R.spec

   1 Summary: A language for data analysis and graphics
   2 Name: R
   3 Version: 0.61.1
   4 Release: 3
   5 Source0: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/base/r-0_61_1.tgz
   6 Source1: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.2-2.tar.gz
   7 Source2: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.0-2.tar.gz
   8 Source3: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-3.tar.gz
   9 Source4: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/class_VR5-4.tar.gz
  10 Source5: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/clus_1.0-2.tar.gz
  11 Source6: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/ctest_0.9-1.tar.gz
  12 Source7: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/date_1.0-3.tar.gz
  13 Source8: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/e1071_0.7-3.tar.gz
  14 Source9: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-2.tar.gz
  15 Source10: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/gee_3.13-2.tar.gz
  16 Source11: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/integrate_1.0-3.tar.gz
  17 Source12: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/jpn_1.0-1.tar.gz
  18 Source13: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/leaps_1.0-3.tar.gz
  19 Source14: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/nnet_VR5-3.tar.gz
  20 Source15: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-1.tar.gz
  21 Source16: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.0-3.tar.gz
  22 Source17: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/ratetables_1.0-2.tar.gz
  23 Source18: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/rational_1.0-1.tar.gz
  24 Source19: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/spatial_VR5-2.tar.gz
  25 Source20: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/splines_2.0-1.tar.gz
  26 Source21: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/survival4_1.0-3.tar.gz
  27 Source22: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.0-2.tar.gz
  28 Source23: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/principal.curve_1.0-2.tar.gz
  29 Source24: ftp.stat.math.ethz.ch:/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.0-2.tar.gz
  30 Patch0: R-0.61.rpm.patch3
  31 Copyright: gpl
  32 Group: Development/Languages
  33 Packager: Martyn Plummer <plummer@iarc.fr>
  34 URL: http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  35 Provides: R-base R-contrib
  36 BuildRoot: /tmp/R
  37
  38 %description
  39 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  40 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  41 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  42 script files.
  43
  44 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  45 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the resulting
  46 language is very similar in appearance to S, the underlying implementation
  47 and semantics are derived from Scheme.
  48
  49 %package base
  50 Summary: The R base distribution
  51 Group: Development/Languages
  52 Version: 0.61.1
  53 Conflicts: R-contrib < 1998.1.1
  54 Provides: R-acepack R-bootstrap R-class R-clus R-ctest R-date R-e1071
  55 Provides: R-fracdiff R-gee R-integrate R-jpn R-leaps R-mlbench R-nnet R-oz
  56 Provides: R-polynom R-principal.curve R-quadprog R-ratetables R-rational
  57 Provides: R-spatial R-splines R-survival4 R-xgobi
  58
  59 %description base
  60 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  61 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S language
  62 developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent Technologies). Indeed,
  63 S users will find the environment quite familiar and a good deal of S
  64 software will run without change under R.
  65
  66 %package contrib
  67 Summary: contributed packages for the R language
  68 Group: Development/Languages
  69 Copyright: Mixed
  70 URL: http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
  71 Version: 1998.01.22
  72 Release: 3
  73 Requires: R-base >= 0.60
  74
  75 %description contrib
  76 Packages which extend the capabilities of the R base distribution
  77 and are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
  78
  79 %package mlbench
  80 Summary: Machine learning benchmarks
  81 Group: Development/Languages
  82 Copyright: GPL
  83 URL: http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
  84 Version: 0.2.2
  85 Release: 3
  86 Requires: R-base >= 0.60
  87
  88 %description mlbench
  89 R package which contains a collection of real-world datasets and
  90 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks
  91 for machine learning methods.
  92
  93 %prep
  94 %setup -c -n R-cran -T -b 2
  95 %setup -c -n R-cran -T -D -b 3
  96 %setup -c -n R-cran -T -D -b 4
  97 %setup -c -n R-cran -T -D -b 5
  98 %setup -c -n R-cran -T -D -b 6
  99 %setup -c -n R-cran -T -D -b 7
 100 %setup -c -n R-cran -T -D -b 8
 101 %setup -c -n R-cran -T -D -b 9
 102 %setup -c -n R-cran -T -D -b 10
 103 %setup -c -n R-cran -T -D -b 11
 104 %setup -c -n R-cran -T -D -b 12
 105 %setup -c -n R-cran -T -D -b 13
 106 %setup -c -n R-cran -T -D -b 14
 107 %setup -c -n R-cran -T -D -b 15
 108 %setup -c -n R-cran -T -D -b 16
 109 %setup -c -n R-cran -T -D -b 17
 110 %setup -c -n R-cran -T -D -b 18
 111 %setup -c -n R-cran -T -D -b 19
 112 %setup -c -n R-cran -T -D -b 20
 113 %setup -c -n R-cran -T -D -b 21
 114 %setup -c -n R-cran -T -D -b 22
 115 %setup -c -n R-cran -T -D -b 23
 116 %setup -c -n R-cran -T -D -b 24
 117 %setup
 118 %setup  -T -D -a 1
 119 %patch0 -p1
 120 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 121 # We need to remove them to avoid dependency problems
 122 rm ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 123
 124 %build
 125
 126 make
 127 make help
 128 make html
 129 make clean
 130 make acclean
 131
 132 # Install contrib packages
 133 #
 134 RHOME=`pwd`;export RHOME
 135 cd ../R-cran
 136 for pkg in `ls`
 137 do
 138         ${RHOME}/etc/INSTALL -latex ${pkg}
 139 done
 140 cd ${RHOME}
 141
 142 # Install mlbench
 143 #
 144 ${RHOME}/etc/INSTALL mlbench
 145
 146 #Remove old template files.
 147 #
 148 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 149 do
 150         rm ${oldinfile}
 151 done
 152
 153 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 154 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 155 # documentation, and copy it.
 156 #
 157 mkdir ${RHOME}/contrib
 158 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 159 for pkg in `ls`; do
 160         if [ -d ${pkg} ]; then
 161                 mkdir ${RHOME}/${pkg}
 162                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 163                         case $docfile in
 164                                 INDEX) ;;
 165                                 TITLE) ;;
 166                                 R) ;;
 167                                 man) ;;
 168                                 src) ;;
 169                                 src-c) ;;
 170                                 data) ;;
 171                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${RHOME};;
 172                         esac
 173                 done
 174         fi
 175 done
 176 cd ${RHOME}
 177
 178
 179 %install
 180 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1
 181 install R.1 ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1/
 182 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 183 cp -R afm bin cmd demos doc etc html include library ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 184 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}/usr/bin
 185 install -m 755 bin/R ${RPM_BUILD_ROOT}/usr/bin/R
 186
 187 %files base
 188 %attr(-,root,root) %{_mandir}/man1/R.1
 189 %attr(-,root,root) /usr/bin/R
 190 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R
 191 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/afm
 192 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/bin
 193 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/cmd
 194 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/demos
 195 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/etc
 196 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/html
 197 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/include
 198 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R/library
 199 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/base/
 200 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/eda/
 201 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mva/
 202 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/stepfun/
 203 %attr(-,root,root) %doc CHANGES COPYING COPYRIGHTS MIRROR-SITES PROJECTS README RESOURCES TASKS
 204
 205 %files contrib
 206 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/acepack
 207 %attr(-,root,root) %doc acepack
 208 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/bootstrap
 209 %attr(-,root,root) %doc bootstrap
 210 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/class
 211 %attr(-,root,root) %doc class
 212 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/clus
 213 %attr(-,root,root) %doc clus
 214 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ctest
 215 %attr(-,root,root) %doc ctest
 216 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/date
 217 %attr(-,root,root) %doc date
 218 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/e1071
 219 %attr(-,root,root) %doc e1071
 220 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/fracdiff
 221 %attr(-,root,root) %doc fracdiff
 222 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/gee
 223 %attr(-,root,root) %doc gee
 224 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/integrate
 225 %attr(-,root,root) %doc integrate
 226 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/jpn
 227 %attr(-,root,root) %doc jpn
 228 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/leaps
 229 %attr(-,root,root) %doc leaps
 230 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/nnet
 231 %attr(-,root,root) %doc nnet
 232 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/oz
 233 %attr(-,root,root) %doc oz
 234 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/polynom
 235 %attr(-,root,root) %doc polynom
 236 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ratetables
 237 %attr(-,root,root) %doc ratetables
 238 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/rational
 239 %attr(-,root,root) %doc rational
 240 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/spatial
 241 %attr(-,root,root) %doc spatial
 242 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/splines
 243 %attr(-,root,root) %doc splines
 244 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/survival4
 245 %attr(-,root,root) %doc survival4
 246 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/xgobi
 247 %attr(-,root,root) %doc xgobi
 248 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/principal.curve
 249 %attr(-,root,root) %doc principal.curve
 250 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/quadprog
 251 %attr(-,root,root) %doc quadprog
 252
 253 %files mlbench
 254 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mlbench
 255 %attr(-,root,root) %doc mlbench/COPYRIGHT
 256 %attr(-,root,root) %doc mlbench/ChangeLog
 257 %attr(-,root,root) %doc mlbench/README
 258
 259 %clean
 260 # Tidy up after build. We have to be quite careful here in case some
 261 # idiot (me) uses a build root of /. This leaves the directory structure
 262 # in place but removes the files owned by R.
 263 rm -f  ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1/R.1
 264 rm -f  ${RPM_BUILD_ROOT}/usr/bin/R
 265 rm -rf ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 266 rm -rf ${RPM_BUILD_ROOT}/usr/doc/R-*
 267
 268 %post base
 269 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 270
 271 %preun base
 272 # These files are not owned by any package, so we have to remove them
 273 # but only if this is the last version of R-base on the system.
 274 #
 275 if [ "$1" = 0 ];
 276 then
 277         rm -f %{_libdir}/R/library/LibIndex
 278         rm -f %{_libdir}/R/library/index.html
 279 fi
 280
 281 %post contrib
 282 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 283
 284 %postun contrib
 285 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 286
 287 %post mlbench
 288 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 289
 290 %postun mlbench
 291 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)