R.spec

   1 #
   2 # Conditional build:
   3 # _without_gnome        - without GNOME support
   4 #
   5 Summary:        A language for data analysis and graphics
   6 Summary(pl):    Jêzyk do analizy danych oraz grafiki
   7 Name:           R
   8 Version:        1.8.0
   9 Release:        3
  10 License:        Mixed (distributable), mostly GPL
  11 Group:          Development/Languages
  12 # CRAN master site: ftp://cran.r-project.org/pub/R/src/
  13 Source0:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/base/%{name}-%{version}.tgz
  14 # Source0-md5:  bb019d7e12e38ac8a8bc247f06cc6b42
  15 Source1:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/KernSmooth_2.22-12.tar.gz
  16 # Source1-md5:  11be129834df04aa85818dad52910695
  17 Source2:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/VR_7.1-11.tar.gz
  18 # Source2-md5:  75e444a513e1e726497451485ca9aa86
  19 Source3:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/acepack_1.3-2.tar.gz
  20 # Source3-md5:  334452ea1a1ba351154aea9c4eb9912d
  21 Source4:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/boot_1.2-15.tar.gz
  22 # Source4-md5:  930940da4c44258d723e90168b143d1f
  23 Source5:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/bootstrap_1.0-12.tar.gz
  24 # Source5-md5:  6860c7d62ab95756267be774bcf60578
  25 Source6:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/cluster_1.7.6.tar.gz
  26 # Source6-md5:  382e2363ee8a5dd653e4d82e63779119
  27 Source7:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/date_1.2-16.tar.gz
  28 # Source7-md5:  ca4ad419fc541ae2d287f8224e1cae9e
  29 Source8:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/e1071_1.3-13.tar.gz
  30 # Source8-md5:  4cb16ec571dfd26337c4d566a2898a39
  31 Source9:        ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/foreign_0.6-3.tar.gz
  32 # Source9-md5:  13f982b0e4aa2d48da837c956826e174
  33 Source10:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/fracdiff_1.0-9.tar.gz
  34 # Source10-md5: 63ccdfac75f807cc71b49d4283fdf81e
  35 Source11:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/gee_4.13-10.tar.gz
  36 # Source11-md5: 7f32a7f7b022dd366d27482a3561d2a6
  37 Source12:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/grid_0.7-1.tar.gz
  38 # Source12-md5: 01cfb0d1c1fa134bb05b2844572edf8e
  39 Source13:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/lattice_0.8-7.tar.gz
  40 # Source13-md5: c9b8f83ed7c1cdfbbc1d9aec545150ce
  41 Source14:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/leaps_2.6.tar.gz
  42 # Source14-md5: 571be13c4ad944b1087727b7992ac3c1
  43 Source15:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mgcv_0.9-6.tar.gz
  44 # Source15-md5: 00dbd822c26680cc6be84367300437e4
  45 Source16:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/mlbench_0.5-10.tar.gz
  46 # Source16-md5: e3ab15bed59ec49fcfc0a4a3d47f12fb
  47 Source17:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/nlme_3.1-45.tar.gz
  48 # Source17-md5: 6d3ebd4c740b2d6a0828cace2c48342b
  49 Source18:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/oz_1.0-7.tar.gz
  50 # Source18-md5: d5e8622a6e31dc395666037fd32258fe
  51 Source19:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/polynom_1.1-11.tar.gz
  52 # Source19-md5: 4714e280ecb678ee618a656eb69d6b22
  53 Source20:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/princurve_1.1-5.tar.gz
  54 # Source20-md5: d0092745f92687c54b055e2770fd6e5b
  55 Source21:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/quadprog_1.4-6.tar.gz
  56 # Source21-md5: 2289360d0066341ec79a5ff1371b7ec0
  57 Source22:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/rpart_3.1-13.tar.gz
  58 # Source22-md5: 6b417adf2803c1239da6d5c457564416
  59 Source23:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/survival_2.9-15.tar.gz
  60 # Source23-md5: 88d086feec43c5a78f65c52eccd54713
  61 Source24:       ftp://stat.ethz.ch/R-CRAN/src/contrib/xgobi_1.2-10.tar.gz
  62 # Source24-md5: 1319f1efed55d79add90a5bd65bb32ca
  63 Source26:       %{name}.desktop
  64 URL:            http://www.r-project.org/
  65 BuildRequires:  XFree86-devel
  66 BuildRequires:  autoconf
  67 BuildRequires:  automake
  68 BuildRequires:  blas-devel
  69 BuildRequires:  gcc-c++
  70 BuildRequires:  gcc-g77
  71 BuildRequires:  libjpeg-devel >= 6b
  72 BuildRequires:  libpng-devel >= 1.0.5
  73 BuildRequires:  libstdc++-devel
  74 BuildRequires:  libtool
  75 BuildRequires:  libxml-devel
  76 BuildRequires:  perl-base >= 1:5.6
  77 BuildRequires:  readline-devel
  78 BuildRequires:  tetex-latex
  79 BuildRequires:  tetex-dvips
  80 BuildRequires:  tetex-pdftex
  81 BuildRequires:  zip
  82 BuildRequires:  zlib >= 1.1.3
  83 #BuildRequires: lpr
  84 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       gnome-libs-devel}
  85 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       ORBit-devel}
  86 %{!?_without_gnome:BuildRequires:       libglade-gnome-devel}
  87 Provides:       R-base
  88 Provides:       R-contrib
  89 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  90
  91 %description
  92 A system for statistical computation and graphics. R consists of a
  93 language plus a run-time environment with graphics, a debugger, access
  94 to certain system functions, and the ability to run programs stored in
  95 script files.
  96
  97 The design of R has been heavily influenced by two existing languages:
  98 Becker, Chambers & Wilks' S and Sussman's Scheme. Whereas the
  99 resulting language is very similar in appearance to S, the underlying
 100 implementation and semantics are derived from Scheme.
 101
 102 %description -l pl
 103 System do obliczeñ statystycznych i grafiki. R sk³ada siê z jêzyka
 104 oraz ¶rodowiska uruchomieniowego z grafik±, debuggerem, dostêpem do
 105 niektórych funkcji systemowych oraz mo¿liwo¶ci± uruchamiania programów
 106 zapisanych w skryptach.
 107
 108 Jêzyk R by³ zainspirowany dwoma istniej±cymi jêzykami: S (Beckera,
 109 Chambersa i Wilksa) oraz Scheme (Sussmana). R jest podobny do S, ale
 110 implementacja i semantyka wywodzi siê ze Scheme.
 111
 112 %package base
 113 Summary:        The R base distribution
 114 Summary(pl):    Podstawowa dystrybucja R
 115 License:        GPL v2 / LGPL
 116 Group:          Development/Languages
 117 Requires(post): textutils
 118 Requires(post): perl
 119 Provides:       R-ctest R-eda R-lqs R-methods R-modreg R-mva R-nls R-splines
 120 Provides:       R-stepfun R-tcltk R-tools R-ts
 121
 122 %description base
 123 R is a language and run-time environment for carrying out interactive
 124 statistical data analysis. It is not entirely dissimilar to the S
 125 language developed at AT&T Bell Laboratories (and now Lucent
 126 Technologies). Indeed, S users will find the environment quite
 127 familiar and a good deal of S software will run without change under
 128 R.
 129
 130 %description base -l pl
 131 R jest jêzykiem i ¶rodowiskiem uruchomieniowym do interaktywnej
 132 analizy danych statystycznych. R nie jest ca³kowicie zgodny z jêzykiem
 133 S opracowanym w AT&T Bell Laboratiories (a teraz Lucent Technologies),
 134 mimo to u¿ytkownicy S zauwa¿± zbli¿one ¶rodowisko, a du¿a czê¶æ
 135 oprogramowania w S bêdzie dzia³a³a bez zmian w R.
 136
 137 %package recommended
 138 Summary:        Recommended contributed packages for the R language
 139 Summary(pl):    Zalecane dodatkowe pakiety do jêzyka R
 140 Group:          Development/Languages
 141 Provides:       R-KernSmooth R-VR R-boot R-cluster R-foreign R-grid
 142 Provides:       R-lattice R-mgcv R-nlme R-rpart R-survival
 143 License:        GPL, free or free for non-commercial use
 144 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 145 Requires(post,postun):  R-base
 146 Requires(post,postun):  textutils
 147 Requires(post,postun):  perl
 148 Requires:       R-base >= %{version}
 149 Obsoletes:      R-survival4 R-MASS R-clus R-class R-nnet R-spatial
 150
 151 %description recommended
 152 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 153 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 154
 155 %description recommended -l pl
 156 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 157 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 158
 159 %package contrib
 160 Summary:        Contributed packages for the R language
 161 Summary(pl):    Dodatkowe pakiety do jêzyka R
 162 License:        Mixed
 163 Group:          Development/Languages
 164 URL:            http://www.ci.tuwien.ac.at/R/
 165 Requires(post,postun):  R-base
 166 Requires(post,postun):  textutils
 167 Requires(post,postun):  perl
 168 Requires:       R-base >= %{version}
 169 Requires:       R-VR
 170 Provides:       R-acepack R-bootstrap R-date R-e1071 R-fracdiff R-gee
 171 Provides:       R-leaps R-oz R-polynom R-princurve R-quadprog
 172 Provides:       R-xgobi
 173 Obsoletes:      R-principal.curve
 174
 175 %description contrib
 176 Packages which extend the capabilities of the R base distribution and
 177 are distributed on the Comprehensive R Archive Network (CRAN).
 178
 179 %description contrib -l pl
 180 Pakiety rozszerzaj±ce mo¿liwo¶ci podstawowej dystrybucji jêzyka R,
 181 dystrubuowane w archiwum CRAN (Comprehensive R Archive Network).
 182
 183 %package mlbench
 184 Summary:        Machine learning benchmarks
 185 Summary(pl):    Testy wydajno¶ci uczenia maszyny
 186 Group:          Development/Languages
 187 License:        GPL
 188 URL:            http://www.ics.uci.edu/~mlearn/MLRepository.html
 189 Requires(post,postun):  R-base
 190 Requires(post,postun):  textutils
 191 Requires(post,postun):  perl
 192 Requires:       R-base >= %{version}
 193
 194 %description mlbench
 195 R package which contains a collection of real-world datasets and
 196 functions for creating artificial datasets that work as benchmarks for
 197 machine learning methods.
 198
 199 %description mlbench -l pl
 200 Ten podpakiet R zawiera zestaw rzeczywistych danych i funkcji do
 201 tworzenia sztucznych danych s³u¿±cych jako test wydajno¶ci metod
 202 uczenia maszyny.
 203
 204 %prep
 205 %setup -q -c -n R-cran -T -b 1
 206 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 2
 207 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 3
 208 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 4
 209 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 5
 210 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 6
 211 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 7
 212 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 8
 213 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 9
 214 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 10
 215 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 11
 216 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 12
 217 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 13
 218 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 14
 219 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 15
 220 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 16
 221 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 17
 222 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 18
 223 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 19
 224 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 20
 225 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 21
 226 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 22
 227 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 23
 228 %setup -q -c -n R-cran -T -D -b 24
 229 %setup -q
 230 #%setup -q -T -D -a 14
 231
 232 # These files have the path for PERL hard-coded as /usr/local/bin/perl
 233 # We need to remove them to avoid dependency problems
 234 rm -f ./doc/keyword-test.orig ./etc/undoc/R-funs.orig ./etc/undoc/extrExamp.orig
 235
 236 %build
 237 %{__aclocal}
 238 %{__autoconf}
 239 cp -f /usr/share/automake/config.* .
 240 %configure \
 241         %{!?_without_gnome:--with-gnome} \
 242         %{?_without_gnome:--without-gnome} \
 243         --without-tcltk
 244
 245 %{__make}
 246 %{__make} help
 247 %{__make} html
 248 %{__make} clean
 249
 250 # Install contrib packages
 251 #
 252 R_HOME=`pwd`;export R_HOME
 253 PERL5LIB=`pwd`/share/perl;export PERL5LIB
 254 cd ../R-cran
 255 for pkg in `ls`
 256 do
 257 ${R_HOME}/bin/INSTALL ${pkg}
 258 done
 259 cd ${R_HOME}
 260
 261 #Remove old template files.
 262 #
 263 for oldinfile in `find . -name '*.in' -print`
 264 do
 265         mv ${oldinfile} ${oldinfile}.old
 266 #       rm ${oldinfile}
 267 done
 268
 269 # Gather documentation from contrib packages in one directory
 270 # Assume that anything not in one of the standard directories is
 271 # documentation, and copy it.
 272 #
 273 mkdir ${R_HOME}/contrib
 274 cd ${RPM_BUILD_DIR}/R-cran
 275 for pkg in `ls`; do
 276         if [ -d ${pkg} ]; then
 277                 mkdir ${R_HOME}/${pkg}
 278                 for docfile in `ls ${pkg}`; do
 279                         case $docfile in
 280                                 INDEX) ;;
 281                                 TITLE) ;;
 282                                 R) ;;
 283                                 man) ;;
 284                                 src) ;;
 285                                 src-c) ;;
 286                                 data) ;;
 287                                 *) cp -R -P ${pkg}/${docfile} ${R_HOME};;
 288                         esac
 289                 done
 290         fi
 291 done
 292 cd ${R_HOME}
 293
 294 %install
 295 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 296 install -d $RPM_BUILD_ROOT{%{_bindir},%{_mandir}/man1,%{_libdir}/R,%{_applnkdir}/Scientific/Numerics}
 297
 298 install %{SOURCE26} $RPM_BUILD_ROOT%{_applnkdir}/Scientific/Numerics/%{name}.desktop
 299
 300 mv doc/R.1 $RPM_BUILD_ROOT%{_mandir}/man1/
 301 sed "s,`pwd`,%{_libdir}/R,g" < bin/R > bin/R. ; mv bin/R. bin/R
 302 mv bin/R $RPM_BUILD_ROOT%{_bindir}/R
 303
 304 find . -name 'Makefile*' -exec rm -f {} \;
 305 rm -rf etc/*.old
 306
 307 cp -R AUTHORS afm bin doc etc include library modules share \
 308         $RPM_BUILD_ROOT%{_libdir}/R
 309
 310 %clean
 311 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 312
 313 %post base
 314 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 315  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 316
 317 #%preun base
 318 ## These files are not owned by any package, so we have to remove them
 319 ## but only if this is the last version of R-base on the system.
 320 ##
 321 #if [ "$1" = 0 ];
 322 #then
 323 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 324 #       rm -f %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 325 #fi
 326
 327 %post contrib
 328 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 329  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 330
 331 %postun contrib
 332 if [ -f ../bin/Rcmd ];then
 333 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 334  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 335 fi
 336
 337 %post recommended
 338 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 339  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 340
 341 %postun recommended
 342 if [ -f ../bin/Rcmd ];then
 343 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 344  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 345 fi
 346
 347 %post mlbench
 348 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 349  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 350
 351 %postun mlbench
 352 if [ -f ../bin/Rcmd ];then
 353 (cd %{_libdir}/R/library; umask 022; cat */CONTENTS > ../doc/html/search/index.txt
 354  R_HOME=%{_libdir}/R ../bin/Rcmd perl ../share/perl/build-help.pl --htmllist)
 355 fi
 356
 357 %files base
 358 %defattr(644,root,root,755)
 359 %{_mandir}/man1/R.1*
 360 %attr(755,root,root) %{_bindir}/R
 361 %dir %{_libdir}/R
 362 %{_libdir}/R/afm
 363 %attr(755,root,root) %{_libdir}/R/bin
 364 %{_libdir}/R/etc
 365 %{_libdir}/R/include
 366 %{_libdir}/R/share
 367 %{_libdir}/R/AUTHORS
 368 %dir %{_libdir}/R/library
 369 %{_libdir}/R/library/*.css
 370 %{_libdir}/R/library/base
 371 %{_libdir}/R/library/ctest
 372 %{_libdir}/R/library/eda
 373 %{_libdir}/R/library/lqs
 374 %{_libdir}/R/library/methods
 375 %{_libdir}/R/library/modreg
 376 %{_libdir}/R/library/mva
 377 %{_libdir}/R/library/nls
 378 %{_libdir}/R/library/splines
 379 %{_libdir}/R/library/stepfun
 380 %{_libdir}/R/library/tcltk
 381 %{_libdir}/R/library/tools
 382 %{_libdir}/R/library/ts
 383 %{_libdir}/R/modules
 384 %doc BUGS COPYRIGHTS FAQ NEWS README RESOURCES THANKS Y2K
 385 # %{_libdir}/R/doc %except %{_libdir}/R/doc/html/{packages.html,search/index.txt}
 386 %dir %{_libdir}/R/doc
 387 %{_libdir}/R/doc/[KRm]*
 388 %dir %{_libdir}/R/doc/html
 389 %{_libdir}/R/doc/html/*.css
 390 %{_libdir}/R/doc/html/[Ra-lr-u]*.html
 391 %{_libdir}/R/doc/html/packages-head.html
 392 %{_libdir}/R/doc/html/*.jpg
 393 %dir %{_libdir}/R/doc/html/search
 394 %{_libdir}/R/doc/html/search/[A-Z]*
 395 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/search/index.txt
 396 %ghost %{_libdir}/R/doc/html/packages.html
 397 %{_applnkdir}/Scientific/Numerics/*
 398
 399 %files recommended
 400 %defattr(644,root,root,755)
 401 %{_libdir}/R/library/MASS
 402 %{_libdir}/R/library/class
 403 %{_libdir}/R/library/nnet
 404 %{_libdir}/R/library/spatial
 405 %doc VR
 406 %{_libdir}/R/library/KernSmooth
 407 %doc KernSmooth
 408 %{_libdir}/R/library/boot
 409 %doc boot
 410 %{_libdir}/R/library/cluster
 411 %doc cluster
 412 %{_libdir}/R/library/foreign
 413 %doc foreign
 414 %{_libdir}/R/library/grid
 415 %doc grid
 416 %{_libdir}/R/library/lattice
 417 %doc lattice
 418 %{_libdir}/R/library/mgcv
 419 %doc mgcv
 420 %{_libdir}/R/library/nlme
 421 %doc nlme
 422 %{_libdir}/R/library/rpart
 423 %doc rpart
 424 %{_libdir}/R/library/survival
 425 %doc survival
 426
 427 %files contrib
 428 %defattr(644,root,root,755)
 429 %{_libdir}/R/library/acepack
 430 %doc acepack
 431 %{_libdir}/R/library/bootstrap
 432 %doc bootstrap
 433 %{_libdir}/R/library/date
 434 %doc date
 435 %{_libdir}/R/library/e1071
 436 %doc e1071
 437 %{_libdir}/R/library/fracdiff
 438 %doc fracdiff
 439 %{_libdir}/R/library/gee
 440 %doc gee
 441 %{_libdir}/R/library/leaps
 442 %doc leaps
 443 %{_libdir}/R/library/oz
 444 %doc oz
 445 %{_libdir}/R/library/polynom
 446 %doc polynom
 447 %{_libdir}/R/library/princurve
 448 %doc princurve
 449 %{_libdir}/R/library/quadprog
 450 %doc quadprog
 451 %{_libdir}/R/library/xgobi
 452 %doc xgobi
 453
 454 %files mlbench
 455 %defattr(644,root,root,755)
 456 %{_libdir}/R/library/mlbench
 457 %doc mlbench