R.spec

   1 Summary:        A language for data analysis and graphics
   2 Name:           R
   3 Version:        0.61.1
   4 Release:        3
   5 Source0:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/base/r-0_61_1.tgz
   6 Source1:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.2-2.tar.gz
   7 Source2:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.0-2.tar.gz
   8 Source3:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-3.tar.gz
   9 Source4:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/class_VR5-4.tar.gz
  10 Source5:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/clus_1.0-2.tar.gz
  11 Source6:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/ctest_0.9-1.tar.gz
  12 Source7:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.0-3.tar.gz
  13 Source8:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_0.7-3.tar.gz
  14 Source9:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-2.tar.gz
  15 Source10:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_3.13-2.tar.gz
  16 Source11:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/integrate_1.0-3.tar.gz
  17 Source12:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/jpn_1.0-1.tar.gz
  18 Source13:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_1.0-3.tar.gz
  19 Source14:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nnet_VR5-3.tar.gz
  20 Source15:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-1.tar.gz
  21 Source16:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.0-3.tar.gz
  22 Source17:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/ratetables_1.0-2.tar.gz
  23 Source18:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rational_1.0-1.tar.gz
  24 Source19:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/spatial_VR5-2.tar.gz
  25 Source20:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/splines_2.0-1.tar.gz
  26 Source21:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival4_1.0-3.tar.gz
  27 Source22:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.0-2.tar.gz
  28 Source23:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/principal.curve_1.0-2.tar.gz
  29 Source24:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.0-2.tar.gz
  30 Patch0:         R-0.61.rpm.patch3
  31 Copyright:      GPL
  32 Group:          Development/Languages
  33 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  34 Provides:       R-base R-contrib
  35 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  36
  37 %description
  38 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  39 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  40 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  41 script files.
  42
  43 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  44 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the resulting
  45 language is very similar in appearance to S, the underlying implementation
  46 and semantics are derived from Scheme.
  47
  48 %package base
  49 Summary:        The R base distribution
  50 Group:          Development/Languages
  51 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-class R-clus R-ctest R-date R-e1071
  52 Provides:       R-fracdiff R-gee R-integrate R-jpn R-leaps R-mlbench R-nnet R-oz
  53 Provides:       R-polynom R-principal.curve R-quadprog R-ratetables R-rational
  54 Provides:       R-spatial R-splines R-survival4 R-xgobi
  55
  56 %description base
  57 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  58 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S language
  59 developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent Technologies). Indeed,
  60 S users will find the environment quite familiar and a good deal of S
  61 software will run without change under R.
  62
  63 %package contrib
  64 Summary:        contributed packages for the R language
  65 Group:          Development/Languages
  66 Copyright:      Mixed
  67 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
  68 Requires:       R-base >= %{version}
  69
  70 %description contrib
  71 Packages which extend the capabilities of the R base distribution
  72 and are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
  73
  74 %package mlbench
  75 Summary:        Machine learning benchmarks
  76 Group:          Development/Languages
  77 Copyright:      GPL
  78 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
  79 Requires:       R-base >= %{version}
  80
  81 %description mlbench
  82 R package which contains a collection of real-world datasets and
  83 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks
  84 for machine learning methods.
  85
  86 %prep
  87 %setup -q -c -n R-cran -T -b 2
  88 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
  89 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
  90 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
  91 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
  92 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
  93 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
  94 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
  95 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
  96 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
  97 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
  98 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
  99 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 100 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 101 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 102 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 103 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 104 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 105 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 106 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 107 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 108 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 109 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 110 %setup -q
 111 %setup -q -T -D -a 1
 112 %patch0 -p1
 113 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 114 # We need to remove them to avoid dependency problems
 115 rm ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 116
 117 %build
 118 make
 119 make help
 120 make html
 121 make clean
 122 make acclean
 123
 124 # Install contrib packages
 125 #
 126 RHOME=`pwd`;export RHOME
 127 cd ../R-cran
 128 for pkg in `ls`
 129 do
 130         ${RHOME}/etc/INSTALL -latex ${pkg}
 131 done
 132 cd ${RHOME}
 133
 134 # Install mlbench
 135 #
 136 ${RHOME}/etc/INSTALL mlbench
 137
 138 #Remove old template files.
 139 #
 140 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 141 do
 142         rm ${oldinfile}
 143 done
 144
 145 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 146 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 147 # documentation, and copy it.
 148 #
 149 mkdir ${RHOME}/contrib
 150 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 151 for pkg in `ls`; do
 152         if [ -d ${pkg} ]; then
 153                 mkdir ${RHOME}/${pkg}
 154                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 155                         case $docfile in
 156                                 INDEX) ;;
 157                                 TITLE) ;;
 158                                 R) ;;
 159                                 man) ;;
 160                                 src) ;;
 161                                 src-c) ;;
 162                                 data) ;;
 163                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${RHOME};;
 164                         esac
 165                 done
 166         fi
 167 done
 168 cd ${RHOME}
 169
 170 %install
 171 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1
 172 install R.1 ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1/
 173 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 174 cp -R afm bin cmd demos doc etc html include library ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 175 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}
 176 install -m 755 bin/R ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}/R
 177
 178 %files base
 179 %defattr(644,root,root,755)
 180 %attr(-,root,root) %{_mandir}/man1/R.1
 181 %attr(-,root,root) %{_bindir}/R
 182 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R
 183 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/afm
 184 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/bin
 185 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/cmd
 186 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/demos
 187 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/etc
 188 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/html
 189 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/include
 190 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R/library
 191 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/base/
 192 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/eda/
 193 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mva/
 194 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/stepfun/
 195 %attr(-,root,root) %doc CHANGES COPYING COPYRIGHTS MIRROR-SITES PROJECTS README RESOURCES TASKS
 196
 197 %files contrib
 198 %defattr(644,root,root,755)
 199 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/acepack
 200 %attr(-,root,root) %doc acepack
 201 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/bootstrap
 202 %attr(-,root,root) %doc bootstrap
 203 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/class
 204 %attr(-,root,root) %doc class
 205 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/clus
 206 %attr(-,root,root) %doc clus
 207 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ctest
 208 %attr(-,root,root) %doc ctest
 209 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/date
 210 %attr(-,root,root) %doc date
 211 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/e1071
 212 %attr(-,root,root) %doc e1071
 213 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/fracdiff
 214 %attr(-,root,root) %doc fracdiff
 215 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/gee
 216 %attr(-,root,root) %doc gee
 217 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/integrate
 218 %attr(-,root,root) %doc integrate
 219 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/jpn
 220 %attr(-,root,root) %doc jpn
 221 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/leaps
 222 %attr(-,root,root) %doc leaps
 223 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/nnet
 224 %attr(-,root,root) %doc nnet
 225 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/oz
 226 %attr(-,root,root) %doc oz
 227 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/polynom
 228 %attr(-,root,root) %doc polynom
 229 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ratetables
 230 %attr(-,root,root) %doc ratetables
 231 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/rational
 232 %attr(-,root,root) %doc rational
 233 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/spatial
 234 %attr(-,root,root) %doc spatial
 235 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/splines
 236 %attr(-,root,root) %doc splines
 237 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/survival4
 238 %attr(-,root,root) %doc survival4
 239 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/xgobi
 240 %attr(-,root,root) %doc xgobi
 241 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/principal.curve
 242 %attr(-,root,root) %doc principal.curve
 243 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/quadprog
 244 %attr(-,root,root) %doc quadprog
 245
 246 %files mlbench
 247 %defattr(644,root,root,755)
 248 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mlbench
 249 %attr(-,root,root) %doc mlbench/COPYRIGHT
 250 %attr(-,root,root) %doc mlbench/ChangeLog
 251 %attr(-,root,root) %doc mlbench/README
 252
 253 %clean
 254 rm -rf ${RPM_BUILD_ROOT}
 255
 256 %post base
 257 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 258
 259 %preun base
 260 # These files are not owned by any package, so we have to remove them
 261 # but only if this is the last version of R-base on the system.
 262 #
 263 if [ "$1" = 0 ];
 264 then
 265         rm -f %{_libdir}/R/library/LibIndex
 266         rm -f %{_libdir}/R/library/index.html
 267 fi
 268
 269 %post contrib
 270 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 271
 272 %postun contrib
 273 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 274
 275 %post mlbench
 276 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 277
 278 %postun mlbench
 279 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)