 Name:           R
   8 Version:        1.8.0
   9 Release:        2
  10 License:        Mixed (distributable), mostly GPL
  11 Group:          Development/Languages
  12 # CRAN master site: ftp://cran.r-project.org/pub/R/src/
  13 Source0:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
  14 # Source0-md5:  bb019d7e12e38ac8a8bc247f06cc6b42
  15 Source1:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/KernSmooth_2.22-12.tar.gz
  16 # Source1-md5:  11be129834df04aa85818dad52910695
  17 Source2:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/VR_7.1-11.tar.gz
  18 # Source2-md5:  75e444a513e1e726497451485ca9aa86
  19 Source3:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.3-2.tar.gz
  20 # Source3-md5:  334452ea1a1ba351154aea9c4eb9912d
  21 Source4:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/boot_1.2-15.tar.gz
  22 # Source4-md5:  930940da4c44258d723e90168b143d1f
  23 Source5:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-12.tar.gz
  24 # Source5-md5:  6860c7d62ab95756267be774bcf60578
  25 Source6:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/cluster_1.7.6.tar.gz
  26 # Source6-md5:  382e2363ee8a5dd653e4d82e63779119
  27 Source7:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-16.tar.gz
  28 # Source7-md5:  ca4ad419fc541ae2d287f8224e1cae9e
  29 Source8:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_1.3-13.tar.gz
  30 # Source8-md5:  4cb16ec571dfd26337c4d566a2898a39
  31 Source9:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/foreign_0.6-3.tar.gz
  32 # Source9-md5:  13f982b0e4aa2d48da837c956826e174
  33 Source10:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-9.tar.gz
  34 # Source10-md5: 63ccdfac75f807cc71b49d4283fdf81e
  35 Source11:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-10.tar.gz
  36 # Source11-md5: 7f32a7f7b022dd366d27482a3561d2a6
  37 Source12:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/grid_0.7-1.tar.gz
  38 # Source12-md5: 01cfb0d1c1fa134bb05b2844572edf8e
  39 Source13:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/lattice_0.8-7.tar.gz
  40 # Source13-md5: c9b8f83ed7c1cdfbbc1d9aec545150ce
  41 Source14:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.6.tar.gz
  42 # Source14-md5: 571be13c4ad944b1087727b7992ac3c1
  43 Source15:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mgcv_0.9-6.tar.gz
  44 # Source15-md5: 00dbd822c26680cc6be84367300437e4
  45 Source16:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.5-10.tar.gz
  46 # Source16-md5: e3ab15bed59ec49fcfc0a4a3d47f12fb
  47 Source17:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nlme_3.1-45.tar.gz
  48 # Source17-md5: 6d3ebd4c740b2d6a0828cace2c48342b
  49 Source18:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-7.tar.gz
  50 # Source18-md5: d5e8622a6e31dc395666037fd32258fe
  51 Source19:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-11.tar.gz
  52 # Source19-md5: 4714e280ecb678ee618a656eb69d6b22
  53 Source20:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/princurve_1.1-5.tar.gz
  54 # Source20-md5: d0092745f92687c54b055e2770fd6e5b
  55 Source21:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-6.tar.gz
  56 # Source21-md5: 2289360d0066341ec79a5ff1371b7ec0
  57 Source22:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rpart_3.1-13.tar.gz
  58 # Source22-md5: 6b417adf2803c1239da6d5c457564416
  59 Source23:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival_2.9-15.tar.gz
  60 # Source23-md5: 88d086feec43c5a78f65c52eccd54713
  61 Source24:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-10.tar.gz
  62 # Source24-md5: 1319f1efed55d79add90a5bd65bb32ca
  63 Source25:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/Archive/integrate_2.2-3.tar.gz
  64 # Source25-md5: 40cc14374a0992871dd651d41289b3e6
  65 Source26:       %{name}.desktop
  66 URL:            http://www.r-project.org/
  67 BuildRequires:  autoconf
  68 BuildRequires:  automake
  69 BuildRequires:  libstdc++-devel
  70 BuildRequires:  gcc-c++
  71 BuildRequires:  gcc-g77
  72 BuildRequires:  perl >= 5.004
  73 BuildRequires:  libtool
  74 BuildRequires:  tetex-latex
  75 BuildRequires:  tetex-dvips
  76 BuildRequires:  tetex-pdftex
  77 BuildRequires:  zip
  78 BuildRequires:  XFree86-devel
  79 BuildRequires:  blas-devel
  80 BuildRequires:  libpng-devel >= 1.0.5
  81 BuildRequires:  libjpeg-devel >= 6b
  82 BuildRequires:  libxml-devel
  83 BuildRequires:  zlib >= 1.1.3
  84 BuildRequires:  readline-devel
  85 #BuildRequires: lpr
  86 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       gnome-libs-devel}
  87 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       ORBit-devel}
  88 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       libglade-gnome-devel}
  89 Provides:       R-base
  90 Provides:       R-contrib
  91 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  92
  93 %description
  94 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  95 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  96 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  97 script files.
  98
  99 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
 100 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
 101 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
 102 implementation and semantics are derived from Scheme.
 103
 104 %description -l pl
 105 System do obliczeñ statystycznych i grafiki. R sk³ada siê z jêzyka
 106 oraz ¶rodowiska uruchomieniowego z grafik±, debuggerem, dostêpem do
 107 niektórych funkcji systemowych oraz mo¿liwo¶ci± uruchamiania programów
 108 zapisanych w skryptach.
 109
 110 Jêzyk R by³ zainspirowany dwoma istniej±cymi jêzykami: S (Beckera,
 111 Chambersa i Wilksa) oraz Scheme (Sussmana). R jest podobny do S, ale
 112 implementacja i semantyka wywodzi siê ze Scheme.
 113
 114 %package base
 115 Summary:        The R base distribution
 116 Summary(pl):    Podstawowa dystrybucja R
 117 License:        GPL v2 / LGPL
 118 Group:          Development/Languages
 119 Requires(post): textutils
 120 Requires(post): perl
 121 Provides:       R-ctest R-eda R-lqs R-methods R-modreg R-mva R-nls R-splines
 122 Provides:       R-stepfun R-tcltk R-tools R-ts
 123
 124 %description base
 125 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
 126 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
 127 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
 128 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
 129 familiar and a good deal of S software will run without change under
 130 R.
 131
 132 %description base -l pl
 133 R jest jêzykiem i ¶rodowiskiem uruchomieniowym do interaktywnej
 134 analizy danych statystycznych. R nie jest ca³kowicie zgodny z jêzykiem
 135 S opracowanym w AT&T Bell Laboratiories (a teraz Lucent Technologies),
 136 mimo to u¿ytkownicy S zauwa¿± zbli¿one ¶rodowisko, a du¿a czê¶æ
 137 oprogramowania w S bêdzie dzia³a³a bez zmian w R.
 138
 139 %package recommended
 140 Summary:        Recommended contributed packages for the R language
 141 Summary(pl):    Zalecane dodatkowe pakiety do jêzyka R
 142 Group:          Development/Languages
 143 Provides:       R-KernSmooth R-VR R-boot R-cluster R-foreign R-grid
 144 Provides:       R-lattice R-mgcv R-nlme R-rpart R-survival
 145 License:        GPL, free or free for non-commercial use
 146 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 147 Requires(post,postun):  R-base
 148 Requires(post,postun):  textutils
 149 Requires(post,postun):  perl
 150 Requires:       R-base >= %{version}
 151 Obsoletes:      R-survival4 R-MASS R-clus R-class R-nnet R-spatial
 152
 153 %description recommended
 154 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 155 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 156
 157 %description recommended -l pl
 158 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 159 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 160
 161 %package contrib
 162 Summary:        Contributed packages for the R language
 163 Summary(pl):    Dodatkowe pakiety do jêzyka R
 164 License:        Mixed
 165 Group:          Development/Languages
 166 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 167 Requires(post,postun):  R-base
 168 Requires(post,postun):  textutils
 169 Requires(post,postun):  perl
 170 Requires:       R-base >= %{version}
 171 Requires:       R-VR
 172 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-date R-e1071 R-fracdiff R-gee
 173 Provides:       R-integrate R-leaps R-oz R-polynom R-princurve R-quadprog
 174 Provides:       R-xgobi
 175 Obsoletes:      R-principal.curve
 176
 177 %description contrib
 178 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 179 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 180
 181 %description contrib -l pl
 182 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 183 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 184
 185 %package mlbench
 186 Summary:        Machine learning benchmarks
 187 Summary(pl):    Testy wydajno¶ci uczenia maszyny
 188 Group:          Development/Languages
 189 License:        GPL
 190 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 191 Requires(post,postun):  R-base
 192 Requires(post,postun):  textutils
 193 Requires(post,postun):  perl
 194 Requires:       R-base >= %{version}
 195
 196 %description mlbench
 197 R package which contains a collection of real-world datasets and
 198 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 199 machine learning methods.
 200
 201 %description mlbench -l pl
 202 Ten podpakiet R zawiera zestaw rzeczywistych danych i funkcji do
 203 tworzenia sztucznych danych s³u¿±cych jako test wydajno¶ci metod
 204 uczenia maszyny.
 205
 206 %prep
 207 %setup -q -c -n R-cran -T -b 1
 208 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 2
 209 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 210 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 211 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 212 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 213 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 214 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 215 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 216 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 217 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 218 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 219 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 220 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 221 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 222 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 223 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 224 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 225 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 226 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 227 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 228 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 229 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 230 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 231 #%%setup -q -c -n R-cran -T -D -b 25
 232 %setup -q
 233 #%setup -q -T -D -a 14
 234
 235 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 236 # We need to remove them to avoid dependency problems
 237 rm -f ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 238
 239 %build
 240 %{__aclocal}
 241 %{__autoconf}
 242 cp -f /usr/share/automake/config.* .
 243 %configure \
 244         %{!?_without_gnome:--with-gnome} \
 245         %{?_without_gnome:--without-gnome} \
 246         --without-tcltk
 247
 248 %{__make}
 249 %{__make} help
 250 %{__make} html
 251 %{__make} clean
 252
 253 # Install contrib packages
 254 #
 255 R_HOME=`pwd`;export R_HOME
 256 PERL5LIB=`pwd`/share/perl;export PERL5LIB
 257 cd ../R-cran
 258 for pkg in `ls`
 259 do
 260 ${R_HOME}/bin/INSTALL ${pkg}
 261 done
 262 cd ${R_HOME}
 263
 264 #Remove old template files.
 265 #
 266 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 267 do
 268         mv ${oldinfile} ${oldinfile}.old
 269 #       rm ${oldinfile}
 270 done
 271
 272 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 273 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 274 # documentation, and copy it.
 275 #
 276 mkdir ${R_HOME}/contrib
 277 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 278 for pkg in `ls`; do
 279         if [ -d ${pkg} ]; then
 280                 mkdir ${R_HOME}/${pkg}
 281                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 282                         case $docfile in
 283                                 INDEX) ;;
 284                                 TITLE) ;;
 285                                 R) ;;
 286                                 man) ;;
 287                                 src) ;;
 288                                 src-c) ;;
 289                                 data) ;;
 290                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${R_HOME};;
 291                         esac
 292                 done
 293         fi
 294 done
 295 cd ${R_HOME}
 296
 297 %install
 298 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 299 install -d $RPM_BUILD_ROOT{%{_bindir},%{_mandir}/man1,%{_libdir}/R,%{_applnkdir}/Scientific/Numerics}
 300
 301 install %{SOURCE26} $RPM_BUILD_ROOT%{_applnkdir}/Scientific/Numerics/%{name}.desktop
 302
 303 mv doc/R.1 $RPM_BUILD_ROOT%{_mandir}/man1/
 304 sed "s,`pwd`,%{_libdir}/R,g" < bin/R > bin/R. ; mv bin/R. bin/R
 305 mv bin/R $RPM_BUILD_ROOT%{_bindir}/R
 306
 307 find . -name 'Makefile*' -exec rm -f {} \;
 308 rm -rf etc/*.old
 309
 310 cp -R AUTHORS afm bin doc etc include library modules share \
 311         $RPM_BUILD_ROOT%{_libdir}/R
 312
 313 %clean
 314 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 315
 316 %post base
 317 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 318  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 319
 320 #%preun base
 321 ## These files are not owned by any package, so we have to remove them
 322 ## but only if this is the last version of R-base on the system.
 323 ##
 324 #if [ "$1" = 0 ];
 325 #then
 326 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 327 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 328 #fi
 329
 330 %post contrib
 331 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 332  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 333
 334 %postun contrib
 335 if [ -f ../bin/Rcmd ];then
 336 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 337  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 338 fi
 339
 340 %post recommended
 341 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 342  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 343
 344 %postun recommended
 345 if [ -f ../bin/Rcmd ];then
 346 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 347  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 348 fi
 349
 350 %post mlbench
 351 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 352  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 353
 354 %postun mlbench
 355 if [ -f ../bin/Rcmd ];then
 356 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 357  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 358 fi
 359
 360 %files base
 361 %defattr(644,root,root,755)
 362 %{_mandir}/man1/R.1*
 363 %attr(755,root,root) %{_bindir}/R
 364 %dir %{_libdir}/R
 365 %{_libdir}/R/afm
 366 %attr(755,root,root) %{_libdir}/R/bin
 367 %{_libdir}/R/etc
 368 %{_libdir}/R/include
 369 %{_libdir}/R/share
 370 %{_libdir}/R/AUTHORS
 371 %dir %{_libdir}/R/library
 372 %{_libdir}/R/library/*.css
 373 %{_libdir}/R/library/base
 374 %{_libdir}/R/library/ctest
 375 %{_libdir}/R/library/eda
 376 %{_libdir}/R/library/lqs
 377 %{_libdir}/R/library/methods
 378 %{_libdir}/R/library/modreg
 379 %{_libdir}/R/library/mva
 380 %{_libdir}/R/library/nls
 381 %{_libdir}/R/library/splines
 382 %{_libdir}/R/library/stepfun
 383 %{_libdir}/R/library/tcltk
 384 %{_libdir}/R/library/tools
 385 %{_libdir}/R/library/ts
 386 %{_libdir}/R/modules
 387 %doc BUGS COPYRIGHTS FAQ NEWS README RESOURCES THANKS Y2K
 388 # %{_libdir}/R/doc %except %{_libdir}/R/doc/html/{packages.html,search/index.txt}
 389 %dir %{_libdir}/R/doc
 390 %{_libdir}/R/doc/[KRm]*
 391 %dir %{_libdir}/R/doc/html
 392 %{_libdir}/R/doc/html/*.css
 393 %{_libdir}/R/doc/html/[Ra-lr-u]*.html
 394 %{_libdir}/R/doc/html/packages-head.html
 395 %{_libdir}/R/doc/html/*.jpg
 396 %dir %{_libdir}/R/doc/html/search
 397 %{_libdir}/R/doc/html/search/[A-Z]*
 398 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 399 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 400 %{_applnkdir}/Scientific/Numerics/*
 401
 402 %files recommended
 403 %defattr(644,root,root,755)
 404 %{_libdir}/R/library/MASS
 405 %{_libdir}/R/library/class
 406 %{_libdir}/R/library/nnet
 407 %{_libdir}/R/library/spatial
 408 %doc VR
 409 %{_libdir}/R/library/KernSmooth
 410 %doc KernSmooth
 411 %{_libdir}/R/library/boot
 412 %doc boot
 413 %{_libdir}/R/library/cluster
 414 %doc cluster
 415 %{_libdir}/R/library/foreign
 416 %doc foreign
 417 %{_libdir}/R/library/grid
 418 %doc grid
 419 %{_libdir}/R/library/lattice
 420 %doc lattice
 421 %{_libdir}/R/library/mgcv
 422 %doc mgcv
 423 %{_libdir}/R/library/nlme
 424 %doc nlme
 425 %{_libdir}/R/library/rpart
 426 %doc rpart
 427 %{_libdir}/R/library/survival
 428 %doc survival
 429
 430 %files contrib
 431 %defattr(644,root,root,755)
 432 %{_libdir}/R/library/acepack
 433 %doc acepack
 434 %{_libdir}/R/library/bootstrap
 435 %doc bootstrap
 436 %{_libdir}/R/library/date
 437 %doc date
 438 %{_libdir}/R/library/e1071
 439 %doc e1071
 440 %{_libdir}/R/library/fracdiff
 441 %doc fracdiff
 442 %{_libdir}/R/library/gee
 443 %doc gee
 444 %{_libdir}/R/library/integrate
 445 %doc integrate
 446 %{_libdir}/R/library/leaps
 447 %doc leaps
 448 %{_libdir}/R/library/oz
 449 %doc oz
 450 %{_libdir}/R/library/polynom
 451 %doc polynom
 452 %{_libdir}/R/library/princurve
 453 %doc princurve
 454 %{_libdir}/R/library/quadprog
 455 %doc quadprog
 456 %{_libdir}/R/library/xgobi
 457 %doc xgobi
 458
 459 %files mlbench
 460 %defattr(644,root,root,755)
 461 %{_libdir}/R/library/mlbench
 462 %doc mlbench