R.spec

   1 Summary:        A language for data analysis and graphics
   2 Name:           R
   3 Version:        1.1.1
   4 Release:        1
   5 Source0:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
   6 Source1:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.4-1.tar.gz
   7 Source2:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.2-1.tar.gz
   8 Source3:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-5.tar.gz
   9 #Source4:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/class_VR5-4.tar.gz
  10 #Source5:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/clus_1.0-2.tar.gz
  11 #Source6:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/ctest_0.9-1.tar.gz
  12 Source7:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-4.tar.gz
  13 Source8:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_0.9-2.tar.gz
  14 Source9:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-6.tar.gz
  15 Source10:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-3.tar.gz
  16 Source11:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/integrate_2.2-2.tar.gz
  17 #Source12:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/jpn_1.0-1.tar.gz
  18 Source13:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.0.tar.gz
  19 #Source14:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nnet_VR5-3.tar.gz
  20 Source15:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-3.tar.gz
  21 Source16:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-3.tar.gz
  22 #Source17:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/ratetables_1.0-2.tar.gz
  23 #Source18:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rational_1.0-1.tar.gz
  24 #Source19:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/spatial_VR5-2.tar.gz
  25 #Source20:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/splines_2.0-1.tar.gz
  26 Source21:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival5_1.1-5.tar.gz
  27 Source22:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-2.tar.gz
  28 #Source23:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/principal.curve_1.0-2.tar.gz
  29 Source24:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-1.tar.gz
  30 Source31:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench.pdf
  31 Source32:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack.pdf
  32 Source33:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap.pdf
  33 Source37:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date.pdf
  34 Source38:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071.pdf
  35 Source39:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff.pdf
  36 Source40:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee.pdf
  37 Source41:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/intergate.pdf
  38 Source43:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps.pdf
  39 Source45:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz.pdf
  40 Source46:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polymon.pdf
  41 Source51:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival5.pdf
  42 Source52:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi.pdf
  43 Source54:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog.pdf
  44 Patch0:         R-0.61.rpm.patch3
  45 Copyright:      GPL
  46 Group:          Development/Languages
  47 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  48 Provides:       R-base R-contrib
  49 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  50
  51 %description
  52 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  53 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  54 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  55 script files.
  56
  57 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  58 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the resulting
  59 language is very similar in appearance to S, the underlying implementation
  60 and semantics are derived from Scheme.
  61
  62 %package base
  63 Summary:        The R base distribution
  64 Group:          Development/Languages
  65 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-class R-clus R-ctest R-date R-e1071
  66 Provides:       R-fracdiff R-gee R-integrate R-jpn R-leaps R-mlbench R-nnet R-oz
  67 Provides:       R-polynom R-principal.curve R-quadprog R-ratetables R-rational
  68 Provides:       R-spatial R-splines R-survival4 R-xgobi
  69
  70 %description base
  71 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  72 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S language
  73 developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent Technologies). Indeed,
  74 S users will find the environment quite familiar and a good deal of S
  75 software will run without change under R.
  76
  77 %package contrib
  78 Summary:        contributed packages for the R language
  79 Group:          Development/Languages
  80 Copyright:      Mixed
  81 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
  82 Requires:       R-base >= %{version}
  83
  84 %description contrib
  85 Packages which extend the capabilities of the R base distribution
  86 and are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
  87
  88 %package mlbench
  89 Summary:        Machine learning benchmarks
  90 Group:          Development/Languages
  91 Copyright:      GPL
  92 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
  93 Requires:       R-base >= %{version}
  94
  95 %description mlbench
  96 R package which contains a collection of real-world datasets and
  97 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks
  98 for machine learning methods.
  99
 100 %prep
 101 %setup -q -c -n R-cran -T -b 2
 102 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 103 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 104 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 105 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 106 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 107 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 108 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 109 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 110 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 111 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 112 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 113 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 114 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 115 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 116 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 117 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 118 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 119 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 120 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 121 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 122 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 123 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 124 %setup -q
 125 %setup -q -T -D -a 1
 126 %patch0 -p1
 127 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 128 # We need to remove them to avoid dependency problems
 129 rm ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 130
 131 %build
 132 %{__make}
 133 %{__make} help
 134 %{__make} html
 135 %{__make} clean
 136 %{__make} acclean
 137
 138 # Install contrib packages
 139 #
 140 RHOME=`pwd`;export RHOME
 141 cd ../R-cran
 142 for pkg in `ls`
 143 do
 144         ${RHOME}/etc/INSTALL -latex ${pkg}
 145 done
 146 cd ${RHOME}
 147
 148 # Install mlbench
 149 #
 150 ${RHOME}/etc/INSTALL mlbench
 151
 152 #Remove old template files.
 153 #
 154 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 155 do
 156         rm ${oldinfile}
 157 done
 158
 159 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 160 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 161 # documentation, and copy it.
 162 #
 163 mkdir ${RHOME}/contrib
 164 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 165 for pkg in `ls`; do
 166         if [ -d ${pkg} ]; then
 167                 mkdir ${RHOME}/${pkg}
 168                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 169                         case $docfile in
 170                                 INDEX) ;;
 171                                 TITLE) ;;
 172                                 R) ;;
 173                                 man) ;;
 174                                 src) ;;
 175                                 src-c) ;;
 176                                 data) ;;
 177                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${RHOME};;
 178                         esac
 179                 done
 180         fi
 181 done
 182 cd ${RHOME}
 183
 184 %install
 185 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1
 186 install R.1 ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1/
 187 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 188 cp -R afm bin cmd demos doc etc html include library ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 189 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}
 190 install -m 755 bin/R ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}/R
 191
 192 %files base
 193 %defattr(644,root,root,755)
 194 %attr(-,root,root) %{_mandir}/man1/R.1
 195 %attr(-,root,root) %{_bindir}/R
 196 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R
 197 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/afm
 198 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/bin
 199 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/cmd
 200 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/demos
 201 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/etc
 202 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/html
 203 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/include
 204 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R/library
 205 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/base/
 206 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/eda/
 207 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mva/
 208 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/stepfun/
 209 %attr(-,root,root) %doc CHANGES COPYING COPYRIGHTS MIRROR-SITES PROJECTS README RESOURCES TASKS
 210
 211 %files contrib
 212 %defattr(644,root,root,755)
 213 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/acepack
 214 %attr(-,root,root) %doc acepack
 215 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/bootstrap
 216 %attr(-,root,root) %doc bootstrap
 217 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/class
 218 %attr(-,root,root) %doc class
 219 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/clus
 220 %attr(-,root,root) %doc clus
 221 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ctest
 222 %attr(-,root,root) %doc ctest
 223 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/date
 224 %attr(-,root,root) %doc date
 225 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/e1071
 226 %attr(-,root,root) %doc e1071
 227 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/fracdiff
 228 %attr(-,root,root) %doc fracdiff
 229 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/gee
 230 %attr(-,root,root) %doc gee
 231 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/integrate
 232 %attr(-,root,root) %doc integrate
 233 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/jpn
 234 %attr(-,root,root) %doc jpn
 235 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/leaps
 236 %attr(-,root,root) %doc leaps
 237 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/nnet
 238 %attr(-,root,root) %doc nnet
 239 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/oz
 240 %attr(-,root,root) %doc oz
 241 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/polynom
 242 %attr(-,root,root) %doc polynom
 243 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ratetables
 244 %attr(-,root,root) %doc ratetables
 245 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/rational
 246 %attr(-,root,root) %doc rational
 247 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/spatial
 248 %attr(-,root,root) %doc spatial
 249 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/splines
 250 %attr(-,root,root) %doc splines
 251 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/survival4
 252 %attr(-,root,root) %doc survival4
 253 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/xgobi
 254 %attr(-,root,root) %doc xgobi
 255 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/principal.curve
 256 %attr(-,root,root) %doc principal.curve
 257 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/quadprog
 258 %attr(-,root,root) %doc quadprog
 259
 260 %files mlbench
 261 %defattr(644,root,root,755)
 262 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mlbench
 263 %attr(-,root,root) %doc mlbench/COPYRIGHT
 264 %attr(-,root,root) %doc mlbench/ChangeLog
 265 %attr(-,root,root) %doc mlbench/README
 266
 267 %clean
 268 rm -rf ${RPM_BUILD_ROOT}
 269
 270 %post base
 271 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 272
 273 %preun base
 274 # These files are not owned by any package, so we have to remove them
 275 # but only if this is the last version of R-base on the system.
 276 #
 277 if [ "$1" = 0 ];
 278 then
 279         rm -f %{_libdir}/R/library/LibIndex
 280         rm -f %{_libdir}/R/library/index.html
 281 fi
 282
 283 %post contrib
 284 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 285
 286 %postun contrib
 287 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 288
 289 %post mlbench
 290 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 291
 292 %postun mlbench
 293 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)