R.spec

   1 #
   2 # Conditional build:
   3 # _without_gnome        - without gnome support
   4 #
   5 Summary:        A language for data analysis and graphics
   6 Summary(pl):    Jêzyk do analizy danych oraz grafiki
   7 Name:           R
   8 Version:        1.3.1
   9 Release:        1
  10 Source0:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
  11 Source1:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.5-2.tar.gz
  12 Source2:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.3.tar.gz
  13 Source3:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-7.tar.gz
  14 Source4:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/VR_6.2-9.tar.gz
  15 Source5:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/cluster_1.3-4.tar.gz
  16 # Source6:      ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/ctest_0.9-1.tar.gz
  17 Source7:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-9.tar.gz
  18 Source8:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_1.2-0.tar.gz
  19 Source9:        ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-6.tar.gz
  20 Source10:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-5.tar.gz
  21 Source11:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/integrate_2.2-3.tar.gz
  22 # Source12:     ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/jpn_1.0-1.tar.gz
  23 Source13:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.1-1.tar.gz
  24 Source15:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-6.tar.gz
  25 Source16:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-7.tar.gz
  26 # Source17:     ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/ratetables_1.0-2.tar.gz
  27 # Source18:     ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rational_1.0-1.tar.gz
  28 # Source20:     ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/splines_2.0-1.tar.gz
  29 Source21:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival_2.6.tar.gz
  30 Source22:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-4.tar.gz
  31 Source23:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/princurve_1.1-2.tar.gz
  32 Source24:       ftp://ftp.stat.math.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-3.tar.gz
  33 # Patch0:               %{name}-0.61.rpm.patch3
  34 License:        GPL
  35 Group:          Development/Languages
  36 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
  37 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
  38 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  39 Provides:       R-base R-contrib
  40 BuildRequires:  libstdc++-devel
  41 BuildRequires:  gcc-c++
  42 BuildRequires:  gcc-g77
  43 BuildRequires:  perl >= 5
  44 BuildRequires:  libtool
  45 BuildRequires:  tetex-latex
  46 BuildRequires:  tetex-dvips
  47 BuildRequires:  tetex-pdftex
  48 BuildRequires:  zip
  49 BuildRequires:  XFree86-devel
  50 BuildRequires:  libpng-devel >= 1.0.5
  51 BuildRequires:  libjpeg-devel >= 6b
  52 BuildRequires:  zlib >= 1.1.3
  53 BuildRequires:  readline-devel
  54 BuildRequires:  lpr
  55 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       gnome-libs-devel}
  56 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       ORBit-devel}
  57 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       libglade-devel}
  58 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  59
  60 %description
  61 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  62 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  63 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  64 script files.
  65
  66 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  67 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
  68 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
  69 implementation and semantics are derived from Scheme.
  70
  71 %description -l pl
  72 System do obliczeñ statystycznych i grafiki. R sk³ada siê z jêzyka
  73 oraz ¶rodowiska uruchomieniowego z grafik±, debuggerem, dostêpem do
  74 niektórych funkcji systemowych oraz mo¿liwo¶ci± uruchamiania programów
  75 zapisanych w skryptach.
  76
  77 Jêzyk R by³ zainspirowany dwoma istniej±cymi jêzykami: S (Beckera,
  78 Chambersa i Wilksa) oraz Scheme (Sussmana). R jest podobny do S, ale
  79 implementacja i semantyka wywodzi siê ze Scheme.
  80
  81 %package base
  82 Summary:        The R base distribution
  83 Summary(pl):    Podstawowa dystrybucja R
  84 Group:          Development/Languages
  85 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
  86 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
  87 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-VR R-cluster R-ctest R-date R-e1071
  88 Provides:       R-fracdiff R-gee R-integrate R-jpn R-leaps R-mlbench R-oz
  89 Provides:       R-polynom R-princurve R-quadprog R-ratetables R-rational
  90 Provides:       R-splines R-survival R-xgobi
  91 Obsoletes:      R-principal.curve R-survival4 R-clus R-class R-nnet R-spatial
  92
  93 %description base
  94 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  95 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
  96 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
  97 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
  98 familiar and a good deal of S software will run without change under
  99 R.
 100
 101 %description base -l pl
 102 R jest jêzykiem i ¶rodowiskiem uruchomieniowym do interaktywnej
 103 analizy danych statystycznych. R nie jest ca³kowicie zgodny z jêzykiem
 104 S opracowanym w AT&T Bell Laboratiories (a teraz Lucent Technologies),
 105 mimo to u¿ytkownicy S zauwa¿± zbli¿one ¶rodowisko, a du¿a czê¶æ
 106 oprogramowania w S bêdzie dzia³a³a bez zmian w R.
 107
 108 %package contrib
 109 Summary:        Contributed packages for the R language
 110 Summary(pl):    Dodatkowe pakiety do jêzyka R
 111 Group:          Development/Languages
 112 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
 113 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
 114 Copyright:      Mixed
 115 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 116 Requires:       R-base >= %{version}
 117
 118 %description contrib
 119 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 120 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 121
 122 %description contrib -l pl
 123 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 124 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 125
 126 %package mlbench
 127 Summary:        Machine learning benchmarks
 128 Summary(pl):    Testy wydajno¶ci uczenia maszyny
 129 Group:          Development/Languages
 130 Group(de):      Entwicklung/Sprachen
 131 Group(pl):      Programowanie/Jêzyki
 132 License:        GPL
 133 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 134 Requires:       R-base >= %{version}
 135
 136 %description mlbench
 137 R package which contains a collection of real-world datasets and
 138 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 139 machine learning methods.
 140
 141 %description mlbench -l pl
 142 Ten podpakiet R zawiera zestaw rzeczywistych danych i funkcji do
 143 zrobienia sztucznych danych dzia³aj±cych jako test wydajno¶ci metod
 144 uczenia maszyny.
 145
 146 %prep
 147 %setup -q -c -n R-cran -T -b 2
 148 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 149 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 150 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 151 # %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 152 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 153 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 154 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 155 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 156 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 157 # %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 158 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 159 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 160 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 161 # %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 162 # %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 163 # %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 164 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 165 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 166 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 167 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 168 %setup -q
 169 %setup -q -T -D -a 1
 170 # %patch0 -p1
 171 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 172 # We need to remove them to avoid dependency problems
 173 rm -f ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 174
 175 %build
 176 %configure2_13 \
 177         %{!?_without_gnome:--with-gnome} \
 178         %{?_without_gnome:--without-gnome} \
 179         --without-tcltk
 180
 181 %{__make}
 182 %{__make} help
 183 %{__make} html
 184 %{__make} clean
 185 %{__make} acclean
 186
 187 # Install contrib packages
 188 #
 189 RHOME=`pwd`;export RHOME
 190 cd ../R-cran
 191 for pkg in `ls`
 192 do
 193 ${RHOME}%{_sysconfdir}/INSTALL -latex ${pkg}
 194 done
 195 cd ${RHOME}
 196
 197 # Install mlbench
 198 #
 199 ${RHOME}%{_sysconfdir}/INSTALL mlbench
 200
 201 #Remove old template files.
 202 #
 203 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 204 do
 205         rm ${oldinfile}
 206 done
 207
 208 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 209 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 210 # documentation, and copy it.
 211 #
 212 mkdir ${RHOME}/contrib
 213 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 214 for pkg in `ls`; do
 215         if [ -d ${pkg} ]; then
 216                 mkdir ${RHOME}/${pkg}
 217                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 218                         case $docfile in
 219                                 INDEX) ;;
 220                                 TITLE) ;;
 221                                 R) ;;
 222                                 man) ;;
 223                                 src) ;;
 224                                 src-c) ;;
 225                                 data) ;;
 226                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${RHOME};;
 227                         esac
 228                 done
 229         fi
 230 done
 231 cd ${RHOME}
 232
 233 %install
 234 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 235 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1
 236 install R.1 ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1/
 237 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 238 cp -R afm bin cmd demos doc etc html include library ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 239 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}
 240 install -m 755 bin/R ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}/R
 241
 242 %clean
 243 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 244
 245 %post base
 246 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 247
 248 %preun base
 249 # These files are not owned by any package, so we have to remove them
 250 # but only if this is the last version of R-base on the system.
 251 #
 252 if [ "$1" = 0 ];
 253 then
 254         rm -f %{_libdir}/R/library/LibIndex
 255         rm -f %{_libdir}/R/library/index.html
 256 fi
 257
 258 %post contrib
 259 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 260
 261 %postun contrib
 262 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 263
 264 %post mlbench
 265 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 266
 267 %postun mlbench
 268 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 269
 270 %files base
 271 %defattr(644,root,root,755)
 272 %attr(-,root,root) %{_mandir}/man1/R.1
 273 %attr(-,root,root) %{_bindir}/R
 274 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R
 275 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/afm
 276 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/bin
 277 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/cmd
 278 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/demos
 279 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R%{_sysconfdir}
 280 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/html
 281 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/include
 282 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R/library
 283 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/base/
 284 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/eda/
 285 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mva/
 286 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/stepfun/
 287 %attr(-,root,root) %doc CHANGES COPYING COPYRIGHTS MIRROR-SITES PROJECTS README RESOURCES TASKS
 288
 289 %files contrib
 290 %defattr(644,root,root,755)
 291 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/acepack
 292 %attr(-,root,root) %doc acepack
 293 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/bootstrap
 294 %attr(-,root,root) %doc bootstrap
 295 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/class
 296 %attr(-,root,root) %doc class
 297 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/clus
 298 %attr(-,root,root) %doc clus
 299 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ctest
 300 %attr(-,root,root) %doc ctest
 301 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/date
 302 %attr(-,root,root) %doc date
 303 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/e1071
 304 %attr(-,root,root) %doc e1071
 305 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/fracdiff
 306 %attr(-,root,root) %doc fracdiff
 307 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/gee
 308 %attr(-,root,root) %doc gee
 309 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/integrate
 310 %attr(-,root,root) %doc integrate
 311 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/jpn
 312 %attr(-,root,root) %doc jpn
 313 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/leaps
 314 %attr(-,root,root) %doc leaps
 315 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/nnet
 316 %attr(-,root,root) %doc nnet
 317 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/oz
 318 %attr(-,root,root) %doc oz
 319 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/polynom
 320 %attr(-,root,root) %doc polynom
 321 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ratetables
 322 %attr(-,root,root) %doc ratetables
 323 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/rational
 324 %attr(-,root,root) %doc rational
 325 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/spatial
 326 %attr(-,root,root) %doc spatial
 327 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/splines
 328 %attr(-,root,root) %doc splines
 329 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/survival4
 330 %attr(-,root,root) %doc survival4
 331 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/xgobi
 332 %attr(-,root,root) %doc xgobi
 333 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/principal.curve
 334 %attr(-,root,root) %doc principal.curve
 335 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/quadprog
 336 %attr(-,root,root) %doc quadprog
 337
 338 %files mlbench
 339 %defattr(644,root,root,755)
 340 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mlbench
 341 %attr(-,root,root) %doc mlbench/COPYRIGHT
 342 %attr(-,root,root) %doc mlbench/ChangeLog
 343 %attr(-,root,root) %doc mlbench/README