R.spec

   1 #
   2 # Conditional build:
   3 # _without_gnome        - without gnome support
   4 #
   5 Summary:        A language for data analysis and graphics
   6 Summary(pl):    Jêzyk do analizy danych oraz grafiki
   7 Name:           R
   8 Version:        1.6.1
   9 Release:        2
  10 License:        Mixed (distributable), mostly GPL
  11 Group:          Development/Languages
  12 Source0:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
  13 Source1:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/KernSmooth_2.22-8.tar.gz
  14 Source2:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/VR_7.0-9.tar.gz
  15 Source3:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.3-2.tar.gz
  16 Source4:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/boot_1.2-8.tar.gz
  17 Source5:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-11.tar.gz
  18 Source6:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/cluster_1.6-2.tar.gz
  19 Source7:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-12.tar.gz
  20 Source8:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_1.3-5.tar.gz
  21 Source9:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/foreign_0.5-6.tar.gz
  22 Source10:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-8.tar.gz
  23 Source11:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-10.tar.gz
  24 Source12:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/grid_0.7-1.tar.gz
  25 Source13:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/lattice_0.6-6.tar.gz
  26 Source14:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.5.tar.gz
  27 Source15:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mgcv_0.8-6.tar.gz
  28 Source16:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.5-7.tar.gz
  29 Source17:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nlme_3.1-33.tar.gz
  30 Source18:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-6.tar.gz
  31 Source19:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-10.tar.gz
  32 Source20:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/princurve_1.1-5.tar.gz
  33 Source21:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-5.tar.gz
  34 Source22:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rpart_3.1-8.tar.gz
  35 Source23:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival_2.9-6.tar.gz
  36 Source24:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-7.tar.gz
  37 Source25:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/Archive/integrate_2.2-3.tar.gz
  38 Source26:       %{name}.desktop
  39 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  40 BuildRequires:  autoconf
  41 BuildRequires:  automake
  42 BuildRequires:  libstdc++-devel
  43 BuildRequires:  gcc-c++
  44 BuildRequires:  gcc-g77
  45 BuildRequires:  perl >= 5.004
  46 BuildRequires:  libtool
  47 BuildRequires:  tetex-latex
  48 BuildRequires:  tetex-dvips
  49 BuildRequires:  tetex-pdftex
  50 BuildRequires:  zip
  51 BuildRequires:  XFree86-devel
  52 BuildRequires:  blas-devel
  53 BuildRequires:  libpng-devel >= 1.0.5
  54 BuildRequires:  libjpeg-devel >= 6b
  55 BuildRequires:  libxml-devel
  56 BuildRequires:  zlib >= 1.1.3
  57 BuildRequires:  readline-devel
  58 #BuildRequires: lpr
  59 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       gnome-libs-devel}
  60 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       ORBit-devel}
  61 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       libglade-gnome-devel}
  62 Provides:       R-base
  63 Provides:       R-contrib
  64 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  65
  66 %description
  67 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  68 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  69 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  70 script files.
  71
  72 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  73 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
  74 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
  75 implementation and semantics are derived from Scheme.
  76
  77 %description -l pl
  78 System do obliczeñ statystycznych i grafiki. R sk³ada siê z jêzyka
  79 oraz ¶rodowiska uruchomieniowego z grafik±, debuggerem, dostêpem do
  80 niektórych funkcji systemowych oraz mo¿liwo¶ci± uruchamiania programów
  81 zapisanych w skryptach.
  82
  83 Jêzyk R by³ zainspirowany dwoma istniej±cymi jêzykami: S (Beckera,
  84 Chambersa i Wilksa) oraz Scheme (Sussmana). R jest podobny do S, ale
  85 implementacja i semantyka wywodzi siê ze Scheme.
  86
  87 %package base
  88 Summary:        The R base distribution
  89 Summary(pl):    Podstawowa dystrybucja R
  90 License:        GPL v2 / LGPL
  91 Group:          Development/Languages
  92 Requires(post): textutils
  93 Requires(post): perl
  94 Provides:       R-ctest R-eda R-lqs R-methods R-modreg R-mva R-nls R-splines
  95 Provides:       R-stepfun R-tcltk R-tools R-ts
  96
  97 %description base
  98 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  99 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
 100 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
 101 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
 102 familiar and a good deal of S software will run without change under
 103 R.
 104
 105 %description base -l pl
 106 R jest jêzykiem i ¶rodowiskiem uruchomieniowym do interaktywnej
 107 analizy danych statystycznych. R nie jest ca³kowicie zgodny z jêzykiem
 108 S opracowanym w AT&T Bell Laboratiories (a teraz Lucent Technologies),
 109 mimo to u¿ytkownicy S zauwa¿± zbli¿one ¶rodowisko, a du¿a czê¶æ
 110 oprogramowania w S bêdzie dzia³a³a bez zmian w R.
 111
 112 %package recommended
 113 Summary:        Recommended contributed packages for the R language
 114 Summary(pl):    Zalecane dodatkowe pakiety do jêzyka R
 115 Group:          Development/Languages
 116 Provides:       R-KernSmooth R-VR R-boot R-cluster R-foreign R-grid
 117 Provides:       R-lattice R-mgcv R-nlme R-rpart R-survival
 118 License:        GPL, free or free for non-commercial use
 119 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 120 Requires(post,postun):  R-base
 121 Requires(post,postun):  textutils
 122 Requires(post,postun):  perl
 123 Requires:       R-base >= %{version}
 124 Obsoletes:      R-survival4 R-MASS R-clus R-class R-nnet R-spatial
 125
 126 %description recommended
 127 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 128 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 129
 130 %description recommended -l pl
 131 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 132 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 133
 134 %package contrib
 135 Summary:        Contributed packages for the R language
 136 Summary(pl):    Dodatkowe pakiety do jêzyka R
 137 License:        Mixed
 138 Group:          Development/Languages
 139 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 140 Requires(post,postun):  R-base
 141 Requires(post,postun):  textutils
 142 Requires(post,postun):  perl
 143 Requires:       R-base >= %{version}
 144 Requires:       R-VR
 145 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-date R-e1071 R-fracdiff R-gee
 146 Provides:       R-integrate R-leaps R-oz R-polynom R-princurve R-quadprog
 147 Provides:       R-xgobi
 148 Obsoletes:      R-principal.curve
 149
 150 %description contrib
 151 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 152 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 153
 154 %description contrib -l pl
 155 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 156 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 157
 158 %package mlbench
 159 Summary:        Machine learning benchmarks
 160 Summary(pl):    Testy wydajno¶ci uczenia maszyny
 161 Group:          Development/Languages
 162 License:        GPL
 163 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 164 Requires(post,postun):  R-base
 165 Requires(post,postun):  textutils
 166 Requires(post,postun):  perl
 167 Requires:       R-base >= %{version}
 168
 169 %description mlbench
 170 R package which contains a collection of real-world datasets and
 171 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 172 machine learning methods.
 173
 174 %description mlbench -l pl
 175 Ten podpakiet R zawiera zestaw rzeczywistych danych i funkcji do
 176 tworzenia sztucznych danych s³u¿±cych jako test wydajno¶ci metod
 177 uczenia maszyny.
 178
 179 %prep
 180 %setup -q -c -n R-cran -T -b 1
 181 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 2
 182 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 183 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 184 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 185 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 186 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 187 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 188 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 189 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 190 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 191 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 192 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 193 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 194 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 195 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 196 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 197 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 198 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 199 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 200 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 201 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 202 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 203 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 204 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 25
 205 %setup -q
 206 #%setup -q -T -D -a 14
 207
 208 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 209 # We need to remove them to avoid dependency problems
 210 rm -f ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 211
 212 %build
 213 %{__aclocal}
 214 %{__autoconf}
 215 cp -f /usr/share/automake/config.* .
 216 %configure \
 217         %{!?_without_gnome:--with-gnome} \
 218         %{?_without_gnome:--without-gnome} \
 219         --without-tcltk
 220
 221 %{__make}
 222 %{__make} help
 223 %{__make} html
 224 %{__make} clean
 225
 226 # Install contrib packages
 227 #
 228 R_HOME=`pwd`;export R_HOME
 229 PERL5LIB=`pwd`/share/perl;export PERL5LIB
 230 cd ../R-cran
 231 for pkg in `ls`
 232 do
 233 ${R_HOME}/bin/INSTALL ${pkg}
 234 done
 235 cd ${R_HOME}
 236
 237 #Remove old template files.
 238 #
 239 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 240 do
 241         mv ${oldinfile} ${oldinfile}.old
 242 #       rm ${oldinfile}
 243 done
 244
 245 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 246 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 247 # documentation, and copy it.
 248 #
 249 mkdir ${R_HOME}/contrib
 250 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 251 for pkg in `ls`; do
 252         if [ -d ${pkg} ]; then
 253                 mkdir ${R_HOME}/${pkg}
 254                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 255                         case $docfile in
 256                                 INDEX) ;;
 257                                 TITLE) ;;
 258                                 R) ;;
 259                                 man) ;;
 260                                 src) ;;
 261                                 src-c) ;;
 262                                 data) ;;
 263                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${R_HOME};;
 264                         esac
 265                 done
 266         fi
 267 done
 268 cd ${R_HOME}
 269
 270 %install
 271 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 272 install -d $RPM_BUILD_ROOT{%{_bindir},%{_mandir}/man1,%{_libdir}/R,%{_applnkdir}/Scientific/Numerics}
 273
 274 install %{SOURCE26} $RPM_BUILD_ROOT%{_applnkdir}/Scientific/Numerics/%{name}.desktop
 275
 276 mv doc/R.1 $RPM_BUILD_ROOT%{_mandir}/man1/
 277 sed "s,`pwd`,%{_libdir}/R,g" < bin/R > bin/R. ; mv bin/R. bin/R
 278 mv bin/R $RPM_BUILD_ROOT%{_bindir}/R
 279
 280 find . -name 'Makefile*' -exec rm -f {} \;
 281 rm -rf etc/*.old
 282
 283 cp -R AUTHORS afm bin doc etc include library modules share \
 284         $RPM_BUILD_ROOT%{_libdir}/R
 285
 286 %clean
 287 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 288
 289 %post base
 290 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 291  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 292
 293 #%preun base
 294 ## These files are not owned by any package, so we have to remove them
 295 ## but only if this is the last version of R-base on the system.
 296 ##
 297 #if [ "$1" = 0 ];
 298 #then
 299 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 300 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 301 #fi
 302
 303 %post contrib
 304 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 305  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 306
 307 %postun contrib
 308 if [ -f ../bin/Rcmd ];then
 309 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 310  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 311 fi
 312
 313 %post recommended
 314 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 315  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 316
 317 %postun recommended
 318 if [ -f ../bin/Rcmd ];then
 319 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 320  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 321 fi
 322
 323 %post mlbench
 324 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 325  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 326
 327 %postun mlbench
 328 if [ -f ../bin/Rcmd ];then
 329 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 330  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 331 fi
 332
 333 %files base
 334 %defattr(644,root,root,755)
 335 %{_mandir}/man1/R.1*
 336 %attr(755,root,root) %{_bindir}/R
 337 %dir %{_libdir}/R
 338 %{_libdir}/R/afm
 339 %attr(755,root,root) %{_libdir}/R/bin
 340 %{_libdir}/R/etc
 341 %{_libdir}/R/include
 342 %{_libdir}/R/share
 343 %{_libdir}/R/AUTHORS
 344 %dir %{_libdir}/R/library
 345 %{_libdir}/R/library/*.css
 346 %{_libdir}/R/library/base
 347 %{_libdir}/R/library/ctest
 348 %{_libdir}/R/library/eda
 349 %{_libdir}/R/library/lqs
 350 %{_libdir}/R/library/methods
 351 %{_libdir}/R/library/modreg
 352 %{_libdir}/R/library/mva
 353 %{_libdir}/R/library/nls
 354 %{_libdir}/R/library/splines
 355 %{_libdir}/R/library/stepfun
 356 %{_libdir}/R/library/tcltk
 357 %{_libdir}/R/library/tools
 358 %{_libdir}/R/library/ts
 359 %{_libdir}/R/modules
 360 %doc BUGS COPYRIGHTS FAQ NEWS README RESOURCES THANKS Y2K
 361 # %{_libdir}/R/doc %except %{_libdir}/R/doc/html/{packages.html,search/index.txt}
 362 %dir %{_libdir}/R/doc
 363 %{_libdir}/R/doc/[KRm]*
 364 %dir %{_libdir}/R/doc/html
 365 %{_libdir}/R/doc/html/*.css
 366 %{_libdir}/R/doc/html/[Ra-lr-u]*.html
 367 %{_libdir}/R/doc/html/packages-head.html
 368 %{_libdir}/R/doc/html/*.jpg
 369 %dir %{_libdir}/R/doc/html/search
 370 %{_libdir}/R/doc/html/search/[A-Z]*
 371 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 372 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 373 %{_applnkdir}/Scientific/Numerics/*
 374
 375 %files recommended
 376 %defattr(644,root,root,755)
 377 %{_libdir}/R/library/MASS
 378 %{_libdir}/R/library/class
 379 %{_libdir}/R/library/nnet
 380 %{_libdir}/R/library/spatial
 381 %doc VR
 382 %{_libdir}/R/library/KernSmooth
 383 %doc KernSmooth
 384 %{_libdir}/R/library/boot
 385 %doc boot
 386 %{_libdir}/R/library/cluster
 387 %doc cluster
 388 %{_libdir}/R/library/foreign
 389 %doc foreign
 390 %{_libdir}/R/library/grid
 391 %doc grid
 392 %{_libdir}/R/library/lattice
 393 %doc lattice
 394 %{_libdir}/R/library/mgcv
 395 %doc mgcv
 396 %{_libdir}/R/library/nlme
 397 %doc nlme
 398 %{_libdir}/R/library/rpart
 399 %doc rpart
 400 %{_libdir}/R/library/survival
 401 %doc survival
 402
 403 %files contrib
 404 %defattr(644,root,root,755)
 405 %{_libdir}/R/library/acepack
 406 %doc acepack
 407 %{_libdir}/R/library/bootstrap
 408 %doc bootstrap
 409 %{_libdir}/R/library/date
 410 %doc date
 411 %{_libdir}/R/library/e1071
 412 %doc e1071
 413 %{_libdir}/R/library/fracdiff
 414 %doc fracdiff
 415 %{_libdir}/R/library/gee
 416 %doc gee
 417 %{_libdir}/R/library/integrate
 418 %doc integrate
 419 %{_libdir}/R/library/leaps
 420 %doc leaps
 421 %{_libdir}/R/library/oz
 422 %doc oz
 423 %{_libdir}/R/library/polynom
 424 %doc polynom
 425 %{_libdir}/R/library/princurve
 426 %doc princurve
 427 %{_libdir}/R/library/quadprog
 428 %doc quadprog
 429 %{_libdir}/R/library/xgobi
 430 %doc xgobi
 431
 432 %files mlbench
 433 %defattr(644,root,root,755)
 434 %{_libdir}/R/library/mlbench
 435 %doc mlbench