R.spec

   1 #
   2 # Conditional build:
   3 # _without_gnome        - without gnome support
   4 #
   5 Summary:        A language for data analysis and graphics
   6 Summary(pl):    Jêzyk do analizy danych oraz grafiki
   7 Name:           R
   8 Version:        1.5.0
   9 Release:        3
  10 Source0:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
  11 Source1:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/KernSmooth_2.22-7.tar.gz
  12 Source2:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/VR_7.0-1.tar.gz
  13 Source3:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.3.tar.gz
  14 Source4:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/boot_1.2-8.tar.gz
  15 Source5:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-9.tar.gz
  16 Source6:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/cluster_1.4-2.tar.gz
  17 Source7:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-12.tar.gz
  18 Source8:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_1.2-1.tar.gz
  19 Source9:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/foreign_0.5-3.tar.gz
  20 Source10:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-7.tar.gz
  21 Source11:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-7.tar.gz
  22 Source12:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/grid_0.6.tar.gz
  23 Source13:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/lattice_0.5-1.tar.gz
  24 Source14:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.4.tar.gz
  25 Source15:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mgcv_0.7-2.tar.gz
  26 Source16:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.5-4.tar.gz
  27 Source17:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nlme_3.1-27.tar.gz
  28 Source18:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-6.tar.gz
  29 Source19:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-9.tar.gz
  30 Source20:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/princurve_1.1-3.tar.gz
  31 Source21:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-4.tar.gz
  32 Source22:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rpart_3.1-6.tar.gz
  33 Source23:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival_2.9-1.tar.gz
  34 Source24:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-5.tar.gz
  35 Source25:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/Archive/integrate_2.2-3.tar.gz
  36 Source26:       %{name}.desktop
  37 License:        Mixed (distributable), mostly GPL
  38 Group:          Development/Languages
  39 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  40 Provides:       R-base R-contrib
  41 BuildRequires:  autoconf
  42 BuildRequires:  automake
  43 BuildRequires:  libstdc++-devel
  44 BuildRequires:  gcc-c++
  45 BuildRequires:  gcc-g77
  46 BuildRequires:  perl >= 5.004
  47 BuildRequires:  libtool
  48 BuildRequires:  tetex-latex
  49 BuildRequires:  tetex-dvips
  50 BuildRequires:  tetex-pdftex
  51 BuildRequires:  zip
  52 BuildRequires:  XFree86-devel
  53 BuildRequires:  blas-devel
  54 BuildRequires:  libpng-devel >= 1.0.5
  55 BuildRequires:  libjpeg-devel >= 6b
  56 BuildRequires:  libxml-devel
  57 BuildRequires:  zlib >= 1.1.3
  58 BuildRequires:  readline-devel
  59 #BuildRequires: lpr
  60 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       gnome-libs-devel}
  61 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       ORBit-devel}
  62 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       libglade-gnome-devel}
  63 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  64
  65 %description
  66 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  67 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  68 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  69 script files.
  70
  71 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  72 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
  73 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
  74 implementation and semantics are derived from Scheme.
  75
  76 %description -l pl
  77 System do obliczeñ statystycznych i grafiki. R sk³ada siê z jêzyka
  78 oraz ¶rodowiska uruchomieniowego z grafik±, debuggerem, dostêpem do
  79 niektórych funkcji systemowych oraz mo¿liwo¶ci± uruchamiania programów
  80 zapisanych w skryptach.
  81
  82 Jêzyk R by³ zainspirowany dwoma istniej±cymi jêzykami: S (Beckera,
  83 Chambersa i Wilksa) oraz Scheme (Sussmana). R jest podobny do S, ale
  84 implementacja i semantyka wywodzi siê ze Scheme.
  85
  86 %package base
  87 Summary:        The R base distribution
  88 Summary(pl):    Podstawowa dystrybucja R
  89 Group:          Development/Languages
  90 Provides:       R-ctest R-eda R-lqs R-methods R-modreg R-mva R-nls R-splines
  91 Provides:       R-stepfun R-tcltk R-tools R-ts
  92 License:        GPL v2 / LGPL
  93
  94 %description base
  95 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  96 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
  97 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
  98 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
  99 familiar and a good deal of S software will run without change under
 100 R.
 101
 102 %description base -l pl
 103 R jest jêzykiem i ¶rodowiskiem uruchomieniowym do interaktywnej
 104 analizy danych statystycznych. R nie jest ca³kowicie zgodny z jêzykiem
 105 S opracowanym w AT&T Bell Laboratiories (a teraz Lucent Technologies),
 106 mimo to u¿ytkownicy S zauwa¿± zbli¿one ¶rodowisko, a du¿a czê¶æ
 107 oprogramowania w S bêdzie dzia³a³a bez zmian w R.
 108
 109 %package recommended
 110 Summary:        Recommended contributed packages for the R language
 111 Summary(pl):    Zalecane dodatkowe pakiety do jêzyka R
 112 Group:          Development/Languages
 113 Provides:       R-KernSmooth R-VR R-boot R-cluster R-foreign R-grid
 114 Provides:       R-lattice R-mgcv R-nlme R-rpart R-survival
 115 License:        GPL, free or free for non-commercial use
 116 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 117 Requires:       R-base >= %{version}
 118 Requires(post): R-base
 119 Requires(postun):       R-base
 120 Obsoletes:      R-survival4 R-MASS R-clus R-class R-nnet R-spatial
 121
 122 %description recommended
 123 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 124 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 125
 126 %description recommended -l pl
 127 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 128 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 129
 130 %package contrib
 131 Summary:        Contributed packages for the R language
 132 Summary(pl):    Dodatkowe pakiety do jêzyka R
 133 Group:          Development/Languages
 134 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-date R-e1071 R-fracdiff R-gee
 135 Provides:       R-integrate R-leaps R-oz R-polynom R-princurve R-quadprog
 136 Provides:       R-xgobi
 137 License:        Mixed
 138 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 139 Requires:       R-base >= %{version}
 140 Requires:       R-VR
 141 Requires(post): R-base
 142 Requires(postun):       R-base
 143 Obsoletes:      R-principal.curve
 144
 145 %description contrib
 146 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 147 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 148
 149 %description contrib -l pl
 150 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 151 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 152
 153 %package mlbench
 154 Summary:        Machine learning benchmarks
 155 Summary(pl):    Testy wydajno¶ci uczenia maszyny
 156 Group:          Development/Languages
 157 License:        GPL
 158 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 159 Requires:       R-base >= %{version}
 160 Requires(post): R-base
 161 Requires(postun):       R-base
 162
 163 %description mlbench
 164 R package which contains a collection of real-world datasets and
 165 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 166 machine learning methods.
 167
 168 %description mlbench -l pl
 169 Ten podpakiet R zawiera zestaw rzeczywistych danych i funkcji do
 170 tworzenia sztucznych danych s³u¿±cych jako test wydajno¶ci metod
 171 uczenia maszyny.
 172
 173 %prep
 174 %setup -q -c -n R-cran -T -b 1
 175 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 2
 176 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 177 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 178 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 179 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 180 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 181 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 182 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 183 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 184 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 185 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 186 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 187 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 188 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 189 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 190 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 191 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 192 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 193 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 194 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 195 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 196 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 197 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 198 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 25
 199 %setup -q
 200 #%setup -q -T -D -a 14
 201
 202 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 203 # We need to remove them to avoid dependency problems
 204 rm -f ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 205
 206 %build
 207 %{__aclocal}
 208 %{__autoconf}
 209 cp -f /usr/share/automake/config.* .
 210 %configure \
 211         %{!?_without_gnome:--with-gnome} \
 212         %{?_without_gnome:--without-gnome} \
 213         --without-tcltk
 214
 215 %{__make}
 216 %{__make} help
 217 %{__make} html
 218 %{__make} clean
 219
 220 # Install contrib packages
 221 #
 222 R_HOME=`pwd`;export R_HOME
 223 PERL5LIB=`pwd`/share/perl;export PERL5LIB
 224 cd ../R-cran
 225 for pkg in `ls`
 226 do
 227 ${R_HOME}/bin/INSTALL ${pkg}
 228 done
 229 cd ${R_HOME}
 230
 231 #Remove old template files.
 232 #
 233 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 234 do
 235         mv ${oldinfile} ${oldinfile}.old
 236 #       rm ${oldinfile}
 237 done
 238
 239 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 240 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 241 # documentation, and copy it.
 242 #
 243 mkdir ${R_HOME}/contrib
 244 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 245 for pkg in `ls`; do
 246         if [ -d ${pkg} ]; then
 247                 mkdir ${R_HOME}/${pkg}
 248                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 249                         case $docfile in
 250                                 INDEX) ;;
 251                                 TITLE) ;;
 252                                 R) ;;
 253                                 man) ;;
 254                                 src) ;;
 255                                 src-c) ;;
 256                                 data) ;;
 257                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${R_HOME};;
 258                         esac
 259                 done
 260         fi
 261 done
 262 cd ${R_HOME}
 263
 264 %install
 265 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 266 install -d $RPM_BUILD_ROOT{%{_bindir},%{_mandir}/man1,%{_libdir}/R,%{_applnkdir}/Scientific/Numerics}
 267
 268 install %{SOURCE26} $RPM_BUILD_ROOT%{_applnkdir}/Scientific/Numerics/%{name}.desktop
 269
 270 mv doc/R.1 $RPM_BUILD_ROOT%{_mandir}/man1/
 271 sed "s,`pwd`,%{_libdir}/R,g" < bin/R > bin/R. ; mv bin/R. bin/R
 272 mv bin/R $RPM_BUILD_ROOT%{_bindir}/R
 273
 274 find . -name 'Makefile*' -exec rm -f {} \;
 275 rm -rf etc/*.old
 276
 277 cp -R AUTHORS afm bin doc etc include library modules share \
 278         $RPM_BUILD_ROOT%{_libdir}/R
 279
 280 %clean
 281 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 282
 283 %post base
 284 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 285  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 286
 287 #%preun base
 288 ## These files are not owned by any package, so we have to remove them
 289 ## but only if this is the last version of R-base on the system.
 290 ##
 291 #if [ "$1" = 0 ];
 292 #then
 293 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 294 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 295 #fi
 296
 297 %post contrib
 298 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 299  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 300
 301 %postun contrib
 302 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 303  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 304
 305 %post recommended
 306 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 307  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 308
 309 %postun recommended
 310 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 311  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 312
 313 %post mlbench
 314 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 315  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 316
 317 %postun mlbench
 318 (cd %{_libdir}/R/library; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 319  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 320
 321 %files base
 322 %defattr(644,root,root,755)
 323 %{_mandir}/man1/R.1*
 324 %attr(755,root,root) %{_bindir}/R
 325 %dir %{_libdir}/R
 326 %{_libdir}/R/afm
 327 %attr(755,root,root) %{_libdir}/R/bin
 328 %{_libdir}/R/etc
 329 %{_libdir}/R/include
 330 %{_libdir}/R/share
 331 %{_libdir}/R/AUTHORS
 332 %dir %{_libdir}/R/library
 333 %{_libdir}/R/library/base
 334 %{_libdir}/R/library/ctest
 335 %{_libdir}/R/library/eda
 336 %{_libdir}/R/library/lqs
 337 %{_libdir}/R/library/methods
 338 %{_libdir}/R/library/modreg
 339 %{_libdir}/R/library/mva
 340 %{_libdir}/R/library/nls
 341 %{_libdir}/R/library/splines
 342 %{_libdir}/R/library/stepfun
 343 %{_libdir}/R/library/tcltk
 344 %{_libdir}/R/library/tools
 345 %{_libdir}/R/library/ts
 346 %{_libdir}/R/modules
 347 %doc BUGS COPYRIGHTS FAQ NEWS README RESOURCES THANKS Y2K
 348 # %{_libdir}/R/doc %except %{_libdir}/R/doc/html/{packages.html,search/index.txt}
 349 %dir %{_libdir}/R/doc
 350 %{_libdir}/R/doc/[KRm]*
 351 %dir %{_libdir}/R/doc/html
 352 %{_libdir}/R/doc/html/*.css
 353 %{_libdir}/R/doc/html/[Ra-lr-u]*.html
 354 %{_libdir}/R/doc/html/packages-head.html
 355 %{_libdir}/R/doc/html/*.jpg
 356 %dir %{_libdir}/R/doc/html/search
 357 %{_libdir}/R/doc/html/search/[A-Z]*
 358 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 359 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 360 %{_applnkdir}/Scientific/Numerics/*
 361
 362 %files recommended
 363 %defattr(644,root,root,755)
 364 %{_libdir}/R/library/MASS
 365 %{_libdir}/R/library/class
 366 %{_libdir}/R/library/nnet
 367 %{_libdir}/R/library/spatial
 368 %doc VR
 369 %{_libdir}/R/library/KernSmooth
 370 %doc KernSmooth
 371 %{_libdir}/R/library/boot
 372 %doc boot
 373 %{_libdir}/R/library/cluster
 374 %doc cluster
 375 %{_libdir}/R/library/foreign
 376 %doc foreign
 377 %{_libdir}/R/library/grid
 378 %doc grid
 379 %{_libdir}/R/library/lattice
 380 %doc lattice
 381 %{_libdir}/R/library/mgcv
 382 %doc mgcv
 383 %{_libdir}/R/library/nlme
 384 %doc nlme
 385 %{_libdir}/R/library/rpart
 386 %doc rpart
 387 %{_libdir}/R/library/survival
 388 %doc survival
 389
 390 %files contrib
 391 %defattr(644,root,root,755)
 392 %{_libdir}/R/library/acepack
 393 %doc acepack
 394 %{_libdir}/R/library/bootstrap
 395 %doc bootstrap
 396 %{_libdir}/R/library/date
 397 %doc date
 398 %{_libdir}/R/library/e1071
 399 %doc e1071
 400 %{_libdir}/R/library/fracdiff
 401 %doc fracdiff
 402 %{_libdir}/R/library/gee
 403 %doc gee
 404 %{_libdir}/R/library/integrate
 405 %doc integrate
 406 %{_libdir}/R/library/leaps
 407 %doc leaps
 408 %{_libdir}/R/library/oz
 409 %doc oz
 410 %{_libdir}/R/library/polynom
 411 %doc polynom
 412 %{_libdir}/R/library/princurve
 413 %doc princurve
 414 %{_libdir}/R/library/quadprog
 415 %doc quadprog
 416 %{_libdir}/R/library/xgobi
 417 %doc xgobi
 418
 419 %files mlbench
 420 %defattr(644,root,root,755)
 421 %{_libdir}/R/library/mlbench
 422 %doc mlbench