R.spec

   1 Summary:        A language for data analysis and graphics
   2 Summary(pl):    Jêzyk do analizy danych oraz grafiki
   3 Name:           R
   4 Version:        1.1.1
   5 Release:        1
   6 Source0:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
   7 Source1:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.4-1.tar.gz
   8 Source2:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.2-1.tar.gz
   9 Source3:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-5.tar.gz
  10 #Source4:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/class_VR5-4.tar.gz
  11 #Source5:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/clus_1.0-2.tar.gz
  12 #Source6:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/ctest_0.9-1.tar.gz
  13 Source7:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-4.tar.gz
  14 Source8:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_0.9-2.tar.gz
  15 Source9:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-6.tar.gz
  16 Source10:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-3.tar.gz
  17 Source11:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/integrate_2.2-2.tar.gz
  18 #Source12:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/jpn_1.0-1.tar.gz
  19 Source13:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.0.tar.gz
  20 #Source14:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nnet_VR5-3.tar.gz
  21 Source15:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-3.tar.gz
  22 Source16:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-3.tar.gz
  23 #Source17:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/ratetables_1.0-2.tar.gz
  24 #Source18:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rational_1.0-1.tar.gz
  25 #Source19:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/spatial_VR5-2.tar.gz
  26 #Source20:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/splines_2.0-1.tar.gz
  27 Source21:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival5_1.1-5.tar.gz
  28 Source22:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-2.tar.gz
  29 #Source23:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/principal.curve_1.0-2.tar.gz
  30 Source24:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-1.tar.gz
  31 Source31:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench.pdf
  32 Source32:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack.pdf
  33 Source33:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap.pdf
  34 Source37:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date.pdf
  35 Source38:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071.pdf
  36 Source39:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff.pdf
  37 Source40:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee.pdf
  38 Source41:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/intergate.pdf
  39 Source43:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps.pdf
  40 Source45:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz.pdf
  41 Source46:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polymon.pdf
  42 Source51:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival5.pdf
  43 Source52:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi.pdf
  44 Source54:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog.pdf
  45 Patch0:         %{name}-0.61.rpm.patch3
  46 License:        GPL
  47 Group:          Development/Languages
  48 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
  49 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
  50 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  51 Provides:       R-base R-contrib
  52 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  53
  54 %description
  55 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  56 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  57 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  58 script files.
  59
  60 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  61 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
  62 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
  63 implementation and semantics are derived from Scheme.
  64
  65 %description -l pl
  66 System do obliczeñ statystycznych i grafiki. R sk³ada siê z jêzyka
  67 oraz ¶rodowiska uruchomieniowego z grafik±, debuggerem, dostêpem do
  68 niektórych funkcji systemowych oraz mo¿liwo¶ci± uruchamiania programów
  69 zapisanych w skryptach.
  70
  71 Jêzyk R by³ zainspirowany dwoma istniej±cymi jêzykami: S (Beckera,
  72 Chambersa i Wilksa) oraz Scheme (Sussmana). R jest podobny do S, ale
  73 implementacja i semantyka wywodzi siê ze Scheme.
  74
  75 %package base
  76 Summary:        The R base distribution
  77 Summary(pl):    Podstawowa dystrybucja R
  78 Group:          Development/Languages
  79 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
  80 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
  81 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-class R-clus R-ctest R-date R-e1071
  82 Provides:       R-fracdiff R-gee R-integrate R-jpn R-leaps R-mlbench R-nnet R-oz
  83 Provides:       R-polynom R-principal.curve R-quadprog R-ratetables R-rational
  84 Provides:       R-spatial R-splines R-survival4 R-xgobi
  85
  86 %description base
  87 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  88 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
  89 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
  90 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
  91 familiar and a good deal of S software will run without change under
  92 R.
  93
  94 %description base -l pl
  95 R jest jêzykiem i ¶rodowiskiem uruchomieniowym do interaktywnej
  96 analizy danych statystycznych. R nie jest ca³kowicie zgodny z jêzykiem
  97 S opracowanym w AT&T Bell Laboratiories (a teraz Lucent Technologies),
  98 mimo to u¿ytkownicy S zauwa¿± zbli¿one ¶rodowisko, a du¿a czê¶æ
  99 oprogramowania w S bêdzie dzia³a³a bez zmian w R.
 100
 101 %package contrib
 102 Summary:        Contributed packages for the R language
 103 Summary(pl):    Dodatkowe pakiety do jêzyka R
 104 Group:          Development/Languages
 105 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
 106 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
 107 Copyright:      Mixed
 108 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 109 Requires:       R-base >= %{version}
 110
 111 %description contrib
 112 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 113 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 114
 115 %description contrib -l pl
 116 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 117 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 118
 119 %package mlbench
 120 Summary:        Machine learning benchmarks
 121 Group:          Development/Languages
 122 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
 123 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
 124 License:        GPL
 125 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 126 Requires:       R-base >= %{version}
 127
 128 %description mlbench
 129 R package which contains a collection of real-world datasets and
 130 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 131 machine learning methods.
 132
 133 %prep
 134 %setup -q -c -n R-cran -T -b 2
 135 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 136 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 137 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 138 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 139 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 140 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 141 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 142 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 143 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 144 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 145 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 146 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 147 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 148 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 149 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 150 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 151 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 152 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 153 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 154 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 155 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 156 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 157 %setup -q
 158 %setup -q -T -D -a 1
 159 %patch0 -p1
 160 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 161 # We need to remove them to avoid dependency problems
 162 rm -f ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 163
 164 %build
 165 %{__make}
 166 %{__make} help
 167 %{__make} html
 168 %{__make} clean
 169 %{__make} acclean
 170
 171 # Install contrib packages
 172 #
 173 RHOME=`pwd`;export RHOME
 174 cd ../R-cran
 175 for pkg in `ls`
 176 do
 177 ${RHOME}%{_sysconfdir}/INSTALL -latex ${pkg}
 178 done
 179 cd ${RHOME}
 180
 181 # Install mlbench
 182 #
 183 ${RHOME}%{_sysconfdir}/INSTALL mlbench
 184
 185 #Remove old template files.
 186 #
 187 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 188 do
 189         rm ${oldinfile}
 190 done
 191
 192 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 193 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 194 # documentation, and copy it.
 195 #
 196 mkdir ${RHOME}/contrib
 197 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 198 for pkg in `ls`; do
 199         if [ -d ${pkg} ]; then
 200                 mkdir ${RHOME}/${pkg}
 201                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 202                         case $docfile in
 203                                 INDEX) ;;
 204                                 TITLE) ;;
 205                                 R) ;;
 206                                 man) ;;
 207                                 src) ;;
 208                                 src-c) ;;
 209                                 data) ;;
 210                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${RHOME};;
 211                         esac
 212                 done
 213         fi
 214 done
 215 cd ${RHOME}
 216
 217 %install
 218 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 219 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1
 220 install R.1 ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1/
 221 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 222 cp -R afm bin cmd demos doc etc html include library ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 223 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}
 224 install -m 755 bin/R ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}/R
 225
 226 %clean
 227 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 228
 229 %post base
 230 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 231
 232 %preun base
 233 # These files are not owned by any package, so we have to remove them
 234 # but only if this is the last version of R-base on the system.
 235 #
 236 if [ "$1" = 0 ];
 237 then
 238         rm -f %{_libdir}/R/library/LibIndex
 239         rm -f %{_libdir}/R/library/index.html
 240 fi
 241
 242 %post contrib
 243 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 244
 245 %postun contrib
 246 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 247
 248 %post mlbench
 249 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 250
 251 %postun mlbench
 252 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 253
 254 %files base
 255 %defattr(644,root,root,755)
 256 %attr(-,root,root) %{_mandir}/man1/R.1
 257 %attr(-,root,root) %{_bindir}/R
 258 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R
 259 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/afm
 260 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/bin
 261 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/cmd
 262 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/demos
 263 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R%{_sysconfdir}
 264 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/html
 265 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/include
 266 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R/library
 267 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/base/
 268 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/eda/
 269 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mva/
 270 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/stepfun/
 271 %attr(-,root,root) %doc CHANGES COPYING COPYRIGHTS MIRROR-SITES PROJECTS README RESOURCES TASKS
 272
 273 %files contrib
 274 %defattr(644,root,root,755)
 275 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/acepack
 276 %attr(-,root,root) %doc acepack
 277 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/bootstrap
 278 %attr(-,root,root) %doc bootstrap
 279 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/class
 280 %attr(-,root,root) %doc class
 281 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/clus
 282 %attr(-,root,root) %doc clus
 283 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ctest
 284 %attr(-,root,root) %doc ctest
 285 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/date
 286 %attr(-,root,root) %doc date
 287 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/e1071
 288 %attr(-,root,root) %doc e1071
 289 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/fracdiff
 290 %attr(-,root,root) %doc fracdiff
 291 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/gee
 292 %attr(-,root,root) %doc gee
 293 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/integrate
 294 %attr(-,root,root) %doc integrate
 295 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/jpn
 296 %attr(-,root,root) %doc jpn
 297 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/leaps
 298 %attr(-,root,root) %doc leaps
 299 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/nnet
 300 %attr(-,root,root) %doc nnet
 301 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/oz
 302 %attr(-,root,root) %doc oz
 303 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/polynom
 304 %attr(-,root,root) %doc polynom
 305 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ratetables
 306 %attr(-,root,root) %doc ratetables
 307 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/rational
 308 %attr(-,root,root) %doc rational
 309 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/spatial
 310 %attr(-,root,root) %doc spatial
 311 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/splines
 312 %attr(-,root,root) %doc splines
 313 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/survival4
 314 %attr(-,root,root) %doc survival4
 315 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/xgobi
 316 %attr(-,root,root) %doc xgobi
 317 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/principal.curve
 318 %attr(-,root,root) %doc principal.curve
 319 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/quadprog
 320 %attr(-,root,root) %doc quadprog
 321
 322 %files mlbench
 323 %defattr(644,root,root,755)
 324 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mlbench
 325 %attr(-,root,root) %doc mlbench/COPYRIGHT
 326 %attr(-,root,root) %doc mlbench/ChangeLog
 327 %attr(-,root,root) %doc mlbench/README