python3-scipy.spec

   1 # TODO:
   2 # - atlas support
   3 # - tests
   4 #
   5 # Conditional build:
   6 %bcond_without  doc     # Sphinx documentation
   7
   8 %define         module  scipy
   9 Summary:        A library of scientific tools
  10 Summary(pl.UTF-8):      Biblioteka narzędzi naukowych
  11 Name:           python3-%{module}
  12 Version:        1.7.3
  13 Release:        2
  14 License:        BSD
  15 Group:          Development/Languages/Python
  16 #Source0Download: https://github.com/scipy/scipy/releases/
  17 Source0:        https://github.com/scipy/scipy/releases/download/v%{version}/%{module}-%{version}.tar.xz
  18 # Source0-md5:  9e6a6ae20e68e99031229c430f966672
  19 Patch0:         numpy-deprecation-warnings.patch
  20 Patch1:         %{name}-cython3.patch
  21 URL:            https://www.scipy.org/
  22 BuildRequires:  blas-devel >= 3.6.0
  23 BuildRequires:  f2py3 >= 1:1.14.5
  24 BuildRequires:  gcc-fortran
  25 BuildRequires:  lapack-devel >= 3.6.0
  26 BuildRequires:  python3 >= 1:3.7
  27 BuildRequires:  python3-devel >= 1:3.7
  28 BuildRequires:  python3-numpy >= 1:1.16.5
  29 BuildRequires:  python3-numpy-devel >= 1:1.16.5
  30 BuildRequires:  python3-numpy-devel < 1:1.23
  31 BuildRequires:  python3-pybind11 >= 2.4.3
  32 BuildRequires:  python3-pythran >= 0.9.11
  33 BuildRequires:  python3-setuptools
  34 BuildRequires:  rpmbuild(macros) >= 1.752
  35 BuildRequires:  tar >= 1:1.22
  36 BuildRequires:  xz
  37 %if %{with doc}
  38 BuildRequires:  pydoc3
  39 # matplotlib.sphinxext.plot_directive.__version__ >= 2
  40 BuildRequires:  python3-matplotlib >= 1.1.0
  41 BuildRequires:  sphinx-pdg-3 >= 2.0
  42 %endif
  43 Requires:       lapack >= 3.6.0
  44 Requires:       python3-modules >= 1:3.7
  45 Requires:       python3-numpy >= 1:1.16.5
  46 Suggests:       python3-pillow
  47 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  48
  49 %description
  50 SciPy is an open source library of scientific tools for Python. SciPy
  51 supplements the popular numpy module, gathering a variety of high
  52 level science and engineering modules together as a single package.
  53
  54 %description -l pl.UTF-8
  55 SciPy to biblioteka narzędzi naukowych z otwartymi źródłami dla
  56 Pythona. SciPy uzupełnia popularny moduł numpy, gromadząc razem
  57 wiele wysokopoziomowych modułów naukowych i inżynierskich w jeden
  58 pakiet.
  59
  60 %package apidocs
  61 Summary:        API documentation for SciPy module
  62 Summary(pl.UTF-8):      Dokumentacja API modułu SciPy
  63 Group:          Documentation
  64 BuildArch:      noarch
  65
  66 %description apidocs
  67 API documentation for SciPy module.
  68
  69 %description apidocs -l pl.UTF-8
  70 Dokumentacja API modułu SciPy.
  71
  72 %prep
  73 %setup -q -n scipy-%{version}
  74 %patch0 -p1
  75 %patch1 -p1
  76
  77 %build
  78 # numpy.distutils uses LDFLAGS as its own flags replacement,
  79 # instead of appending proper options (like -shared)
  80 CFLAGS="%{rpmcflags}"
  81 LDFLAGS="%{rpmldflags} -shared"
  82 export CFLAGS LDFLAGS
  83
  84 export BLAS=%{_libdir}
  85 export LAPACK=%{_libdir}
  86
  87 %py3_build
  88
  89 %if %{with doc}
  90 LANG=C \
  91 PYTHONPATH=$(readlink -f build-3/lib.*) \
  92 %{__make} -C doc html-build \
  93         SPHINXBUILD=sphinx-build-3
  94 %endif
  95
  96 %install
  97 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
  98
  99 export BLAS=%{_libdir}
 100 export LAPACK=%{_libdir}
 101
 102 %py3_install
 103
 104 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*.txt
 105 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/LICENSE
 106 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/LICENSE.md
 107 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/linalg/src/{id_dist/doc/doc.tex,lapack_deprecations/LICENSE}
 108 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/optimize/lbfgsb_src/README
 109 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/{dsolve/SuperLU/License.txt,eigen/arpack/ARPACK/COPYING}
 110 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/spatial/qhull_src/COPYING.txt
 111 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_test_deprecation_*.so
 112 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/tests
 113 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/*/tests
 114 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/*/*/tests
 115 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/*/*/*/tests
 116
 117 %clean
 118 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 119
 120 %files -n python3-%{module}
 121 %defattr(644,root,root,755)
 122 %doc INSTALL.rst.txt LICENSE.txt README.rst doc/{API.rst.txt,ROADMAP.rst.txt}
 123 %dir %{py3_sitedir}/%{module}
 124 %{py3_sitedir}/%{module}/*.py
 125 %{py3_sitedir}/%{module}/__pycache__
 126 %{py3_sitedir}/%{module}/*.pxd
 127 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/_build_utils
 128 %{py3_sitedir}/%{module}/_build_utils/*.py
 129 %{py3_sitedir}/%{module}/_build_utils/__pycache__
 130 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/_lib
 131 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_ccallback_c.*.so
 132 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_fpumode.*.so
 133 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_test_ccallback.*.so
 134 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/messagestream.*.so
 135 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/*.py
 136 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/__pycache__
 137 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray
 138 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/_uarray.cpython-*.so
 139 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/*.py
 140 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/__pycache__
 141 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/cluster
 142 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/cluster/*.so
 143 %{py3_sitedir}/%{module}/cluster/*.py
 144 %{py3_sitedir}/%{module}/cluster/__pycache__
 145 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/constants
 146 %{py3_sitedir}/%{module}/constants/*.py
 147 %{py3_sitedir}/%{module}/constants/__pycache__
 148 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/fft
 149 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/*.py
 150 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/__pycache__
 151 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft
 152 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/pypocketfft.cpython-*.so
 153 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/*.py
 154 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/__pycache__
 155 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack
 156 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack/*.so
 157 %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack/*.py
 158 %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack/__pycache__
 159 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/integrate
 160 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/*.so
 161 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/*.py
 162 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/__pycache__
 163 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/_ivp
 164 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/_ivp/*.py
 165 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/_ivp/__pycache__
 166 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate
 167 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate/*.so
 168 %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate/*.py
 169 %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate/__pycache__
 170 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io
 171 %{py3_sitedir}/%{module}/io/*.py
 172 %{py3_sitedir}/%{module}/io/__pycache__
 173 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/io/*.so
 174 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io/arff
 175 %{py3_sitedir}/%{module}/io/arff/*.py
 176 %{py3_sitedir}/%{module}/io/arff/__pycache__
 177 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab
 178 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab/*.so
 179 %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab/*.py
 180 %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab/__pycache__
 181 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io/harwell_boeing
 182 %{py3_sitedir}/%{module}/io/harwell_boeing/*.py
 183 %{py3_sitedir}/%{module}/io/harwell_boeing/__pycache__
 184 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/linalg
 185 %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/*.pxd
 186 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/*.so
 187 %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/*.py
 188 %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/__pycache__
 189 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/misc
 190 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/ascent.dat
 191 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/ecg.dat
 192 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/face.dat
 193 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/*.py
 194 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/__pycache__
 195 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage
 196 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage/*.so
 197 %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage/*.py
 198 %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage/__pycache__
 199 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/odr
 200 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/odr/*.so
 201 %{py3_sitedir}/%{module}/odr/*.py
 202 %{py3_sitedir}/%{module}/odr/__pycache__
 203 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize
 204 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/*.so
 205 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/*.py
 206 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/*.pyi
 207 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/__pycache__
 208 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_highs
 209 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_highs/*.so
 210 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_highs/*.py
 211 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_highs/__pycache__
 212 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_highs/cython
 213 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq
 214 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq/*.so
 215 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq/*.py
 216 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq/__pycache__
 217 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_shgo_lib
 218 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_shgo_lib/*.py
 219 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_shgo_lib/__pycache__
 220 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib
 221 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib/*.so
 222 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib/*.py
 223 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib/__pycache__
 224 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trustregion_constr
 225 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trustregion_constr/*.py
 226 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trustregion_constr/__pycache__
 227 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize.pxd
 228 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize
 229 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/*.so
 230 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/*.py
 231 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/*.pxd
 232 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/__pycache__
 233 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/signal
 234 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/signal/*.so
 235 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/*.py
 236 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/__pycache__
 237 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/signal/windows
 238 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/windows/*.py
 239 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/windows/__pycache__
 240 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse
 241 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/*.so
 242 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/*.py
 243 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/__pycache__
 244 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg
 245 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/*.py
 246 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/__pycache__
 247 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph
 248 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph/*.py
 249 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph/__pycache__
 250 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph/*.so
 251 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve
 252 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve/*.so
 253 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve/*.py
 254 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve/__pycache__
 255 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen
 256 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/*.py
 257 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/__pycache__
 258 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack
 259 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack/*.so
 260 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack/*.py
 261 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack/__pycache__
 262 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/lobpcg
 263 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/lobpcg/*.py
 264 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/lobpcg/__pycache__
 265 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve
 266 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve/*.so
 267 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve/*.py
 268 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve/__pycache__
 269 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/spatial
 270 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/*.so
 271 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/*.py
 272 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/*.pyi
 273 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/__pycache__
 274 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform
 275 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform/*.so
 276 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform/*.py
 277 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform/*.pyi
 278 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform/__pycache__
 279 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/special
 280 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.so
 281 %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.pxd
 282 %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.py
 283 %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.pyi
 284 %{py3_sitedir}/%{module}/special/__pycache__
 285 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/special/_precompute
 286 %{py3_sitedir}/%{module}/special/_precompute/*.py
 287 %{py3_sitedir}/%{module}/special/_precompute/__pycache__
 288 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/stats
 289 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/stats/*.so
 290 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/*.py
 291 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/*.pyi
 292 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/*.pxd
 293 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/_sobol_direction_numbers.npz
 294 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/__pycache__
 295 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/stats/_boost
 296 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/stats/_boost/*.so
 297 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/_boost/*.py
 298 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/_boost/__pycache__
 299 %{py3_sitedir}/%{module}-%{version}-py*.egg-info
 300
 301 %if %{with doc}
 302 %files apidocs
 303 %defattr(644,root,root,755)
 304 %doc doc/build/html/{_images,_static,generated,tutorial,*.html,*.js}
 305 %endif