R.spec

   1 #
   2 # Conditional build:
   3 # _without_gnome        - without gnome support
   4 #
   5 Summary:        A language for data analysis and graphics
   6 Summary(pl):    Jêzyk do analizy danych oraz grafiki
   7 Name:           R
   8 Version:        1.5.0
   9 Release:        2
  10 Source0:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
  11 Source1:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/KernSmooth_2.22-7.tar.gz
  12 Source2:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/VR_7.0-1.tar.gz
  13 Source3:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.3.tar.gz
  14 Source4:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/boot_1.2-8.tar.gz
  15 Source5:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-9.tar.gz
  16 Source6:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/cluster_1.4-2.tar.gz
  17 Source7:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-12.tar.gz
  18 Source8:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_1.2-1.tar.gz
  19 Source9:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/foreign_0.5-3.tar.gz
  20 Source10:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-7.tar.gz
  21 Source11:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-7.tar.gz
  22 Source12:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/grid_0.6.tar.gz
  23 Source13:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/lattice_0.5-1.tar.gz
  24 Source14:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.4.tar.gz
  25 Source15:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mgcv_0.7-2.tar.gz
  26 Source16:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.5-4.tar.gz
  27 Source17:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nlme_3.1-27.tar.gz
  28 Source18:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-6.tar.gz
  29 Source19:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-9.tar.gz
  30 Source20:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/princurve_1.1-3.tar.gz
  31 Source21:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-4.tar.gz
  32 Source22:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rpart_3.1-6.tar.gz
  33 Source23:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival_2.9-1.tar.gz
  34 Source24:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-5.tar.gz
  35 Source25:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/Archive/integrate_2.2-3.tar.gz
  36 License:        Mixed (distributable), mostly GPL
  37 Group:          Development/Languages
  38 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  39 Provides:       R-base R-contrib
  40 BuildRequires:  autoconf
  41 BuildRequires:  automake
  42 BuildRequires:  libstdc++-devel
  43 BuildRequires:  gcc-c++
  44 BuildRequires:  gcc-g77
  45 BuildRequires:  perl >= 5.004
  46 BuildRequires:  libtool
  47 BuildRequires:  tetex-latex
  48 BuildRequires:  tetex-dvips
  49 BuildRequires:  tetex-pdftex
  50 BuildRequires:  zip
  51 BuildRequires:  XFree86-devel
  52 BuildRequires:  blas-devel
  53 BuildRequires:  libpng-devel >= 1.0.5
  54 BuildRequires:  libjpeg-devel >= 6b
  55 BuildRequires:  libxml-devel
  56 BuildRequires:  zlib >= 1.1.3
  57 BuildRequires:  readline-devel
  58 #BuildRequires: lpr
  59 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       gnome-libs-devel}
  60 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       ORBit-devel}
  61 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       libglade-gnome-devel}
  62 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  63
  64 %description
  65 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  66 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  67 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  68 script files.
  69
  70 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  71 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
  72 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
  73 implementation and semantics are derived from Scheme.
  74
  75 %description -l pl
  76 System do obliczeñ statystycznych i grafiki. R sk³ada siê z jêzyka
  77 oraz ¶rodowiska uruchomieniowego z grafik±, debuggerem, dostêpem do
  78 niektórych funkcji systemowych oraz mo¿liwo¶ci± uruchamiania programów
  79 zapisanych w skryptach.
  80
  81 Jêzyk R by³ zainspirowany dwoma istniej±cymi jêzykami: S (Beckera,
  82 Chambersa i Wilksa) oraz Scheme (Sussmana). R jest podobny do S, ale
  83 implementacja i semantyka wywodzi siê ze Scheme.
  84
  85 %package base
  86 Summary:        The R base distribution
  87 Summary(pl):    Podstawowa dystrybucja R
  88 Group:          Development/Languages
  89 Provides:       R-ctest R-eda R-lqs R-methods R-modreg R-mva R-nls R-splines
  90 Provides:       R-stepfun R-tcltk R-tools R-ts
  91 License:        GPL v2 / LGPL
  92
  93 %description base
  94 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  95 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
  96 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
  97 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
  98 familiar and a good deal of S software will run without change under
  99 R.
 100
 101 %description base -l pl
 102 R jest jêzykiem i ¶rodowiskiem uruchomieniowym do interaktywnej
 103 analizy danych statystycznych. R nie jest ca³kowicie zgodny z jêzykiem
 104 S opracowanym w AT&T Bell Laboratiories (a teraz Lucent Technologies),
 105 mimo to u¿ytkownicy S zauwa¿± zbli¿one ¶rodowisko, a du¿a czê¶æ
 106 oprogramowania w S bêdzie dzia³a³a bez zmian w R.
 107
 108 %package recommended
 109 Summary:        Recommended contributed packages for the R language
 110 Summary(pl):    Zalecane dodatkowe pakiety do jêzyka R
 111 Group:          Development/Languages
 112 Provides:       R-KernSmooth R-VR R-boot R-cluster R-foreign R-grid
 113 Provides:       R-lattice R-mgcv R-nlme R-rpart R-survival
 114 License:        GPL, free or free for non-commercial use
 115 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 116 Requires:       R-base >= %{version}
 117 Requires(post): R-base
 118 Requires(postun):       R-base
 119 Obsoletes:      R-survival4 R-MASS R-clus R-class R-nnet R-spatial
 120
 121 %description recommended
 122 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 123 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 124
 125 %description recommended -l pl
 126 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 127 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 128
 129 %package contrib
 130 Summary:        Contributed packages for the R language
 131 Summary(pl):    Dodatkowe pakiety do jêzyka R
 132 Group:          Development/Languages
 133 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-date R-e1071 R-fracdiff R-gee
 134 Provides:       R-integrate R-leaps R-oz R-polynom R-princurve R-quadprog
 135 Provides:       R-xgobi
 136 License:        Mixed
 137 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 138 Requires:       R-base >= %{version}
 139 Requires:       R-VR
 140 Requires(post): R-base
 141 Requires(postun):       R-base
 142 Obsoletes:      R-principal.curve
 143
 144 %description contrib
 145 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 146 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 147
 148 %description contrib -l pl
 149 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 150 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 151
 152 %package mlbench
 153 Summary:        Machine learning benchmarks
 154 Summary(pl):    Testy wydajno¶ci uczenia maszyny
 155 Group:          Development/Languages
 156 License:        GPL
 157 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 158 Requires:       R-base >= %{version}
 159 Requires(post): R-base
 160 Requires(postun):       R-base
 161
 162 %description mlbench
 163 R package which contains a collection of real-world datasets and
 164 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 165 machine learning methods.
 166
 167 %description mlbench -l pl
 168 Ten podpakiet R zawiera zestaw rzeczywistych danych i funkcji do
 169 tworzenia sztucznych danych s³u¿±cych jako test wydajno¶ci metod
 170 uczenia maszyny.
 171
 172 %prep
 173 %setup -q -c -n R-cran -T -b 1
 174 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 2
 175 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 176 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 177 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 178 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 179 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 180 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 181 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 182 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 183 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 184 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 185 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 186 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 187 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 188 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 189 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 190 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 191 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 192 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 193 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 194 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 195 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 196 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 197 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 25
 198 %setup -q
 199 #%setup -q -T -D -a 14
 200
 201 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 202 # We need to remove them to avoid dependency problems
 203 rm -f ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 204
 205 %build
 206 %{__aclocal}
 207 %{__autoconf}
 208 cp -f /usr/share/automake/config.* .
 209 %configure \
 210         %{!?_without_gnome:--with-gnome} \
 211         %{?_without_gnome:--without-gnome} \
 212         --without-tcltk
 213
 214 %{__make}
 215 %{__make} help
 216 %{__make} html
 217 %{__make} clean
 218
 219 # Install contrib packages
 220 #
 221 R_HOME=`pwd`;export R_HOME
 222 PERL5LIB=`pwd`/share/perl;export PERL5LIB
 223 cd ../R-cran
 224 for pkg in `ls`
 225 do
 226 ${R_HOME}/bin/INSTALL ${pkg}
 227 done
 228 cd ${R_HOME}
 229
 230 #Remove old template files.
 231 #
 232 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 233 do
 234         mv ${oldinfile} ${oldinfile}.old
 235 #       rm ${oldinfile}
 236 done
 237
 238 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 239 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 240 # documentation, and copy it.
 241 #
 242 mkdir ${R_HOME}/contrib
 243 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 244 for pkg in `ls`; do
 245         if [ -d ${pkg} ]; then
 246                 mkdir ${R_HOME}/${pkg}
 247                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 248                         case $docfile in
 249                                 INDEX) ;;
 250                                 TITLE) ;;
 251                                 R) ;;
 252                                 man) ;;
 253                                 src) ;;
 254                                 src-c) ;;
 255                                 data) ;;
 256                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${R_HOME};;
 257                         esac
 258                 done
 259         fi
 260 done
 261 cd ${R_HOME}
 262
 263 %install
 264 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 265 install -d $RPM_BUILD_ROOT{%{_bindir},%{_mandir}/man1,%{_libdir}/R}
 266
 267 mv doc/R.1 $RPM_BUILD_ROOT%{_mandir}/man1/
 268 sed "s,`pwd`,%{_libdir}/R,g" < bin/R > bin/R. ; mv bin/R. bin/R
 269 mv bin/R $RPM_BUILD_ROOT%{_bindir}/R
 270
 271 find . -name 'Makefile*' -exec rm -f {} \;
 272 rm -rf etc/*.old
 273
 274 cp -R AUTHORS afm bin doc etc include library modules share \
 275         $RPM_BUILD_ROOT%{_libdir}/R
 276
 277 %clean
 278 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 279
 280 %post base
 281 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 282  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 283
 284 #%preun base
 285 ## These files are not owned by any package, so we have to remove them
 286 ## but only if this is the last version of R-base on the system.
 287 ##
 288 #if [ "$1" = 0 ];
 289 #then
 290 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 291 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 292 #fi
 293
 294 %post contrib
 295 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 296  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 297
 298 %postun contrib
 299 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 300  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 301
 302 %post recommended
 303 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 304  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 305
 306 %postun recommended
 307 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 308  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 309
 310 %post mlbench
 311 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 312  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 313
 314 %postun mlbench
 315 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 316  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 317
 318 %files base
 319 %defattr(644,root,root,755)
 320 %{_mandir}/man1/R.1*
 321 %attr(755,root,root) %{_bindir}/R
 322 %dir %{_libdir}/R
 323 %{_libdir}/R/afm
 324 %attr(755,root,root) %{_libdir}/R/bin
 325 %{_libdir}/R/etc
 326 %{_libdir}/R/include
 327 %{_libdir}/R/share
 328 %{_libdir}/R/AUTHORS
 329 %dir %{_libdir}/R/library
 330 %{_libdir}/R/library/base
 331 %{_libdir}/R/library/ctest
 332 %{_libdir}/R/library/eda
 333 %{_libdir}/R/library/lqs
 334 %{_libdir}/R/library/methods
 335 %{_libdir}/R/library/modreg
 336 %{_libdir}/R/library/mva
 337 %{_libdir}/R/library/nls
 338 %{_libdir}/R/library/splines
 339 %{_libdir}/R/library/stepfun
 340 %{_libdir}/R/library/tcltk
 341 %{_libdir}/R/library/tools
 342 %{_libdir}/R/library/ts
 343 %{_libdir}/R/modules
 344 %doc BUGS COPYRIGHTS FAQ NEWS README RESOURCES THANKS Y2K
 345 # %{_libdir}/R/doc %except %{_libdir}/R/doc/html/{packages.html,search/index.txt}
 346 %dir %{_libdir}/R/doc
 347 %{_libdir}/R/doc/[KRm]*
 348 %dir %{_libdir}/R/doc/html
 349 %{_libdir}/R/doc/html/*.css
 350 %{_libdir}/R/doc/html/[Ra-lr-u]*.html
 351 %{_libdir}/R/doc/html/packages-head.html
 352 %{_libdir}/R/doc/html/*.jpg
 353 %dir %{_libdir}/R/doc/html/search
 354 %{_libdir}/R/doc/html/search/[A-Z]*
 355 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 356 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 357
 358 %files recommended
 359 %defattr(644,root,root,755)
 360 %{_libdir}/R/library/MASS
 361 %{_libdir}/R/library/class
 362 %{_libdir}/R/library/nnet
 363 %{_libdir}/R/library/spatial
 364 %doc VR
 365 %{_libdir}/R/library/KernSmooth
 366 %doc KernSmooth
 367 %{_libdir}/R/library/boot
 368 %doc boot
 369 %{_libdir}/R/library/cluster
 370 %doc cluster
 371 %{_libdir}/R/library/foreign
 372 %doc foreign
 373 %{_libdir}/R/library/grid
 374 %doc grid
 375 %{_libdir}/R/library/lattice
 376 %doc lattice
 377 %{_libdir}/R/library/mgcv
 378 %doc mgcv
 379 %{_libdir}/R/library/nlme
 380 %doc nlme
 381 %{_libdir}/R/library/rpart
 382 %doc rpart
 383 %{_libdir}/R/library/survival
 384 %doc survival
 385
 386 %files contrib
 387 %defattr(644,root,root,755)
 388 %{_libdir}/R/library/acepack
 389 %doc acepack
 390 %{_libdir}/R/library/bootstrap
 391 %doc bootstrap
 392 %{_libdir}/R/library/date
 393 %doc date
 394 %{_libdir}/R/library/e1071
 395 %doc e1071
 396 %{_libdir}/R/library/fracdiff
 397 %doc fracdiff
 398 %{_libdir}/R/library/gee
 399 %doc gee
 400 %{_libdir}/R/library/integrate
 401 %doc integrate
 402 %{_libdir}/R/library/leaps
 403 %doc leaps
 404 %{_libdir}/R/library/oz
 405 %doc oz
 406 %{_libdir}/R/library/polynom
 407 %doc polynom
 408 %{_libdir}/R/library/princurve
 409 %doc princurve
 410 %{_libdir}/R/library/quadprog
 411 %doc quadprog
 412 %{_libdir}/R/library/xgobi
 413 %doc xgobi
 414
 415 %files mlbench
 416 %defattr(644,root,root,755)
 417 %{_libdir}/R/library/mlbench
 418 %doc mlbench