python3-scipy.spec

   1 # TODO:
   2 # - atlas support
   3 # - tests
   4 #
   5 # Conditional build:
   6 %bcond_without  doc     # Sphinx documentation
   7
   8 %define         module  scipy
   9 Summary:        A library of scientific tools
  10 Summary(pl.UTF-8):      Biblioteka narzędzi naukowych
  11 Name:           python3-%{module}
  12 Version:        1.7.3
  13 Release:        1
  14 License:        BSD
  15 Group:          Development/Languages/Python
  16 #Source0Download: https://github.com/scipy/scipy/releases/
  17 Source0:        https://github.com/scipy/scipy/releases/download/v%{version}/%{module}-%{version}.tar.xz
  18 # Source0-md5:  9e6a6ae20e68e99031229c430f966672
  19 Patch0:         numpy-deprecation-warnings.patch
  20 Patch1:         %{name}-cython3.patch
  21 URL:            https://www.scipy.org/
  22 BuildRequires:  blas-devel >= 3.6.0
  23 BuildRequires:  f2py3 >= 1:1.14.5
  24 BuildRequires:  gcc-fortran
  25 BuildRequires:  lapack-devel >= 3.6.0
  26 BuildRequires:  python3 >= 1:3.6
  27 BuildRequires:  python3-devel >= 1:3.5
  28 BuildRequires:  python3-numpy >= 1:1.14.5
  29 BuildRequires:  python3-numpy-devel >= 1:1.14.5
  30 BuildRequires:  python3-pybind11 >= 2.4.3
  31 BuildRequires:  python3-setuptools
  32 BuildRequires:  rpmbuild(macros) >= 1.752
  33 BuildRequires:  tar >= 1:1.22
  34 BuildRequires:  xz
  35 %if %{with doc}
  36 BuildRequires:  pydoc3
  37 # matplotlib.sphinxext.plot_directive.__version__ >= 2
  38 BuildRequires:  python3-matplotlib >= 1.1.0
  39 BuildRequires:  sphinx-pdg-3 >= 2.0
  40 %endif
  41 Requires:       lapack >= 3.6.0
  42 Requires:       python3-modules >= 1:3.6
  43 Requires:       python3-numpy >= 1:1.14.5
  44 Suggests:       python3-pillow
  45 BuildRoot:      %{tmpdir}/%{name}-%{version}-root-%(id -u -n)
  46
  47 %description
  48 SciPy is an open source library of scientific tools for Python. SciPy
  49 supplements the popular numpy module, gathering a variety of high
  50 level science and engineering modules together as a single package.
  51
  52 %description -l pl.UTF-8
  53 SciPy to biblioteka narzędzi naukowych z otwartymi źródłami dla
  54 Pythona. SciPy uzupełnia popularny moduł numpy, gromadząc razem
  55 wiele wysokopoziomowych modułów naukowych i inżynierskich w jeden
  56 pakiet.
  57
  58 %package apidocs
  59 Summary:        API documentation for SciPy module
  60 Summary(pl.UTF-8):      Dokumentacja API modułu SciPy
  61 Group:          Documentation
  62 BuildArch:      noarch
  63
  64 %description apidocs
  65 API documentation for SciPy module.
  66
  67 %description apidocs -l pl.UTF-8
  68 Dokumentacja API modułu SciPy.
  69
  70 %prep
  71 %setup -q -n scipy-%{version}
  72 %patch0 -p1
  73 %patch1 -p1
  74
  75 %build
  76 # numpy.distutils uses LDFLAGS as its own flags replacement,
  77 # instead of appending proper options (like -shared)
  78 CFLAGS="%{rpmcflags}"
  79 LDFLAGS="%{rpmldflags} -shared"
  80 export CFLAGS LDFLAGS
  81
  82 export BLAS=%{_libdir}
  83 export LAPACK=%{_libdir}
  84
  85 %py3_build
  86
  87 %if %{with doc}
  88 LANG=C \
  89 PYTHONPATH=$(readlink -f build-3/lib.*) \
  90 %{__make} -C doc html-build \
  91         SPHINXBUILD=sphinx-build-3
  92 %endif
  93
  94 %install
  95 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
  96
  97 export BLAS=%{_libdir}
  98 export LAPACK=%{_libdir}
  99
 100 %py3_install
 101
 102 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*.txt
 103 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/LICENSE
 104 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/LICENSE.md
 105 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/linalg/src/{id_dist/doc/doc.tex,lapack_deprecations/LICENSE}
 106 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/optimize/lbfgsb_src/README
 107 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/{dsolve/SuperLU/License.txt,eigen/arpack/ARPACK/COPYING}
 108 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/spatial/qhull_src/COPYING.txt
 109 %{__rm} $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_test_deprecation_*.so
 110 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/tests
 111 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/*/tests
 112 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/*/*/tests
 113 %{__rm} -r $RPM_BUILD_ROOT%{py3_sitedir}/%{module}/*/*/*/*/tests
 114
 115 %clean
 116 rm -rf $RPM_BUILD_ROOT
 117
 118 %files -n python3-%{module}
 119 %defattr(644,root,root,755)
 120 %doc INSTALL.rst.txt LICENSE.txt README.rst doc/{API.rst.txt,ROADMAP.rst.txt}
 121 %dir %{py3_sitedir}/%{module}
 122 %{py3_sitedir}/%{module}/*.py
 123 %{py3_sitedir}/%{module}/__pycache__
 124 %{py3_sitedir}/%{module}/*.pxd
 125 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/_build_utils
 126 %{py3_sitedir}/%{module}/_build_utils/*.py
 127 %{py3_sitedir}/%{module}/_build_utils/__pycache__
 128 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/_lib
 129 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_ccallback_c.*.so
 130 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_fpumode.*.so
 131 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_test_ccallback.*.so
 132 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/messagestream.*.so
 133 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/*.py
 134 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/__pycache__
 135 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray
 136 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/_uarray.cpython-*.so
 137 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/*.py
 138 %{py3_sitedir}/%{module}/_lib/_uarray/__pycache__
 139 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/cluster
 140 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/cluster/*.so
 141 %{py3_sitedir}/%{module}/cluster/*.py
 142 %{py3_sitedir}/%{module}/cluster/__pycache__
 143 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/constants
 144 %{py3_sitedir}/%{module}/constants/*.py
 145 %{py3_sitedir}/%{module}/constants/__pycache__
 146 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/fft
 147 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/*.py
 148 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/__pycache__
 149 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft
 150 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/pypocketfft.cpython-*.so
 151 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/*.py
 152 %{py3_sitedir}/%{module}/fft/_pocketfft/__pycache__
 153 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack
 154 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack/*.so
 155 %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack/*.py
 156 %{py3_sitedir}/%{module}/fftpack/__pycache__
 157 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/integrate
 158 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/*.so
 159 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/*.py
 160 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/__pycache__
 161 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/_ivp
 162 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/_ivp/*.py
 163 %{py3_sitedir}/%{module}/integrate/_ivp/__pycache__
 164 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate
 165 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate/*.so
 166 %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate/*.py
 167 %{py3_sitedir}/%{module}/interpolate/__pycache__
 168 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io
 169 %{py3_sitedir}/%{module}/io/*.py
 170 %{py3_sitedir}/%{module}/io/__pycache__
 171 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/io/*.so
 172 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io/arff
 173 %{py3_sitedir}/%{module}/io/arff/*.py
 174 %{py3_sitedir}/%{module}/io/arff/__pycache__
 175 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab
 176 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab/*.so
 177 %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab/*.py
 178 %{py3_sitedir}/%{module}/io/matlab/__pycache__
 179 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/io/harwell_boeing
 180 %{py3_sitedir}/%{module}/io/harwell_boeing/*.py
 181 %{py3_sitedir}/%{module}/io/harwell_boeing/__pycache__
 182 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/linalg
 183 %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/*.pxd
 184 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/*.so
 185 %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/*.py
 186 %{py3_sitedir}/%{module}/linalg/__pycache__
 187 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/misc
 188 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/ascent.dat
 189 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/ecg.dat
 190 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/face.dat
 191 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/*.py
 192 %{py3_sitedir}/%{module}/misc/__pycache__
 193 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage
 194 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage/*.so
 195 %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage/*.py
 196 %{py3_sitedir}/%{module}/ndimage/__pycache__
 197 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/odr
 198 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/odr/*.so
 199 %{py3_sitedir}/%{module}/odr/*.py
 200 %{py3_sitedir}/%{module}/odr/__pycache__
 201 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize
 202 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/*.so
 203 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/*.py
 204 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/*.pyi
 205 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/__pycache__
 206 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_highs
 207 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_highs/*.so
 208 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_highs/*.py
 209 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_highs/__pycache__
 210 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_highs/cython
 211 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq
 212 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq/*.so
 213 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq/*.py
 214 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_lsq/__pycache__
 215 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_shgo_lib
 216 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_shgo_lib/*.py
 217 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_shgo_lib/__pycache__
 218 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib
 219 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib/*.so
 220 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib/*.py
 221 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trlib/__pycache__
 222 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trustregion_constr
 223 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trustregion_constr/*.py
 224 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/_trustregion_constr/__pycache__
 225 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize.pxd
 226 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize
 227 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/*.so
 228 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/*.py
 229 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/*.pxd
 230 %{py3_sitedir}/%{module}/optimize/cython_optimize/__pycache__
 231 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/signal
 232 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/signal/*.so
 233 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/*.py
 234 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/__pycache__
 235 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/signal/windows
 236 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/windows/*.py
 237 %{py3_sitedir}/%{module}/signal/windows/__pycache__
 238 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse
 239 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/*.so
 240 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/*.py
 241 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/__pycache__
 242 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg
 243 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/*.py
 244 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/__pycache__
 245 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph
 246 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph/*.py
 247 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph/__pycache__
 248 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/csgraph/*.so
 249 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve
 250 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve/*.so
 251 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve/*.py
 252 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/dsolve/__pycache__
 253 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen
 254 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/*.py
 255 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/__pycache__
 256 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack
 257 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack/*.so
 258 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack/*.py
 259 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/arpack/__pycache__
 260 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/lobpcg
 261 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/lobpcg/*.py
 262 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/eigen/lobpcg/__pycache__
 263 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve
 264 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve/*.so
 265 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve/*.py
 266 %{py3_sitedir}/%{module}/sparse/linalg/isolve/__pycache__
 267 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/spatial
 268 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/*.so
 269 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/*.py
 270 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/*.pyi
 271 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/__pycache__
 272 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform
 273 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform/*.so
 274 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform/*.py
 275 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform/*.pyi
 276 %{py3_sitedir}/%{module}/spatial/transform/__pycache__
 277 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/special
 278 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.so
 279 %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.pxd
 280 %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.py
 281 %{py3_sitedir}/%{module}/special/*.pyi
 282 %{py3_sitedir}/%{module}/special/__pycache__
 283 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/special/_precompute
 284 %{py3_sitedir}/%{module}/special/_precompute/*.py
 285 %{py3_sitedir}/%{module}/special/_precompute/__pycache__
 286 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/stats
 287 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/stats/*.so
 288 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/*.py
 289 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/*.pyi
 290 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/*.pxd
 291 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/_sobol_direction_numbers.npz
 292 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/__pycache__
 293 %dir %{py3_sitedir}/%{module}/stats/_boost
 294 %attr(755,root,root) %{py3_sitedir}/%{module}/stats/_boost/*.so
 295 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/_boost/*.py
 296 %{py3_sitedir}/%{module}/stats/_boost/__pycache__
 297 %{py3_sitedir}/%{module}-%{version}-py*.egg-info
 298
 299 %if %{with doc}
 300 %files apidocs
 301 %defattr(644,root,root,755)
 302 %doc doc/build/html/{_images,_static,generated,tutorial,*.html,*.js}
 303 %endif