R.spec

   1 #
   2 # Conditional build:
   3 # _without_gnome        - without gnome support
   4 #
   5 Summary:        A language for data analysis and graphics
   6 Summary(pl):    Jêzyk do analizy danych oraz grafiki
   7 Name:           R
   8 Version:        1.5.0
   9 Release:        2
  10 Source0:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
  11 Source1:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/KernSmooth_2.22-7.tar.gz
  12 Source2:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/VR_7.0-1.tar.gz
  13 Source3:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.3.tar.gz
  14 Source4:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/boot_1.2-8.tar.gz
  15 Source5:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-9.tar.gz
  16 Source6:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/cluster_1.4-2.tar.gz
  17 Source7:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-12.tar.gz
  18 Source8:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_1.2-1.tar.gz
  19 Source9:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/foreign_0.5-3.tar.gz
  20 Source10:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-7.tar.gz
  21 Source11:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-7.tar.gz
  22 Source12:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/grid_0.6.tar.gz
  23 Source13:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/lattice_0.5-1.tar.gz
  24 Source14:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.4.tar.gz
  25 Source15:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mgcv_0.7-2.tar.gz
  26 Source16:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.5-4.tar.gz
  27 Source17:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nlme_3.1-27.tar.gz
  28 Source18:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-6.tar.gz
  29 Source19:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-9.tar.gz
  30 Source20:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/princurve_1.1-3.tar.gz
  31 Source21:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-4.tar.gz
  32 Source22:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rpart_3.1-6.tar.gz
  33 Source23:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival_2.9-1.tar.gz
  34 Source24:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-5.tar.gz
  35 Source25:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/Archive/integrate_2.2-3.tar.gz
  36 License:        Mixed (distributable), mostly GPL
  37 Group:          Development/Languages
  38 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  39 Provides:       R-base R-contrib
  40 BuildRequires:  autoconf
  41 BuildRequires:  automake
  42 BuildRequires:  libstdc++-devel
  43 BuildRequires:  gcc-c++
  44 BuildRequires:  gcc-g77
  45 BuildRequires:  perl >= 5.004
  46 BuildRequires:  libtool
  47 BuildRequires:  tetex-latex
  48 BuildRequires:  tetex-dvips
  49 BuildRequires:  tetex-pdftex
  50 BuildRequires:  zip
  51 BuildRequires:  XFree86-devel
  52 BuildRequires:  libpng-devel >= 1.0.5
  53 BuildRequires:  libjpeg-devel >= 6b
  54 BuildRequires:  libxml-devel
  55 BuildRequires:  zlib >= 1.1.3
  56 BuildRequires:  readline-devel
  57 #BuildRequires: lpr
  58 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       gnome-libs-devel}
  59 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       ORBit-devel}
  60 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       libglade-devel}
  61 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  62
  63 %description
  64 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  65 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  66 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  67 script files.
  68
  69 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  70 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
  71 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
  72 implementation and semantics are derived from Scheme.
  73
  74 %description -l pl
  75 System do obliczeñ statystycznych i grafiki. R sk³ada siê z jêzyka
  76 oraz ¶rodowiska uruchomieniowego z grafik±, debuggerem, dostêpem do
  77 niektórych funkcji systemowych oraz mo¿liwo¶ci± uruchamiania programów
  78 zapisanych w skryptach.
  79
  80 Jêzyk R by³ zainspirowany dwoma istniej±cymi jêzykami: S (Beckera,
  81 Chambersa i Wilksa) oraz Scheme (Sussmana). R jest podobny do S, ale
  82 implementacja i semantyka wywodzi siê ze Scheme.
  83
  84 %package base
  85 Summary:        The R base distribution
  86 Summary(pl):    Podstawowa dystrybucja R
  87 Group:          Development/Languages
  88 Provides:       R-ctest R-eda R-lqs R-methods R-modreg R-mva R-nls R-splines
  89 Provides:       R-stepfun R-tcltk R-tools R-ts
  90 License:        GPL v2 / LGPL
  91
  92 %description base
  93 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  94 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
  95 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
  96 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
  97 familiar and a good deal of S software will run without change under
  98 R.
  99
 100 %description base -l pl
 101 R jest jêzykiem i ¶rodowiskiem uruchomieniowym do interaktywnej
 102 analizy danych statystycznych. R nie jest ca³kowicie zgodny z jêzykiem
 103 S opracowanym w AT&T Bell Laboratiories (a teraz Lucent Technologies),
 104 mimo to u¿ytkownicy S zauwa¿± zbli¿one ¶rodowisko, a du¿a czê¶æ
 105 oprogramowania w S bêdzie dzia³a³a bez zmian w R.
 106
 107 %package recommended
 108 Summary:        Recommended contributed packages for the R language
 109 Summary(pl):    Zalecane dodatkowe pakiety do jêzyka R
 110 Group:          Development/Languages
 111 Provides:       R-KernSmooth R-VR R-boot R-cluster R-foreign R-grid
 112 Provides:       R-lattice R-mgcv R-nlme R-rpart R-survival
 113 License:        GPL, free or free for non-commercial use
 114 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 115 Requires:       R-base >= %{version}
 116 Obsoletes:      R-survival4 R-MASS R-clus R-class R-nnet R-spatial
 117
 118 %description recommended
 119 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 120 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 121
 122 %description recommended -l pl
 123 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 124 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 125
 126 %package contrib
 127 Summary:        Contributed packages for the R language
 128 Summary(pl):    Dodatkowe pakiety do jêzyka R
 129 Group:          Development/Languages
 130 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-date R-e1071 R-fracdiff R-gee
 131 Provides:       R-integrate R-leaps R-oz R-polynom R-princurve R-quadprog
 132 Provides:       R-xgobi
 133 License:        Mixed
 134 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 135 Requires:       R-base >= %{version}
 136 Requires:       R-VR
 137 Obsoletes:      R-principal.curve
 138
 139 %description contrib
 140 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 141 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 142
 143 %description contrib -l pl
 144 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 145 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 146
 147 %package mlbench
 148 Summary:        Machine learning benchmarks
 149 Summary(pl):    Testy wydajno¶ci uczenia maszyny
 150 Group:          Development/Languages
 151 License:        GPL
 152 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 153 Requires:       R-base >= %{version}
 154
 155 %description mlbench
 156 R package which contains a collection of real-world datasets and
 157 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 158 machine learning methods.
 159
 160 %description mlbench -l pl
 161 Ten podpakiet R zawiera zestaw rzeczywistych danych i funkcji do
 162 tworzenia sztucznych danych s³u¿±cych jako test wydajno¶ci metod
 163 uczenia maszyny.
 164
 165 %prep
 166 %setup -q -c -n R-cran -T -b 1
 167 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 2
 168 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 169 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 170 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 171 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 172 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 173 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 174 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 175 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 176 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 177 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 178 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 179 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 180 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 181 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 182 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 183 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 184 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 185 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 186 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 187 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 188 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 189 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 190 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 25
 191 %setup -q
 192 #%setup -q -T -D -a 14
 193
 194 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 195 # We need to remove them to avoid dependency problems
 196 rm -f ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 197
 198 %build
 199 aclocal
 200 autoconf
 201 cp -f /usr/share/automake/config.* .
 202 %configure \
 203         %{!?_without_gnome:--with-gnome} \
 204         %{?_without_gnome:--without-gnome} \
 205         --without-tcltk
 206
 207 %{__make}
 208 %{__make} help
 209 %{__make} html
 210 %{__make} clean
 211
 212 # Install contrib packages
 213 #
 214 R_HOME=`pwd`;export R_HOME
 215 PERL5LIB=`pwd`/share/perl;export PERL5LIB
 216 cd ../R-cran
 217 for pkg in `ls`
 218 do
 219 ${R_HOME}/bin/INSTALL ${pkg}
 220 done
 221 cd ${R_HOME}
 222
 223 #Remove old template files.
 224 #
 225 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 226 do
 227         mv ${oldinfile} ${oldinfile}.old
 228 #       rm ${oldinfile}
 229 done
 230
 231 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 232 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 233 # documentation, and copy it.
 234 #
 235 mkdir ${R_HOME}/contrib
 236 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 237 for pkg in `ls`; do
 238         if [ -d ${pkg} ]; then
 239                 mkdir ${R_HOME}/${pkg}
 240                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 241                         case $docfile in
 242                                 INDEX) ;;
 243                                 TITLE) ;;
 244                                 R) ;;
 245                                 man) ;;
 246                                 src) ;;
 247                                 src-c) ;;
 248                                 data) ;;
 249                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${R_HOME};;
 250                         esac
 251                 done
 252         fi
 253 done
 254 cd ${R_HOME}
 255
 256 %install
 257 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 258 install -d $RPM_BUILD_ROOT{%{_bindir},%{_mandir}/man1,%{_libdir}/R}
 259
 260 mv doc/R.1 $RPM_BUILD_ROOT%{_mandir}/man1/
 261 sed "s,`pwd`,%{_libdir}/R,g" < bin/R > bin/R. ; mv bin/R. bin/R
 262 mv bin/R $RPM_BUILD_ROOT%{_bindir}/R
 263
 264 find . -name 'Makefile*' -exec rm -f {} \;
 265 rm -rf etc/*.old
 266
 267 cp -R AUTHORS afm bin doc etc include library modules share \
 268         $RPM_BUILD_ROOT%{_libdir}/R
 269
 270 touch $RPM_BUILD_ROOT%{_libdir}/R/doc/html/search/index.html
 271
 272 %clean
 273 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 274
 275 %post base
 276 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 277  ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 278
 279 %preun base
 280 # These files are not owned by any package, so we have to remove them
 281 # but only if this is the last version of R-base on the system.
 282 #
 283 if [ "$1" = 0 ];
 284 then
 285         rm -f %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 286         rm -f %{_libdir}/R/doc/html/search/index.html
 287 fi
 288
 289 %post contrib
 290 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 291  ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 292
 293 %postun contrib
 294 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 295  ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 296
 297 %post recommended
 298 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 299  ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 300
 301 %postun recommended
 302 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 303  ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 304
 305 %post mlbench
 306 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 307  ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 308
 309 %postun mlbench
 310 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 311  ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 312
 313 %files base
 314 %defattr(644,root,root,755)
 315 %{_mandir}/man1/R.1*
 316 %attr(755,root,root) %{_bindir}/R
 317 %dir %{_libdir}/R
 318 %{_libdir}/R/afm
 319 %attr(755,root,root) %{_libdir}/R/bin
 320 %{_libdir}/R/etc
 321 %{_libdir}/R/include
 322 %{_libdir}/R/share
 323 %{_libdir}/R/AUTHORS
 324 %dir %{_libdir}/R/library
 325 %{_libdir}/R/library/base
 326 %{_libdir}/R/library/ctest
 327 %{_libdir}/R/library/eda
 328 %{_libdir}/R/library/lqs
 329 %{_libdir}/R/library/methods
 330 %{_libdir}/R/library/modreg
 331 %{_libdir}/R/library/mva
 332 %{_libdir}/R/library/nls
 333 %{_libdir}/R/library/splines
 334 %{_libdir}/R/library/stepfun
 335 %{_libdir}/R/library/tcltk
 336 %{_libdir}/R/library/tools
 337 %{_libdir}/R/library/ts
 338 %{_libdir}/R/modules
 339 %doc BUGS COPYRIGHTS FAQ NEWS README RESOURCES TASKS THANKS Y2K
 340 # %{_libdir}/R/doc %except %{_libdir}/R/doc/html/search/index.*
 341 %dir %{_libdir}/R/doc
 342 %{_libdir}/R/doc/[KRm]*
 343 %dir %{_libdir}/R/doc/html
 344 %{_libdir}/R/doc/html/*.css
 345 %{_libdir}/R/doc/html/*.html
 346 %{_libdir}/R/doc/html/*.jpg
 347 %dir %{_libdir}/R/doc/html/search
 348 %{_libdir}/R/doc/html/search/[A-Z]*
 349 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 350 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/search/index.html
 351
 352 %files recommended
 353 %defattr(644,root,root,755)
 354 %{_libdir}/R/library/MASS
 355 %{_libdir}/R/library/class
 356 %{_libdir}/R/library/nnet
 357 %{_libdir}/R/library/spatial
 358 %doc VR
 359 %{_libdir}/R/library/KernSmooth
 360 %doc KernSmooth
 361 %{_libdir}/R/library/boot
 362 %doc boot
 363 %{_libdir}/R/library/cluster
 364 %doc cluster
 365 %{_libdir}/R/library/foreign
 366 %doc foreign
 367 %{_libdir}/R/library/grid
 368 %doc grid
 369 %{_libdir}/R/library/lattice
 370 %doc lattice
 371 %{_libdir}/R/library/mgcv
 372 %doc mgcv
 373 %{_libdir}/R/library/nlme
 374 %doc nlme
 375 %{_libdir}/R/library/rpart
 376 %doc rpart
 377 %{_libdir}/R/library/survival
 378 %doc survival
 379
 380 %files contrib
 381 %defattr(644,root,root,755)
 382 %{_libdir}/R/library/acepack
 383 %doc acepack
 384 %{_libdir}/R/library/bootstrap
 385 %doc bootstrap
 386 %{_libdir}/R/library/date
 387 %doc date
 388 %{_libdir}/R/library/e1071
 389 %doc e1071
 390 %{_libdir}/R/library/fracdiff
 391 %doc fracdiff
 392 %{_libdir}/R/library/gee
 393 %doc gee
 394 %{_libdir}/R/library/integrate
 395 %doc integrate
 396 %{_libdir}/R/library/leaps
 397 %doc leaps
 398 %{_libdir}/R/library/oz
 399 %doc oz
 400 %{_libdir}/R/library/polynom
 401 %doc polynom
 402 %{_libdir}/R/library/princurve
 403 %doc princurve
 404 %{_libdir}/R/library/quadprog
 405 %doc quadprog
 406 %{_libdir}/R/library/xgobi
 407 %doc xgobi
 408
 409 %files mlbench
 410 %defattr(644,root,root,755)
 411 %{_libdir}/R/library/mlbench
 412 %doc mlbench