python3-scipy.spec

   1 # TODO:
   2 # - atlas support
   3 # - tests
   4 #
   5 # Conditional build:
   6 %bcond_without  doc     # Sphinx documentation
   7
   8 %define         module  scipy
   9 Summary:        A library of scientific tools
  10 Summary(pl.UTF-8):      Biblioteka narzędzi naukowych
  11 Name:           python3-%{module}
  12 Version:        1.5.4
  13 Release:        2
  14 License:        BSD
  15 Group:          Development/Languages/Python
  16 #Source0Download: https://github.com/scipy/scipy/releases/
  17 Source0:        https://github.com/scipy/scipy/releases/download/v%{version}/%{module}-%{version}.tar.xz
  18 # Source0-md5:  d446ec7a6b0bc44484389ab7589eccf5
  19 Patch0:         numpy-deprecation-warnings.patch
  20 URL:            https://www.scipy.org/
  21 BuildRequires:  blas-devel >= 3.6.0
  22 BuildRequires:  f2py3 >= 1:1.14.5
  23 BuildRequires:  gcc-fortran
  24 BuildRequires:  lapack-devel >= 3.6.0
  25 BuildRequires:  python3 >= 1:3.6
  26 BuildRequires:  python3-devel >= 1:3.5
  27 BuildRequires:  python3-numpy >= 1:1.14.5
  28 BuildRequires:  python3-numpy-devel >= 1:1.14.5
  29 BuildRequires:  python3-pybind11 >= 2.4.3
  30 BuildRequires:  python3-setuptools
  31 BuildRequires:  rpmbuild(macros) >= 1.752
  32 BuildRequires:  tar >= 1:1.22
  33 BuildRequires:  xz
  34 %if %{with doc}
  35 BuildRequires:  pydoc3
  36 # matplotlib.sphinxext.plot_directive.__version__ >= 2
  37 BuildRequires:  python3-matplotlib >= 1.1.0
  38 BuildRequires:  sphinx-pdg-3 >= 2.0
  39 %endif
  40 Requires:       lapack >= 3.6.0
  41 Requires:       python3-modules >= 1:3.6
  42 Requires:       python3-numpy >= 1:1.14.5
  43 Suggests:       python3-pillow
  44 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  45
  46 %description
  47 SciPy is an open source library of scientific tools for Python. SciPy
  48 supplements the popular numpy module, gathering a variety of high
  49 level science and engineering modules together as a single package.
  50
  51 %description -l pl.UTF-8
  52 SciPy to biblioteka narzędzi naukowych z otwartymi źródłami dla
  53 Pythona. SciPy uzupełnia popularny moduł numpy, gromadząc razem
  54 wiele wysokopoziomowych modułów naukowych i inżynierskich w jeden
  55 pakiet.
  56
  57 %package apidocs
  58 Summary:        API documentation for SciPy module
  59 Summary(pl.UTF-8):      Dokumentacja API modułu SciPy
  60 Group:          Documentation
  61 BuildArch:      noarch
  62
  63 %description apidocs
  64 API documentation for SciPy module.
  65
  66 %description apidocs -l pl.UTF-8
  67 Dokumentacja API modułu SciPy.
  68
  69 %prep
  70 %setup -q -n scipy-%{version}
  71 %patch0 -p1
  72
  73 %build
  74 # numpy.distutils uses LDFLAGS as its own flags replacement,
  75 # instead of appending proper options (like -shared)
  76 CFLAGS="%{rpmcflags}"
  77 LDFLAGS="%{rpmldflags} -shared"
  78 export CFLAGS LDFLAGS
  79
  80 export BLAS=%{_libdir}
  81 export LAPACK=%{_libdir}
  82
  83 %py3_build
  84
  85 %if %{with doc}
  86 LANG=C \
  87 PYTHONPATH=$(readlink -f build-3/lib.*) \
  88 %{__make} -C doc html-build \
  89         SPHINXBUILD=sphinx-build-3
  90 %endif
  91
  92 %install
  93 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
  94
  95 export BLAS=%{_libdir}
  96 export LAPACK=%{_libdir}
  97
  98 %py3_install
  99
 100 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*.txt
 101 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/LICENSE
 102 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/LICENSE.md
 103 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/linalg/src/{id_dist/doc/doc.tex,lapack_deprecations/LICENSE}
 104 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/optimize/lbfgsb_src/README
 105 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/{dsolve/SuperLU/License.txt,eigen/arpack/ARPACK/COPYING}
 106 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/spatial/qhull_src/COPYING.txt
 107 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_test_deprecation_*.so
 108 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/tests
 109 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/*/tests
 110 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/*/*/tests
 111 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/*/*/*/tests
 112
 113 %clean
 114 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 115
 116 %files -n python3-%{module}
 117 %defattr(644,root,root,755)
 118 %doc INSTALL.rst.txt LICENSE.txt THANKS.txt doc/{API.rst.txt,README.md,ROADMAP.rst.txt}
 119 %dir %{py3_sitedir}/%{module}
 120 %{py3_sitedir}/%{module}/*.py
 121 %{py3_sitedir}/%{module}/__pycache__
 122 %{py3_sitedir}/%{module}/*.pxd
 123 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/_build_utils
 124 %{py3_sitedir}/%{module}/_build_utils/*.py
 125 %{py3_sitedir}/%{module}/_build_utils/__pycache__
 126 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/_lib
 127 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_ccallback_c.*.so
 128 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_fpumode.*.so
 129 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_test_ccallback.*.so
 130 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/messagestream.*.so
 131 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/*.py
 132 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/__pycache__
 133 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray
 134 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/_uarray.cpython-*.so
 135 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/*.py
 136 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/__pycache__
 137 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/cluster
 138 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/cluster/*.so
 139 %{py3_sitedir}/%{module}/cluster/*.py
 140 %{py3_sitedir}/%{module}/cluster/__pycache__
 141 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/constants
 142 %{py3_sitedir}/%{module}/constants/*.py
 143 %{py3_sitedir}/%{module}/constants/__pycache__
 144 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/fft
 145 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/*.py
 146 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/__pycache__
 147 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft
 148 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/pypocketfft.cpython-*.so
 149 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/*.py
 150 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/__pycache__
 151 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack
 152 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack/*.so
 153 %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack/*.py
 154 %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack/__pycache__
 155 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/integrate
 156 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/*.so
 157 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/*.py
 158 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/__pycache__
 159 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/_ivp
 160 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/_ivp/*.py
 161 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/_ivp/__pycache__
 162 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate
 163 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate/*.so
 164 %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate/*.py
 165 %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate/__pycache__
 166 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io
 167 %{py3_sitedir}/%{module}/io/*.py
 168 %{py3_sitedir}/%{module}/io/__pycache__
 169 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/io/*.so
 170 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io/arff
 171 %{py3_sitedir}/%{module}/io/arff/*.py
 172 %{py3_sitedir}/%{module}/io/arff/__pycache__
 173 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab
 174 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab/*.so
 175 %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab/*.py
 176 %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab/__pycache__
 177 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io/harwell_boeing
 178 %{py3_sitedir}/%{module}/io/harwell_boeing/*.py
 179 %{py3_sitedir}/%{module}/io/harwell_boeing/__pycache__
 180 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/linalg
 181 %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/*.pxd
 182 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/*.so
 183 %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/*.py
 184 %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/__pycache__
 185 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/misc
 186 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/ascent.dat
 187 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/ecg.dat
 188 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/face.dat
 189 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/*.py
 190 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/__pycache__
 191 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage
 192 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage/*.so
 193 %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage/*.py
 194 %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage/__pycache__
 195 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/odr
 196 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/odr/*.so
 197 %{py3_sitedir}/%{module}/odr/*.py
 198 %{py3_sitedir}/%{module}/odr/__pycache__
 199 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize
 200 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/*.so
 201 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/*.py
 202 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/__pycache__
 203 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq
 204 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq/*.so
 205 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq/*.py
 206 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq/__pycache__
 207 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_shgo_lib
 208 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_shgo_lib/*.py
 209 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_shgo_lib/__pycache__
 210 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_shgo_lib/sobol_vec.gz
 211 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib
 212 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib/*.so
 213 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib/*.py
 214 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib/__pycache__
 215 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trustregion_constr
 216 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trustregion_constr/*.py
 217 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trustregion_constr/__pycache__
 218 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize.pxd
 219 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize
 220 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/*.so
 221 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/*.py
 222 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/*.pxd
 223 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/__pycache__
 224 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/signal
 225 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/signal/*.so
 226 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/*.py
 227 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/__pycache__
 228 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/signal/windows
 229 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/windows/*.py
 230 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/windows/__pycache__
 231 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse
 232 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/*.so
 233 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/*.py
 234 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/__pycache__
 235 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg
 236 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/*.py
 237 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/__pycache__
 238 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph
 239 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph/*.py
 240 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph/__pycache__
 241 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph/*.so
 242 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve
 243 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve/*.so
 244 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve/*.py
 245 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve/__pycache__
 246 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen
 247 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/*.py
 248 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/__pycache__
 249 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack
 250 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack/*.so
 251 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack/*.py
 252 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack/__pycache__
 253 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/lobpcg
 254 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/lobpcg/*.py
 255 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/lobpcg/__pycache__
 256 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve
 257 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve/*.so
 258 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve/*.py
 259 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve/__pycache__
 260 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/spatial
 261 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/*.so
 262 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/*.py
 263 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/*.pyi
 264 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/__pycache__
 265 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform
 266 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform/*.py
 267 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform/__pycache__
 268 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/special
 269 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.so
 270 %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.pxd
 271 %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.py
 272 %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.pyi
 273 %{py3_sitedir}/%{module}/special/__pycache__
 274 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/special/_precompute
 275 %{py3_sitedir}/%{module}/special/_precompute/*.py
 276 %{py3_sitedir}/%{module}/special/_precompute/__pycache__
 277 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/stats
 278 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/stats/*.so
 279 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/*.py
 280 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/__pycache__
 281 %{py3_sitedir}/%{module}-%{version}-py*.egg-info
 282
 283 %if %{with doc}
 284 %files apidocs
 285 %defattr(644,root,root,755)
 286 %doc doc/build/html/{_images,_static,generated,tutorial,*.html,*.js}
 287 %endif