R.spec

   1 #
   2 # Conditional build:
   3 # _without_gnome        - without gnome support
   4 #
   5 Summary:        A language for data analysis and graphics
   6 Summary(pl):    Jêzyk do analizy danych oraz grafiki
   7 Name:           R
   8 Version:        1.4.1
   9 Release:        2
  10 Source0:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
  11 Source1:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/KernSmooth_2.22-7.tar.gz
  12 Source2:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/VR_6.3-2.tar.gz
  13 Source3:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.3.tar.gz
  14 Source4:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/boot_1.2-7.tar.gz
  15 Source5:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-9.tar.gz
  16 Source6:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/cluster_1.4-0.tar.gz
  17 Source7:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-12.tar.gz
  18 Source8:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_1.2-1.tar.gz
  19 Source9:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/foreign_0.4-9.tar.gz
  20 Source10:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-7.tar.gz
  21 Source11:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-6.tar.gz
  22 Source12:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.4.tar.gz
  23 Source13:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mgcv_0.7-1.tar.gz
  24 Source14:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.5-4.tar.gz
  25 Source15:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nlme_3.1-23.tar.gz
  26 Source16:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-6.tar.gz
  27 Source17:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-8.tar.gz
  28 Source18:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/princurve_1.1-3.tar.gz
  29 Source19:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-4.tar.gz
  30 Source20:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rpart_3.1-5.tar.gz
  31 Source21:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival_2.8-2.tar.gz
  32 Source22:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-5.tar.gz
  33 Source23:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/Archive/integrate_2.2-3.tar.gz
  34 License:        Mixed (distributable), mostly GPL
  35 Group:          Development/Languages
  36 URL:            http://stat.auckland.ac.nz/r/r.html
  37 Provides:       R-base R-contrib
  38 BuildRequires:  autoconf
  39 BuildRequires:  automake
  40 BuildRequires:  libstdc++-devel
  41 BuildRequires:  gcc-c++
  42 BuildRequires:  gcc-g77
  43 BuildRequires:  perl >= 5.004
  44 BuildRequires:  libtool
  45 BuildRequires:  tetex-latex
  46 BuildRequires:  tetex-dvips
  47 BuildRequires:  tetex-pdftex
  48 BuildRequires:  zip
  49 BuildRequires:  XFree86-devel
  50 BuildRequires:  libpng-devel >= 1.0.5
  51 BuildRequires:  libjpeg-devel >= 6b
  52 BuildRequires:  libxml-devel
  53 BuildRequires:  zlib >= 1.1.3
  54 BuildRequires:  readline-devel
  55 #BuildRequires: lpr
  56 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       gnome-libs-devel}
  57 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       ORBit-devel}
  58 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       libglade-devel}
  59 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  60
  61 %description
  62 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  63 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  64 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  65 script files.
  66
  67 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  68 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
  69 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
  70 implementation and semantics are derived from Scheme.
  71
  72 %description -l pl
  73 System do obliczeñ statystycznych i grafiki. R sk³ada siê z jêzyka
  74 oraz ¶rodowiska uruchomieniowego z grafik±, debuggerem, dostêpem do
  75 niektórych funkcji systemowych oraz mo¿liwo¶ci± uruchamiania programów
  76 zapisanych w skryptach.
  77
  78 Jêzyk R by³ zainspirowany dwoma istniej±cymi jêzykami: S (Beckera,
  79 Chambersa i Wilksa) oraz Scheme (Sussmana). R jest podobny do S, ale
  80 implementacja i semantyka wywodzi siê ze Scheme.
  81
  82 %package base
  83 Summary:        The R base distribution
  84 Summary(pl):    Podstawowa dystrybucja R
  85 Group:          Development/Languages
  86 Provides:       R-ctest R-eda R-lqs R-methods R-modreg R-mva R-nls R-splines
  87 Provides:       R-stepfun R-tcltk R-tools R-ts
  88 License:        GPL v2 / LGPL
  89
  90 %description base
  91 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
  92 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
  93 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
  94 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
  95 familiar and a good deal of S software will run without change under
  96 R.
  97
  98 %description base -l pl
  99 R jest jêzykiem i ¶rodowiskiem uruchomieniowym do interaktywnej
 100 analizy danych statystycznych. R nie jest ca³kowicie zgodny z jêzykiem
 101 S opracowanym w AT&T Bell Laboratiories (a teraz Lucent Technologies),
 102 mimo to u¿ytkownicy S zauwa¿± zbli¿one ¶rodowisko, a du¿a czê¶æ
 103 oprogramowania w S bêdzie dzia³a³a bez zmian w R.
 104
 105 %package recommended
 106 Summary:        Recommended contributed packages for the R language
 107 Summary(pl):    Zalecane dodatkowe pakiety do jêzyka R
 108 Group:          Development/Languages
 109 Provides:       R-KernSmooth R-VR R-boot R-cluster R-foreign R-mgcv R-nlme
 110 Provides:       R-rpart R-survival
 111 License:        GPL, free or free for non-commercial use
 112 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 113 Requires:       R-base >= %{version}
 114 Obsoletes:      R-survival4 R-MASS R-clus R-class R-nnet R-spatial
 115
 116 %description recommended
 117 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 118 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 119
 120 %description recommended -l pl
 121 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 122 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 123
 124 %package contrib
 125 Summary:        Contributed packages for the R language
 126 Summary(pl):    Dodatkowe pakiety do jêzyka R
 127 Group:          Development/Languages
 128 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-date R-e1071 R-fracdiff R-gee
 129 Provides:       R-integrate R-leaps R-oz R-polynom R-princurve R-quadprog
 130 Provides:       R-xgobi
 131 License:        Mixed
 132 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 133 Requires:       R-base >= %{version}
 134 Requires:       R-VR
 135 Obsoletes:      R-principal.curve
 136
 137 %description contrib
 138 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 139 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 140
 141 %description contrib -l pl
 142 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 143 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 144
 145 %package mlbench
 146 Summary:        Machine learning benchmarks
 147 Summary(pl):    Testy wydajno¶ci uczenia maszyny
 148 Group:          Development/Languages
 149 License:        GPL
 150 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 151 Requires:       R-base >= %{version}
 152
 153 %description mlbench
 154 R package which contains a collection of real-world datasets and
 155 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 156 machine learning methods.
 157
 158 %description mlbench -l pl
 159 Ten podpakiet R zawiera zestaw rzeczywistych danych i funkcji do
 160 tworzenia sztucznych danych s³u¿±cych jako test wydajno¶ci metod
 161 uczenia maszyny.
 162
 163 %prep
 164 %setup -q -c -n R-cran -T -b 1
 165 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 2
 166 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 167 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 168 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 169 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 170 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 171 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 172 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 173 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 174 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 175 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 176 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 177 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 178 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 179 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 180 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 181 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 182 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 183 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 184 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 185 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 186 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 187 %setup -q
 188 #%setup -q -T -D -a 14
 189
 190 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 191 # We need to remove them to avoid dependency problems
 192 rm -f ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 193
 194 %build
 195 aclocal
 196 autoconf
 197 %configure \
 198 #%configure2_13 \
 199         %{!?_without_gnome:--with-gnome} \
 200         %{?_without_gnome:--without-gnome} \
 201         --without-tcltk
 202
 203 %{__make}
 204 %{__make} help
 205 %{__make} html
 206 %{__make} clean
 207 # %{__make} acclean
 208
 209 # Install contrib packages
 210 #
 211 R_HOME=`pwd`;export R_HOME
 212 PERL5LIB=`pwd`/share/perl;export PERL5LIB
 213 cd ../R-cran
 214 for pkg in `ls`
 215 do
 216 ${R_HOME}/bin/INSTALL ${pkg}
 217 done
 218 cd ${R_HOME}
 219
 220 #Remove old template files.
 221 #
 222 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 223 do
 224         mv ${oldinfile} ${oldinfile}.old
 225 #       rm ${oldinfile}
 226 done
 227
 228 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 229 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 230 # documentation, and copy it.
 231 #
 232 mkdir ${R_HOME}/contrib
 233 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 234 for pkg in `ls`; do
 235         if [ -d ${pkg} ]; then
 236                 mkdir ${R_HOME}/${pkg}
 237                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 238                         case $docfile in
 239                                 INDEX) ;;
 240                                 TITLE) ;;
 241                                 R) ;;
 242                                 man) ;;
 243                                 src) ;;
 244                                 src-c) ;;
 245                                 data) ;;
 246                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${R_HOME};;
 247                         esac
 248                 done
 249         fi
 250 done
 251 cd ${R_HOME}
 252
 253 %install
 254 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 255 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1
 256 install doc/R.1 ${RPM_BUILD_ROOT}%{_mandir}/man1/
 257 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 258 # cp -R afm bin cmd demos doc etc html include library ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 259 cp -R afm bin doc etc include library modules ${RPM_BUILD_ROOT}%{_libdir}/R
 260 install -d ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}
 261 install -m 755 bin/R ${RPM_BUILD_ROOT}%{_bindir}/R
 262
 263 %clean
 264 # rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 265
 266 %post base
 267 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 268
 269 %preun base
 270 # These files are not owned by any package, so we have to remove them
 271 # but only if this is the last version of R-base on the system.
 272 #
 273 if [ "$1" = 0 ];
 274 then
 275         rm -f %{_libdir}/R/library/LibIndex
 276         rm -f %{_libdir}/R/library/index.html
 277 fi
 278
 279 %post contrib
 280 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 281
 282 %postun contrib
 283 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 284
 285 %post mlbench
 286 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 287
 288 %postun mlbench
 289 (cd %{_libdir}/R/library; cat */TITLE > LibIndex; ../etc/build-htmlpkglist)
 290
 291 %files base
 292 %defattr(644,root,root,755)
 293 %attr(-,root,root) %{_mandir}/man1/R.1*
 294 %attr(-,root,root) %{_bindir}/R
 295 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R
 296 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/afm
 297 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/bin
 298 # %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/cmd
 299 # %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/demos
 300 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/etc
 301 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/include
 302 %attr(-,root,root) %dir %{_libdir}/R/library
 303 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/base
 304 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ctest
 305 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/eda
 306 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/lqs
 307 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/methods
 308 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/modreg
 309 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mva
 310 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/nls
 311 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/splines
 312 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/stepfun
 313 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/tcltk
 314 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/tools
 315 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/ts
 316 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/modules
 317 %attr(-,root,root) %doc CHANGES COPYING COPYRIGHTS MIRROR-SITES PROJECTS README RESOURCES TASKS
 318 %attr(-,root,root) %doc html
 319
 320 %files recommended
 321 %defattr(644,root,root,755)
 322 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/MASS
 323 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/class
 324 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/nnet
 325 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/spatial
 326 %attr(-,root,root) %doc VR
 327 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/KernSmooth
 328 %attr(-,root,root) %doc KernSmooth
 329 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/boot
 330 %attr(-,root,root) %doc boot
 331 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/cluster
 332 %attr(-,root,root) %doc cluster
 333 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/foreign
 334 %attr(-,root,root) %doc foreign
 335 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mgcv
 336 %attr(-,root,root) %doc mgcv
 337 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/nlme
 338 %attr(-,root,root) %doc nlme
 339 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/rpart
 340 %attr(-,root,root) %doc rpart
 341 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/survival
 342 %attr(-,root,root) %doc survival
 343
 344 %files contrib
 345 %defattr(644,root,root,755)
 346 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/acepack
 347 %attr(-,root,root) %doc acepack
 348 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/bootstrap
 349 %attr(-,root,root) %doc bootstrap
 350 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/date
 351 %attr(-,root,root) %doc date
 352 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/e1071
 353 %attr(-,root,root) %doc e1071
 354 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/fracdiff
 355 %attr(-,root,root) %doc fracdiff
 356 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/gee
 357 %attr(-,root,root) %doc gee
 358 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/integrate
 359 %attr(-,root,root) %doc integrate
 360 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/leaps
 361 %attr(-,root,root) %doc leaps
 362 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/oz
 363 %attr(-,root,root) %doc oz
 364 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/polynom
 365 %attr(-,root,root) %doc polynom
 366 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/princurve
 367 %attr(-,root,root) %doc princurve
 368 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/quadprog
 369 %attr(-,root,root) %doc quadprog
 370 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/xgobi
 371 %attr(-,root,root) %doc xgobi
 372
 373 %files mlbench
 374 %defattr(644,root,root,755)
 375 %attr(-,root,root) %{_libdir}/R/library/mlbench
 376 %attr(-,root,root) %doc mlbench