R.spec

   1 #
   2 # Conditional build:
   3 # _without_gnome        - without gnome support
   4 #
   5 Summary:        A language for data analysis and graphics
   6 Summary(pl):    Jêzyk do analizy danych oraz grafiki
   7 Name:           R
   8 Version:        1.4.0
   9 Release:        1
  10 Source0:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
  11 Source1:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.5-4.tar.gz
  12 Source2:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/VR_6.3-1.tar.gz
  13 Source3:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.3.tar.gz
  14 Source4:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-9.tar.gz
  15 Source5:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/cluster_1.3-6.tar.gz
  16 Source6:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-11.tar.gz
  17 Source7:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_1.2-1.tar.gz
  18 Source8:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-7.tar.gz
  19 Source9:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-6.tar.gz
  20 #Source10:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/integrate_2.2-3.tar.gz
  21 # Source11:     ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/jpn_1.0-1.tar.gz
  22 Source12:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.1-1.tar.gz
  23 Source13:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-6.tar.gz
  24 Source14:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-8.tar.gz
  25 Source15:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/princurve_1.1-3.tar.gz
  26 Source16:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-3.tar.gz
  27 # Source17:     ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/ratetables_1.0-2.tar.gz
  28 # Source18:     ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rational_1.0-1.tar.gz
  29 Source19:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival_2.6.tar.gz
  30 Source20:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-5.tar.gz
  31 Patch0:         R-destdir.patch
  32 # Patch0:               %{name}-0.61.rpm.patch3
  33 License:        GPL
  34 Group:          Development/Languages
  35 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
  36 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
  37 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  38 Provides:       R-base R-contrib
  39 BuildRequires:  libstdc++-devel
  40 BuildRequires:  gcc-c++
  41 BuildRequires:  gcc-g77
  42 BuildRequires:  perl >= 5
  43 BuildRequires:  libtool
  44 BuildRequires:  tetex-latex
  45 BuildRequires:  tetex-dvips
  46 BuildRequires:  tetex-pdftex
  47 BuildRequires:  zip
  48 BuildRequires:  XFree86-devel
  49 BuildRequires:  libpng-devel >= 1.0.5
  50 BuildRequires:  libjpeg-devel >= 6b
  51 BuildRequires:  libxml-devel
  52 BuildRequires:  zlib >= 1.1.3
  53 BuildRequires:  readline-devel
  54 #BuildRequires: lpr
  55 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       gnome-libs-devel}
  56 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       ORBit-devel}
  57 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       libglade-devel}
  58 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  59
  60 %description
  61 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  62 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  63 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  64 script files.
  65
  66 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  67 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
  68 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
  69 implementation and semantics are derived from Scheme.
  70
  71 %description -l pl
  72 System do obliczeñ statystycznych i grafiki. R sk³ada siê z jêzyka
  73 oraz ¶rodowiska uruchomieniowego z grafik±, debuggerem, dostêpem do
  74 niektórych funkcji systemowych oraz mo¿liwo¶ci± uruchamiania programów
  75 zapisanych w skryptach.
  76
  77 Jêzyk R by³ zainspirowany dwoma istniej±cymi jêzykami: S (Beckera,
  78 Chambersa i Wilksa) oraz Scheme (Sussmana). R jest podobny do S, ale
  79 implementacja i semantyka wywodzi siê ze Scheme.
  80
  81 %package base
  82 Summary:        The R base distribution
  83 Summary(pl):    Podstawowa dystrybucja R
  84 Group:          Development/Languages
  85 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
  86 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
  87 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-VR R-cluster R-ctest R-date R-e1071
  88 Provides:       R-fracdiff R-gee R-integrate R-jpn R-leaps R-mlbench R-oz
  89 Provides:       R-polynom R-princurve R-quadprog R-ratetables R-rational
  90 Provides:       R-splines R-survival R-xgobi
  91 Obsoletes:      R-principal.curve R-survival4 R-clus R-class R-nnet R-spatial
  92
  93 %description base
  94 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  95 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
  96 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
  97 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
  98 familiar and a good deal of S software will run without change under
  99 R.
 100
 101 %description base -l pl
 102 R jest jêzykiem i ¶rodowiskiem uruchomieniowym do interaktywnej
 103 analizy danych statystycznych. R nie jest ca³kowicie zgodny z jêzykiem
 104 S opracowanym w AT&T Bell Laboratiories (a teraz Lucent Technologies),
 105 mimo to u¿ytkownicy S zauwa¿± zbli¿one ¶rodowisko, a du¿a czê¶æ
 106 oprogramowania w S bêdzie dzia³a³a bez zmian w R.
 107
 108 %package contrib
 109 Summary:        Contributed packages for the R language
 110 Summary(pl):    Dodatkowe pakiety do jêzyka R
 111 Group:          Development/Languages
 112 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
 113 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
 114 License:        Mixed
 115 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 116 Requires:       R-base >= %{version}
 117
 118 %description contrib
 119 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 120 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 121
 122 %description contrib -l pl
 123 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 124 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 125
 126 %package mlbench
 127 Summary:        Machine learning benchmarks
 128 Summary(pl):    Testy wydajno¶ci uczenia maszyny
 129 Group:          Development/Languages
 130 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
 131 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
 132 License:        GPL
 133 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 134 Requires:       R-base >= %{version}
 135
 136 %description mlbench
 137 R package which contains a collection of real-world datasets and
 138 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 139 machine learning methods.
 140
 141 %description mlbench -l pl
 142 Ten podpakiet R zawiera zestaw rzeczywistych danych i funkcji do
 143 zrobienia sztucznych danych dzia³aj±cych jako test wydajno¶ci metod
 144 uczenia maszyny.
 145
 146 %prep
 147 %setup -q -c -n R-cran -T -b 2
 148 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 149 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 150 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 151 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 152 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 153 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 154 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 155 #%setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 156 # %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 157 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 158 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 159 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 160 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 161 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 162 # %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 163 # %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 164 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 165 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 166 %setup -q
 167 %setup -q -T -D -a 1
 168 %patch0 -p0
 169 # %patch0 -p1
 170 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 171 # We need to remove them to avoid dependency problems
 172 rm -f ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 173
 174 %build
 175 %configure2_13 \
 176         %{!?_without_gnome:--with-gnome} \
 177         %{?_without_gnome:--without-gnome} \
 178         --without-tcltk
 179
 180 %{__make}
 181 %{__make} help
 182 %{__make} html
 183 %{__make} clean
 184 # %{__make} acclean
 185
 186 # Install contrib packages
 187 #
 188 R_HOME=`pwd`;export R_HOME
 189 PERL5LIB=`pwd`/share/perl;export PERL5LIB
 190 cd ../R-cran
 191 for pkg in `ls`
 192 do
 193 ${R_HOME}/bin/INSTALL ${pkg}
 194 done
 195 cd ${R_HOME}
 196
 197 # Install mlbench
 198 #
 199 ${R_HOME}/bin/INSTALL mlbench
 200
 201 #Remove old template files.
 202 #
 203 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 204 do
 205         mv ${oldinfile} ${oldinfile}.old
 206 #       rm ${oldinfile}
 207 done
 208
 209 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 210 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 211 # documentation, and copy it.
 212 #
 213 mkdir ${R_HOME}/contrib
 214 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 215 for pkg in `ls`; do
 216         if [ -d ${pkg} ]; then
 217                 mkdir ${R_HOME}/${pkg}
 218                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 219                         case $docfile in
 220                                 INDEX) ;;
 221                                 TITLE) ;;
 222                                 R) ;;
 223                                 man) ;;
 224                                 src) ;;
 225                                 src-c) ;;
 226                                 data) ;;
 227                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${R_HOME};;
 228                         esac
 229                 done
 230         fi
 231 done
 232 cd ${R_HOME}
 233
 234 %install
 235 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 236 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1
 237 install doc/R.1 ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1/
 238 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 239 # cp -R afm bin cmd demos doc etc html include library ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 240 cp -R afm bin doc etc include library modules ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 241 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}
 242 install -m 755 bin/R ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}/R
 243
 244 %clean
 245 # rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 246
 247 %post base
 248 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 249
 250 %preun base
 251 # These files are not owned by any package, so we have to remove them
 252 # but only if this is the last version of R-base on the system.
 253 #
 254 if [ "$1" = 0 ];
 255 then
 256         rm -f %{_libdir}/R/library/LibIndex
 257         rm -f %{_libdir}/R/library/index.html
 258 fi
 259
 260 %post contrib
 261 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 262
 263 %postun contrib
 264 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 265
 266 %post mlbench
 267 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 268
 269 %postun mlbench
 270 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 271
 272 %files base
 273 %defattr(644,root,root,755)
 274 %attr(-,root,root) %{_mandir}/man1/R.1*
 275 %attr(-,root,root) %{_bindir}/R
 276 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R
 277 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/afm
 278 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/bin
 279 # %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/cmd
 280 # %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/demos
 281 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/etc
 282 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/include
 283 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R/library
 284 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/base/
 285 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ctest
 286 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/eda/
 287 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mva/
 288 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/splines
 289 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/stepfun/
 290 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/modules
 291 %attr(-,root,root) %doc CHANGES COPYING COPYRIGHTS MIRROR-SITES PROJECTS README RESOURCES TASKS
 292 %attr(-,root,root) %doc html
 293
 294 %files contrib
 295 %defattr(644,root,root,755)
 296 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/MASS
 297 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/class
 298 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/spatial
 299 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/nnet
 300 %attr(-,root,root) %doc VR
 301 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/acepack
 302 %attr(-,root,root) %doc acepack
 303 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/bootstrap
 304 %attr(-,root,root) %doc bootstrap
 305 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/cluster
 306 %attr(-,root,root) %doc cluster
 307 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/date
 308 %attr(-,root,root) %doc date
 309 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/e1071
 310 %attr(-,root,root) %doc e1071
 311 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/fracdiff
 312 %attr(-,root,root) %doc fracdiff
 313 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/gee
 314 %attr(-,root,root) %doc gee
 315 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/integrate
 316 %attr(-,root,root) %doc integrate
 317 # %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/jpn
 318 # %attr(-,root,root) %doc jpn
 319 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/leaps
 320 %attr(-,root,root) %doc leaps
 321 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/oz
 322 %attr(-,root,root) %doc oz
 323 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/polynom
 324 %attr(-,root,root) %doc polynom
 325 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/princurve
 326 %attr(-,root,root) %doc princurve
 327 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/quadprog
 328 %attr(-,root,root) %doc quadprog
 329 # %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ratetables
 330 # %attr(-,root,root) %doc ratetables
 331 # %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/rational
 332 # %attr(-,root,root) %doc rational
 333 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/survival
 334 %attr(-,root,root) %doc survival
 335 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/xgobi
 336 %attr(-,root,root) %doc xgobi
 337
 338 %files mlbench
 339 %defattr(644,root,root,755)
 340 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mlbench
 341 %attr(-,root,root) %doc mlbench/COPYRIGHT
 342 %attr(-,root,root) %doc mlbench/ChangeLog
 343 %attr(-,root,root) %doc mlbench/README