R.spec

   1 #
   2 # Conditional build:
   3 # _without_gnome        - without gnome support
   4 #
   5 Summary:        A language for data analysis and graphics
   6 Summary(pl):    Jêzyk do analizy danych oraz grafiki
   7 Name:           R
   8 Version:        1.5.0
   9 Release:        2
  10 Source0:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
  11 Source1:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/KernSmooth_2.22-7.tar.gz
  12 Source2:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/VR_7.0-1.tar.gz
  13 Source3:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.3.tar.gz
  14 Source4:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/boot_1.2-8.tar.gz
  15 Source5:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-9.tar.gz
  16 Source6:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/cluster_1.4-2.tar.gz
  17 Source7:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-12.tar.gz
  18 Source8:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_1.2-1.tar.gz
  19 Source9:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/foreign_0.5-3.tar.gz
  20 Source10:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-7.tar.gz
  21 Source11:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-7.tar.gz
  22 Source12:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/grid_0.6.tar.gz
  23 Source13:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/lattice_0.5-1.tar.gz
  24 Source14:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.4.tar.gz
  25 Source15:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mgcv_0.7-2.tar.gz
  26 Source16:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.5-4.tar.gz
  27 Source17:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nlme_3.1-27.tar.gz
  28 Source18:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-6.tar.gz
  29 Source19:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-9.tar.gz
  30 Source20:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/princurve_1.1-3.tar.gz
  31 Source21:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-4.tar.gz
  32 Source22:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rpart_3.1-6.tar.gz
  33 Source23:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival_2.9-1.tar.gz
  34 Source24:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-5.tar.gz
  35 Source25:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/Archive/integrate_2.2-3.tar.gz
  36 License:        Mixed (distributable), mostly GPL
  37 Group:          Development/Languages
  38 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  39 Provides:       R-base R-contrib
  40 BuildRequires:  autoconf
  41 BuildRequires:  automake
  42 BuildRequires:  libstdc++-devel
  43 BuildRequires:  gcc-c++
  44 BuildRequires:  gcc-g77
  45 BuildRequires:  perl >= 5.004
  46 BuildRequires:  libtool
  47 BuildRequires:  tetex-latex
  48 BuildRequires:  tetex-dvips
  49 BuildRequires:  tetex-pdftex
  50 BuildRequires:  zip
  51 BuildRequires:  XFree86-devel
  52 BuildRequires:  libpng-devel >= 1.0.5
  53 BuildRequires:  libjpeg-devel >= 6b
  54 BuildRequires:  libxml-devel
  55 BuildRequires:  zlib >= 1.1.3
  56 BuildRequires:  readline-devel
  57 #BuildRequires: lpr
  58 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       gnome-libs-devel}
  59 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       ORBit-devel}
  60 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       libglade-devel}
  61 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  62
  63 %description
  64 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  65 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  66 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  67 script files.
  68
  69 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  70 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
  71 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
  72 implementation and semantics are derived from Scheme.
  73
  74 %description -l pl
  75 System do obliczeñ statystycznych i grafiki. R sk³ada siê z jêzyka
  76 oraz ¶rodowiska uruchomieniowego z grafik±, debuggerem, dostêpem do
  77 niektórych funkcji systemowych oraz mo¿liwo¶ci± uruchamiania programów
  78 zapisanych w skryptach.
  79
  80 Jêzyk R by³ zainspirowany dwoma istniej±cymi jêzykami: S (Beckera,
  81 Chambersa i Wilksa) oraz Scheme (Sussmana). R jest podobny do S, ale
  82 implementacja i semantyka wywodzi siê ze Scheme.
  83
  84 %package base
  85 Summary:        The R base distribution
  86 Summary(pl):    Podstawowa dystrybucja R
  87 Group:          Development/Languages
  88 Provides:       R-ctest R-eda R-lqs R-methods R-modreg R-mva R-nls R-splines
  89 Provides:       R-stepfun R-tcltk R-tools R-ts
  90 License:        GPL v2 / LGPL
  91
  92 %description base
  93 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  94 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
  95 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
  96 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
  97 familiar and a good deal of S software will run without change under
  98 R.
  99
 100 %description base -l pl
 101 R jest jêzykiem i ¶rodowiskiem uruchomieniowym do interaktywnej
 102 analizy danych statystycznych. R nie jest ca³kowicie zgodny z jêzykiem
 103 S opracowanym w AT&T Bell Laboratiories (a teraz Lucent Technologies),
 104 mimo to u¿ytkownicy S zauwa¿± zbli¿one ¶rodowisko, a du¿a czê¶æ
 105 oprogramowania w S bêdzie dzia³a³a bez zmian w R.
 106
 107 %package recommended
 108 Summary:        Recommended contributed packages for the R language
 109 Summary(pl):    Zalecane dodatkowe pakiety do jêzyka R
 110 Group:          Development/Languages
 111 Provides:       R-KernSmooth R-VR R-boot R-cluster R-foreign R-grid
 112 Provides:       R-lattice R-mgcv R-nlme R-rpart R-survival
 113 License:        GPL, free or free for non-commercial use
 114 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 115 Requires:       R-base >= %{version}
 116 Requires(post): R-base
 117 Requires(postun):       R-base
 118 Obsoletes:      R-survival4 R-MASS R-clus R-class R-nnet R-spatial
 119
 120 %description recommended
 121 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 122 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 123
 124 %description recommended -l pl
 125 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 126 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 127
 128 %package contrib
 129 Summary:        Contributed packages for the R language
 130 Summary(pl):    Dodatkowe pakiety do jêzyka R
 131 Group:          Development/Languages
 132 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-date R-e1071 R-fracdiff R-gee
 133 Provides:       R-integrate R-leaps R-oz R-polynom R-princurve R-quadprog
 134 Provides:       R-xgobi
 135 License:        Mixed
 136 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 137 Requires:       R-base >= %{version}
 138 Requires:       R-VR
 139 Requires(post): R-base
 140 Requires(postun):       R-base
 141 Obsoletes:      R-principal.curve
 142
 143 %description contrib
 144 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 145 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 146
 147 %description contrib -l pl
 148 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 149 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 150
 151 %package mlbench
 152 Summary:        Machine learning benchmarks
 153 Summary(pl):    Testy wydajno¶ci uczenia maszyny
 154 Group:          Development/Languages
 155 License:        GPL
 156 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 157 Requires:       R-base >= %{version}
 158 Requires(post): R-base
 159 Requires(postun):       R-base
 160
 161 %description mlbench
 162 R package which contains a collection of real-world datasets and
 163 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 164 machine learning methods.
 165
 166 %description mlbench -l pl
 167 Ten podpakiet R zawiera zestaw rzeczywistych danych i funkcji do
 168 tworzenia sztucznych danych s³u¿±cych jako test wydajno¶ci metod
 169 uczenia maszyny.
 170
 171 %prep
 172 %setup -q -c -n R-cran -T -b 1
 173 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 2
 174 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 175 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 176 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 177 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 178 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 179 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 180 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 181 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 182 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 183 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 184 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 185 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 186 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 187 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 188 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 189 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 190 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 191 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 192 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 193 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 194 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 195 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 196 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 25
 197 %setup -q
 198 #%setup -q -T -D -a 14
 199
 200 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 201 # We need to remove them to avoid dependency problems
 202 rm -f ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 203
 204 %build
 205 aclocal
 206 autoconf
 207 cp -f /usr/share/automake/config.* .
 208 %configure \
 209         %{!?_without_gnome:--with-gnome} \
 210         %{?_without_gnome:--without-gnome} \
 211         --without-tcltk
 212
 213 %{__make}
 214 %{__make} help
 215 %{__make} html
 216 %{__make} clean
 217
 218 # Install contrib packages
 219 #
 220 R_HOME=`pwd`;export R_HOME
 221 PERL5LIB=`pwd`/share/perl;export PERL5LIB
 222 cd ../R-cran
 223 for pkg in `ls`
 224 do
 225 ${R_HOME}/bin/INSTALL ${pkg}
 226 done
 227 cd ${R_HOME}
 228
 229 #Remove old template files.
 230 #
 231 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 232 do
 233         mv ${oldinfile} ${oldinfile}.old
 234 #       rm ${oldinfile}
 235 done
 236
 237 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 238 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 239 # documentation, and copy it.
 240 #
 241 mkdir ${R_HOME}/contrib
 242 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 243 for pkg in `ls`; do
 244         if [ -d ${pkg} ]; then
 245                 mkdir ${R_HOME}/${pkg}
 246                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 247                         case $docfile in
 248                                 INDEX) ;;
 249                                 TITLE) ;;
 250                                 R) ;;
 251                                 man) ;;
 252                                 src) ;;
 253                                 src-c) ;;
 254                                 data) ;;
 255                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${R_HOME};;
 256                         esac
 257                 done
 258         fi
 259 done
 260 cd ${R_HOME}
 261
 262 %install
 263 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 264 install -d $RPM_BUILD_ROOT{%{_bindir},%{_mandir}/man1,%{_libdir}/R}
 265
 266 mv doc/R.1 $RPM_BUILD_ROOT%{_mandir}/man1/
 267 sed "s,`pwd`,%{_libdir}/R,g" < bin/R > bin/R. ; mv bin/R. bin/R
 268 mv bin/R $RPM_BUILD_ROOT%{_bindir}/R
 269
 270 find . -name 'Makefile*' -exec rm -f {} \;
 271 rm -rf etc/*.old
 272
 273 cp -R AUTHORS afm bin doc etc include library modules share \
 274         $RPM_BUILD_ROOT%{_libdir}/R
 275
 276 %clean
 277 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 278
 279 %post base
 280 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 281  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 282
 283 #%preun base
 284 ## These files are not owned by any package, so we have to remove them
 285 ## but only if this is the last version of R-base on the system.
 286 ##
 287 #if [ "$1" = 0 ];
 288 #then
 289 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 290 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 291 #fi
 292
 293 %post contrib
 294 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 295  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 296
 297 %postun contrib
 298 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 299  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 300
 301 %post recommended
 302 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 303  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 304
 305 %postun recommended
 306 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 307  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 308
 309 %post mlbench
 310 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 311  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 312
 313 %postun mlbench
 314 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 315  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 316
 317 %files base
 318 %defattr(644,root,root,755)
 319 %{_mandir}/man1/R.1*
 320 %attr(755,root,root) %{_bindir}/R
 321 %dir %{_libdir}/R
 322 %{_libdir}/R/afm
 323 %attr(755,root,root) %{_libdir}/R/bin
 324 %{_libdir}/R/etc
 325 %{_libdir}/R/include
 326 %{_libdir}/R/share
 327 %{_libdir}/R/AUTHORS
 328 %dir %{_libdir}/R/library
 329 %{_libdir}/R/library/base
 330 %{_libdir}/R/library/ctest
 331 %{_libdir}/R/library/eda
 332 %{_libdir}/R/library/lqs
 333 %{_libdir}/R/library/methods
 334 %{_libdir}/R/library/modreg
 335 %{_libdir}/R/library/mva
 336 %{_libdir}/R/library/nls
 337 %{_libdir}/R/library/splines
 338 %{_libdir}/R/library/stepfun
 339 %{_libdir}/R/library/tcltk
 340 %{_libdir}/R/library/tools
 341 %{_libdir}/R/library/ts
 342 %{_libdir}/R/modules
 343 %doc BUGS COPYRIGHTS FAQ NEWS README RESOURCES THANKS Y2K
 344 # %{_libdir}/R/doc %except %{_libdir}/R/doc/html/{packages.html,search/index.txt}
 345 %dir %{_libdir}/R/doc
 346 %{_libdir}/R/doc/[KRm]*
 347 %dir %{_libdir}/R/doc/html
 348 %{_libdir}/R/doc/html/*.css
 349 %{_libdir}/R/doc/html/[Ra-lr-u]*.html
 350 %{_libdir}/R/doc/html/packages-head.html
 351 %{_libdir}/R/doc/html/*.jpg
 352 %dir %{_libdir}/R/doc/html/search
 353 %{_libdir}/R/doc/html/search/[A-Z]*
 354 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 355 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 356
 357 %files recommended
 358 %defattr(644,root,root,755)
 359 %{_libdir}/R/library/MASS
 360 %{_libdir}/R/library/class
 361 %{_libdir}/R/library/nnet
 362 %{_libdir}/R/library/spatial
 363 %doc VR
 364 %{_libdir}/R/library/KernSmooth
 365 %doc KernSmooth
 366 %{_libdir}/R/library/boot
 367 %doc boot
 368 %{_libdir}/R/library/cluster
 369 %doc cluster
 370 %{_libdir}/R/library/foreign
 371 %doc foreign
 372 %{_libdir}/R/library/grid
 373 %doc grid
 374 %{_libdir}/R/library/lattice
 375 %doc lattice
 376 %{_libdir}/R/library/mgcv
 377 %doc mgcv
 378 %{_libdir}/R/library/nlme
 379 %doc nlme
 380 %{_libdir}/R/library/rpart
 381 %doc rpart
 382 %{_libdir}/R/library/survival
 383 %doc survival
 384
 385 %files contrib
 386 %defattr(644,root,root,755)
 387 %{_libdir}/R/library/acepack
 388 %doc acepack
 389 %{_libdir}/R/library/bootstrap
 390 %doc bootstrap
 391 %{_libdir}/R/library/date
 392 %doc date
 393 %{_libdir}/R/library/e1071
 394 %doc e1071
 395 %{_libdir}/R/library/fracdiff
 396 %doc fracdiff
 397 %{_libdir}/R/library/gee
 398 %doc gee
 399 %{_libdir}/R/library/integrate
 400 %doc integrate
 401 %{_libdir}/R/library/leaps
 402 %doc leaps
 403 %{_libdir}/R/library/oz
 404 %doc oz
 405 %{_libdir}/R/library/polynom
 406 %doc polynom
 407 %{_libdir}/R/library/princurve
 408 %doc princurve
 409 %{_libdir}/R/library/quadprog
 410 %doc quadprog
 411 %{_libdir}/R/library/xgobi
 412 %doc xgobi
 413
 414 %files mlbench
 415 %defattr(644,root,root,755)
 416 %{_libdir}/R/library/mlbench
 417 %doc mlbench