bogus-deps.patch

   1 --- Rsamtools/Rsamtools/DESCRIPTION~    2013-04-18 07:46:40.000000000 +0200
   2 +++ Rsamtools/Rsamtools/DESCRIPTION     2013-05-10 14:30:55.269037518 +0200
   3 @@ -14,7 +14,7 @@
   4  LazyLoad: yes
   5  Depends: methods, IRanges (>= 1.15.35), GenomicRanges (>= 1.11.38),
   6          Biostrings (>= 2.25.6)
   7 -Imports: methods, utils, IRanges, GenomicRanges, Biostrings, zlibbioc,
   8 +Imports: methods, utils, IRanges, GenomicRanges, Biostrings,
   9          bitops, BiocGenerics (>= 0.1.3)
  10  Suggests: ShortRead (>= 1.13.19), GenomicFeatures,
  11          TxDb.Dmelanogaster.UCSC.dm3.ensGene, KEGG.db, pasillaBamSubset,
  12 --- Rsamtools/Rsamtools/NAMESPACE~      2013-04-04 00:15:29.000000000 +0200
  13 +++ Rsamtools/Rsamtools/NAMESPACE       2013-05-10 14:31:12.692547009 +0200
  14 @@ -1,7 +1,5 @@
  15  useDynLib(Rsamtools, .registration=TRUE)
  16
  17 -import(zlibbioc)
  18 -
  19  importFrom(bitops, bitAnd)
  20
  21  importFrom(utils, read.table)           # normalizePath --> base in R-2.13