R.spec

   1 Summary:        A language for data analysis and graphics
   2 Name:           R
   3 Version:        1.1.1
   4 Release:        1
   5 Source0:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
   6 Source1:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.4-1.tar.gz
   7 Source2:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.2-1.tar.gz
   8 Source3:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-5.tar.gz
   9 #Source4:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/class_VR5-4.tar.gz
  10 #Source5:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/clus_1.0-2.tar.gz
  11 #Source6:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/ctest_0.9-1.tar.gz
  12 Source7:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-4.tar.gz
  13 Source8:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_0.9-2.tar.gz
  14 Source9:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-6.tar.gz
  15 Source10:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-3.tar.gz
  16 Source11:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/integrate_2.2-2.tar.gz
  17 #Source12:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/jpn_1.0-1.tar.gz
  18 Source13:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.0.tar.gz
  19 #Source14:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nnet_VR5-3.tar.gz
  20 Source15:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-3.tar.gz
  21 Source16:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-3.tar.gz
  22 #Source17:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/ratetables_1.0-2.tar.gz
  23 #Source18:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rational_1.0-1.tar.gz
  24 #Source19:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/spatial_VR5-2.tar.gz
  25 #Source20:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/splines_2.0-1.tar.gz
  26 Source21:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival5_1.1-5.tar.gz
  27 Source22:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-2.tar.gz
  28 #Source23:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/principal.curve_1.0-2.tar.gz
  29 Source24:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-1.tar.gz
  30 Source31:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench.pdf
  31 Source32:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack.pdf
  32 Source33:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap.pdf
  33 Source37:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date.pdf
  34 Source38:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071.pdf
  35 Source39:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff.pdf
  36 Source40:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee.pdf
  37 Source41:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/intergate.pdf
  38 Source43:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps.pdf
  39 Source45:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz.pdf
  40 Source46:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polymon.pdf
  41 Source51:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival5.pdf
  42 Source52:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi.pdf
  43 Source54:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog.pdf
  44 Patch0:         %{name}-0.61.rpm.patch3
  45 License:        GPL
  46 Group:          Development/Languages
  47 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
  48 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
  49 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  50 Provides:       R-base R-contrib
  51 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  52
  53 %description
  54 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  55 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  56 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  57 script files.
  58
  59 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  60 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
  61 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
  62 implementation and semantics are derived from Scheme.
  63
  64 %package base
  65 Summary:        The R base distribution
  66 Group:          Development/Languages
  67 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
  68 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
  69 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-class R-clus R-ctest R-date R-e1071
  70 Provides:       R-fracdiff R-gee R-integrate R-jpn R-leaps R-mlbench R-nnet R-oz
  71 Provides:       R-polynom R-principal.curve R-quadprog R-ratetables R-rational
  72 Provides:       R-spatial R-splines R-survival4 R-xgobi
  73
  74 %description base
  75 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  76 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
  77 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
  78 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
  79 familiar and a good deal of S software will run without change under
  80 R.
  81
  82 %package contrib
  83 Summary:        contributed packages for the R language
  84 Group:          Development/Languages
  85 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
  86 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
  87 Copyright:      Mixed
  88 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
  89 Requires:       R-base >= %{version}
  90
  91 %description contrib
  92 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
  93 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
  94
  95 %package mlbench
  96 Summary:        Machine learning benchmarks
  97 Group:          Development/Languages
  98 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
  99 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
 100 License:        GPL
 101 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 102 Requires:       R-base >= %{version}
 103
 104 %description mlbench
 105 R package which contains a collection of real-world datasets and
 106 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 107 machine learning methods.
 108
 109 %prep
 110 %setup -q -c -n R-cran -T -b 2
 111 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 112 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 113 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 114 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 115 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 116 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 117 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 118 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 119 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 120 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 121 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 122 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 123 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 124 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 125 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 126 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 127 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 128 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 129 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 130 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 131 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 132 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 133 %setup -q
 134 %setup -q -T -D -a 1
 135 %patch0 -p1
 136 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 137 # We need to remove them to avoid dependency problems
 138 rm ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 139
 140 %build
 141 %{__make}
 142 %{__make} help
 143 %{__make} html
 144 %{__make} clean
 145 %{__make} acclean
 146
 147 # Install contrib packages
 148 #
 149 RHOME=`pwd`;export RHOME
 150 cd ../R-cran
 151 for pkg in `ls`
 152 do
 153 ${RHOME}%{_sysconfdir}/INSTALL -latex ${pkg}
 154 done
 155 cd ${RHOME}
 156
 157 # Install mlbench
 158 #
 159 ${RHOME}%{_sysconfdir}/INSTALL mlbench
 160
 161 #Remove old template files.
 162 #
 163 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 164 do
 165         rm ${oldinfile}
 166 done
 167
 168 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 169 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 170 # documentation, and copy it.
 171 #
 172 mkdir ${RHOME}/contrib
 173 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 174 for pkg in `ls`; do
 175         if [ -d ${pkg} ]; then
 176                 mkdir ${RHOME}/${pkg}
 177                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 178                         case $docfile in
 179                                 INDEX) ;;
 180                                 TITLE) ;;
 181                                 R) ;;
 182                                 man) ;;
 183                                 src) ;;
 184                                 src-c) ;;
 185                                 data) ;;
 186                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${RHOME};;
 187                         esac
 188                 done
 189         fi
 190 done
 191 cd ${RHOME}
 192
 193 %install
 194 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 195 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1
 196 install R.1 ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1/
 197 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 198 cp -R afm bin cmd demos doc etc html include library ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 199 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}
 200 install -m 755 bin/R ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}/R
 201
 202 %files base
 203 %defattr(644,root,root,755)
 204 %attr(-,root,root) %{_mandir}/man1/R.1
 205 %attr(-,root,root) %{_bindir}/R
 206 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R
 207 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/afm
 208 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/bin
 209 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/cmd
 210 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/demos
 211 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R%{_sysconfdir}
 212 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/html
 213 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/include
 214 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R/library
 215 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/base/
 216 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/eda/
 217 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mva/
 218 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/stepfun/
 219 %attr(-,root,root) %doc CHANGES COPYING COPYRIGHTS MIRROR-SITES PROJECTS README RESOURCES TASKS
 220
 221 %files contrib
 222 %defattr(644,root,root,755)
 223 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/acepack
 224 %attr(-,root,root) %doc acepack
 225 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/bootstrap
 226 %attr(-,root,root) %doc bootstrap
 227 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/class
 228 %attr(-,root,root) %doc class
 229 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/clus
 230 %attr(-,root,root) %doc clus
 231 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ctest
 232 %attr(-,root,root) %doc ctest
 233 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/date
 234 %attr(-,root,root) %doc date
 235 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/e1071
 236 %attr(-,root,root) %doc e1071
 237 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/fracdiff
 238 %attr(-,root,root) %doc fracdiff
 239 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/gee
 240 %attr(-,root,root) %doc gee
 241 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/integrate
 242 %attr(-,root,root) %doc integrate
 243 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/jpn
 244 %attr(-,root,root) %doc jpn
 245 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/leaps
 246 %attr(-,root,root) %doc leaps
 247 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/nnet
 248 %attr(-,root,root) %doc nnet
 249 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/oz
 250 %attr(-,root,root) %doc oz
 251 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/polynom
 252 %attr(-,root,root) %doc polynom
 253 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ratetables
 254 %attr(-,root,root) %doc ratetables
 255 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/rational
 256 %attr(-,root,root) %doc rational
 257 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/spatial
 258 %attr(-,root,root) %doc spatial
 259 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/splines
 260 %attr(-,root,root) %doc splines
 261 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/survival4
 262 %attr(-,root,root) %doc survival4
 263 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/xgobi
 264 %attr(-,root,root) %doc xgobi
 265 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/principal.curve
 266 %attr(-,root,root) %doc principal.curve
 267 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/quadprog
 268 %attr(-,root,root) %doc quadprog
 269
 270 %files mlbench
 271 %defattr(644,root,root,755)
 272 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mlbench
 273 %attr(-,root,root) %doc mlbench/COPYRIGHT
 274 %attr(-,root,root) %doc mlbench/ChangeLog
 275 %attr(-,root,root) %doc mlbench/README
 276
 277 %clean
 278 rm -rf ${RPM_BUILD_ROOT}
 279
 280 %post base
 281 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 282
 283 %preun base
 284 # These files are not owned by any package, so we have to remove them
 285 # but only if this is the last version of R-base on the system.
 286 #
 287 if [ "$1" = 0 ];
 288 then
 289         rm -f %{_libdir}/R/library/LibIndex
 290         rm -f %{_libdir}/R/library/index.html
 291 fi
 292
 293 %post contrib
 294 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 295
 296 %postun contrib
 297 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 298
 299 %post mlbench
 300 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 301
 302 %postun mlbench
 303 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)